单克隆抗体N连接型糖基化的动态图建模及仿真平台开发
| 学位论文数据集 | 第3-4页 |
| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 论文研究背景 | 第12-13页 |
| 1.2 糖基化反应数学模型研究现状 | 第13-15页 |
| 1.3 系统生物学工具研究现状 | 第15-16页 |
| 1.4 课题来源 | 第16-17页 |
| 1.5 论文结构与内容 | 第17-18页 |
| 第二章 N连接型糖基化反应的数学模型概述 | 第18-28页 |
| 2.1 N连接型糖基化的反应机理 | 第18-22页 |
| 2.1.1 高尔基体结构 | 第19-20页 |
| 2.1.2 糖基化反应网络 | 第20-22页 |
| 2.1.3 糖基化反应催化酶的空间分布 | 第22页 |
| 2.2 N连接型糖基化反应的模型参数 | 第22-26页 |
| 2.2.1 糖蛋白转运速率 | 第22-23页 |
| 2.2.2 糖蛋白合成产量 | 第23-24页 |
| 2.2.3 高尔基体膜囊体积 | 第24页 |
| 2.2.4 酶的空间分布 | 第24-25页 |
| 2.2.5 表观解离常数 | 第25页 |
| 2.2.6 表观最大反应速率 | 第25-26页 |
| 2.3 小结 | 第26-28页 |
| 第三章 基于图论的N连接型糖基化反应的动态模型 | 第28-52页 |
| 3.1 基于图论的N连接型糖基化反应网络 | 第28-42页 |
| 3.1.1 N连接糖型结构 | 第30-33页 |
| 3.1.2 N连接型糖基化反应网络 | 第33-34页 |
| 3.1.3 N连接型糖基化反应规则表 | 第34-38页 |
| 3.1.4 N连接型糖基化反应网络的生成算法 | 第38-42页 |
| 3.2 N连接型糖基化反应的动态模型 | 第42-50页 |
| 3.2.1 糖蛋白转运过程 | 第42-44页 |
| 3.2.2 N连接型糖基化反应过程 | 第44-50页 |
| 3.3 小结 | 第50-52页 |
| 第四章 N连接型糖基化反应仿真平台 | 第52-76页 |
| 4.1 N连接型糖基化反应仿真平台设计 | 第52-63页 |
| 4.1.1 规则选择与网络生成模块 | 第53-56页 |
| 4.1.2 网络可视化与搜索模块 | 第56-58页 |
| 4.1.3 参数设定模块 | 第58-59页 |
| 4.1.4 微分方程计算模块 | 第59-61页 |
| 4.1.5 在线式遗传算法模块 | 第61-63页 |
| 4.2 基于糖基化反应仿真平台的模拟实验 | 第63-74页 |
| 4.2.1 糖基化反应仿真平台的基本操作 | 第63-70页 |
| 4.2.2 催化酶影响的量化分析 | 第70-74页 |
| 4.3 小结 | 第74-76页 |
| 第五章 总结与展望 | 第76-78页 |
| 5.1 总结 | 第76-77页 |
| 5.2 展望 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-82页 |
| 致谢 | 第82-84页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第84-86页 |
| 作者及导师简介 | 第86-88页 |
| 附件 | 第88-89页 |
