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龙眼体胚发生过程中若干PCD相关基因的克隆及表达

摘要第1-14页
Abstract第14-18页
第一章 引言第18-28页
 1 植物体胚发生第18-20页
   ·植物体胚发生的研究进展第18-19页
   ·植物体细胞胚发生过程中基因表达的研究进展第19-20页
 2. 龙眼体胚发生过程中的细胞程序性死亡第20页
 3 植物细胞程序性死亡第20-26页
   ·植物细胞程序性死亡的途径第21页
   ·植物细胞程序性死亡相关蛋白第21-26页
 4 本研究意义及主要内容第26-28页
   ·本研究意义第26-27页
   ·主要研究内容第27-28页
第二章 龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因CP、COXVb 和Caspase 的cDNA 克隆第28-64页
 第一节 龙眼胚性愈伤组织总RNA 的提取第28-30页
  1 材料与方法第28-29页
   ·材料第28-29页
  2 结果与分析第29-30页
 第二节 龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因CP cDNA 克隆第30-43页
  1 材料与方法第31-36页
   ·材料第31页
   ·方法第31-36页
  2 结果与分析第36-42页
   ·龙眼胚性愈伤组织CP cDNA 保守区的克隆第36-37页
   ·龙眼胚性愈伤组织CP 的cDNA 的3′RACE 克隆结果第37-38页
   ·龙眼胚性愈伤组织 CP 的 cDNA 的 5' RACE 克隆结果第38-39页
   ·龙眼胚性愈伤组织CP 基因全长序列拼接结果第39-40页
   ·龙眼胚性愈伤组织CP 基因序列分析第40-42页
  3 讨论第42-43页
   ·克隆龙眼胚性愈伤组织CP 基因的难点分析第42页
   ·龙眼胚性愈伤组织CP 可能是papain 蛋白家族成员第42-43页
 第三节 龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因COXVb cDNA 克隆第43-52页
  1 材料与方法第43-47页
   ·材料第43页
   ·方法第43-47页
  2 结果与分析第47-52页
   ·龙眼胚性愈伤组织 COX Vb 的 cDNA 的保守区的克隆第47-48页
   ·龙眼胚性愈伤组织 COX Vb 基因 cDNA 的 5' RACE 的克隆第48-49页
   ·龙眼 EC 中 COX Vb 基因 cDNA 全长序列拼接第49-50页
   ·龙眼胚性愈伤组织中COX Vb 基因序列分析第50-52页
  3 讨论第52页
 第四节 龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因Caspase cDNA 克隆第52-64页
  1 材料与方法第53-57页
   ·材料第53页
   ·方法第53-57页
  2 结果与分析第57-62页
   ·龙眼胚性愈伤组织Caspase 的cDNA 的保守区的克隆第57-58页
   ·龙眼胚性愈伤组织 Caspase 的 cDNA 的 3' RACE 的克隆第58-59页
   ·龙眼胚性愈伤组织 Caspase 基因 cDNA 的 5' RACE 的克隆第59-60页
   ·龙眼EC 中Caspase 基因cDNA 全长序列拼接第60-61页
   ·龙眼胚性愈伤组织中Caspase 基因序列分析第61-62页
  3 讨论第62-64页
   ·龙眼Caspase 和Caspase 家族的关系第62-63页
   ·关于Caspase 与龙眼体胚发生过程中褐变的关系第63-64页
第三章 龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因的生物信息学分析第64-98页
 第一节 龙眼体胚发生过程中 PCD 相关基因 CP 生物信息学分析第64-76页
  1. 材料与方法第64-65页
   ·材料第64页
   ·方法第64-65页
  2 结果与分析第65-74页
   ·CP 蛋白质理化性质预测与分析第65-68页
   ·同源蛋白质家族比较分析第68-69页
   ·龙眼CP 信号肽的预测和分析第69-70页
   ·龙眼CP 蛋白的跨膜结构预测与分析第70-71页
   ·龙眼CP 蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第71页
   ·龙眼CP 蛋白质二级结构预测与分析第71-72页
   ·龙眼CP 磷酸化位点预测与分析第72-73页
   ·龙眼CP 其他功能点预测和分析第73页
   ·龙眼CP 蛋白三维结构的预测和分析第73-74页
  3 讨论第74-76页
   ·生物信息学推测龙眼CP 蛋白的功能第74-75页
   ·龙眼 CP 蛋白信号肽第75页
   ·生物信息学推测龙眼CP 蛋白参与调控细胞衰老和死亡的机制第75-76页
 第二节 龙眼胚性愈伤组织 COXVb cDNA 生物信息学分析第76-86页
  1. 材料与方法第76-77页
   ·材料第76页
   ·方法第76-77页
  2 结果与分析第77-84页
   ·COXVb 蛋白质理化性质预测与分析第77-79页
   ·同源蛋白质家族比较分析第79-80页
   ·龙眼COXVb 信号肽的预测和分析第80页
   ·龙眼COXVb 蛋白的跨膜结构预测与分析第80-81页
   ·龙眼COXVb 蛋白卷曲螺旋结构的预测和分析第81-82页
   ·龙眼COXVb 蛋白质二级结构预测与分析第82页
   ·龙眼COXVb 磷酸化位点预测与分析第82-83页
   ·龙眼COXVb 保守结构域与功能域分析第83-84页
   ·龙眼COXVb 其他功能点预测和分析第84页
   ·龙眼COXVb 三维结构的预测和分析第84页
  3 讨论第84-86页
   ·生物信息学分析龙眼COXVb 蛋白的作用第84-85页
   ·生物信息学分析龙眼COXVb 对PCD 的调控机制第85-86页
 第三节 龙眼胚性愈伤组织Caspase 基因cDNA 生物信息学分析第86-98页
  1. 材料与方法第86-87页
   ·材料第86页
   ·方法第86-87页
  2 结果与分析第87-95页
   ·Caspase 蛋白质理化性质预测与分析第87-89页
   ·同源蛋白质家族比较分析第89-90页
   ·龙眼Caspase 蛋白信号肽的预测和分析第90-91页
   ·龙眼Caspase 蛋白的跨膜结构预测与分析第91页
   ·龙眼Caspase 蛋白卷曲螺旋结构的预测与分析第91-92页
   ·龙眼Caspase 蛋白二级结构预测与分析第92-93页
   ·龙眼Caspase 蛋白磷酸化位点预测与分析第93-94页
   ·龙眼蛋白Caspase 蛋白保守结构域分析第94页
   ·龙眼Caspase 其他功能点预测和分析第94-95页
   ·龙眼Caspase 蛋白三维结构的预测和分析第95页
  3 讨论第95-98页
   ·龙眼 Caspase 蛋白与 caspase 家族的关系第95-96页
   ·生物信息学准确性和龙眼Caspase 蛋白亚细胞定位第96页
   ·龙眼Caspase 蛋白活化途径第96-98页
第四章 龙眼体胚发生过程中 CP、COX Vb 和 Caspase 基因表的荧光定量 PCR 分析第98-118页
 第一节 龙眼体胚发生相关基因 CP 荧光定量 PCR 表达分析第99-107页
  1 材料和方法第99-102页
   ·材料第99页
   ·主要试剂和仪器第99页
   ·方法第99-102页
  2 结果与分析第102-106页
   ·龙眼体胚发生过程中不同阶段胚性培养物材料的获得第102-103页
   ·龙眼体胚发生不同阶段培养物总 RNA 提取第103页
   ·荧光实时PCR 扩增参照基因和CP 基因的参数分析第103-105页
   ·龙眼体胚发生过程中CP 基因相对定量表达分析第105-106页
  3 讨论第106-107页
   ·CP 在龙眼体胚发生过程中的作用第106页
   ·CP 在龙眼体胚的成熟胚中可能有同工酶基因表达第106-107页
 第二节 龙眼体胚发生相关基因 COXVb 表达分析第107-112页
  1 材料和方法第107-109页
   ·材料第107页
   ·主要试剂和仪器第107页
   ·方法第107-109页
  2 结果与分析第109-111页
   ·荧光实时PCR 扩增参照基因和COXVb 基因的参数分析第109-111页
   ·龙眼体胚发生过程中COXVb 基因相对定量表达分析第111页
  3 讨论第111-112页
 第三节 龙眼体胚发生相关基因 Caspase 表达分析第112-118页
  1 材料和方法第112-114页
   ·材料第112页
   ·主要试剂和仪器第112页
   ·方法第112-114页
  2 结果与分析第114-116页
   ·荧光实时PCR 扩增参照基因和Caspase 基因的参数分析第114-115页
   ·龙眼体胚发生过程中Caspase 基因相对定量表达分析第115-116页
  3 讨论第116-118页
   ·Caspase 在龙眼体胚发生过程中的作用第116-117页
   ·COX Vb、Caspase 和植物PCD 的关系第117-118页
第五章 小结第118-121页
 1 本研究的主要结论第118-121页
   ·龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因CP第118页
   ·龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因COXVb第118-119页
   ·龙眼体胚发生过程中PCD 相关基因Caspase第119-121页
参考文献第121-126页
附录第126-132页
 附录1 龙眼CP 基因(cDNA)序列登录GenBank 信息第126-128页
 附录2 龙眼COXVb 基因(cDNA)序列登录GenBank 信息第128-130页
 附录3 龙眼Caspase 基因(cDNA)序列登录GenBank 信息第130-132页
致谢第132页

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