| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略语/符号说明 | 第10-11页 |
| 一、前言 | 第11-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-18页 |
| 1.1.1 问题的提出 | 第11-12页 |
| 1.1.2 miRNA概述 | 第12-14页 |
| 1.1.3 miRNA靶基因概述 | 第14-16页 |
| 1.1.4 miRNA与疾病 | 第16-17页 |
| 1.1.5 miRNA靶基因调控网络 | 第17-18页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第18页 |
| 1.3 研究内容和方法 | 第18-19页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第19页 |
| 1.5 论文创新点 | 第19-20页 |
| 二、数据和方法 | 第20-31页 |
| 2.1 数据库及工具介绍 | 第20-26页 |
| 2.1.1 基础数据库 | 第20-21页 |
| 2.1.2 靶基因预测工具 | 第21-23页 |
| 2.1.3 已验证靶基因收集数据库 | 第23-24页 |
| 2.1.4 GO注释数据分析与整理 | 第24-25页 |
| 2.1.5 工具 | 第25-26页 |
| 2.2 靶基因优选算法设计 | 第26-31页 |
| 2.2.1 基于基因功能相似性的靶基因优选 | 第26-28页 |
| 2.2.2 基于多来源数据的靶基因优选 | 第28-29页 |
| 2.2.3 数据整合 | 第29-30页 |
| 2.2.4 ROC曲线意义及绘制 | 第30页 |
| 2.2.5 网络构建 | 第30-31页 |
| 三、结果 | 第31-46页 |
| 3.1 数据整理结果 | 第31页 |
| 3.2 靶基因优选 | 第31-39页 |
| 3.2.1 miRNA靶基因功能相似性分析 | 第31-33页 |
| 3.2.2 权重分析 | 第33-34页 |
| 3.2.3 三步优选的结果对比 | 第34页 |
| 3.2.4 靶基因的优选阈值选取 | 第34-35页 |
| 3.2.5 性能验证 | 第35-37页 |
| 3.2.6 与现有靶基因预测工具比较 | 第37-38页 |
| 3.2.7 多种靶基因优选方法比较 | 第38-39页 |
| 3.3 网络构建与分析 | 第39-46页 |
| 3.3.1 miRNA与药物成瘾的调控网络 | 第39-40页 |
| 3.3.2 尼古丁成瘾中miRNA-靶基因调控网络 | 第40-42页 |
| 3.3.3 与尼古丁成瘾相关的mi RNA靶基因功能分析 | 第42-46页 |
| 四、讨论 | 第46-49页 |
| 4.1 基因功能相似性优选靶基因 | 第46页 |
| 4.2 靶基因预测算法性能分析 | 第46-47页 |
| 4.3 已证实的靶基因增加对本方法的影响 | 第47页 |
| 4.4 TarpriGO方法的局限 | 第47页 |
| 4.5 miRNA靶基因调控网络的构建 | 第47-49页 |
| 五、总结与展望 | 第49-50页 |
| 5.1 总结 | 第49页 |
| 5.2 工作展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第56-57页 |
| 附录 | 第57-64页 |
| 综述 microRNA及其靶基因的分析 | 第64-80页 |
| 综述参考文献 | 第74-80页 |
| 致谢 | 第80页 |