| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·课题研究的背景和意义 | 第8页 |
| ·国内外研究进展 | 第8-10页 |
| ·论文的结构安排 | 第10-12页 |
| 第二章 蛋白质与钙离子配体结合简介及其数据集构建 | 第12-16页 |
| ·蛋白质与钙离子配体结合简介 | 第12-14页 |
| ·钙离子结合蛋白质数据集的建立 | 第14-16页 |
| ·本文所使用数据库及软件介绍 | 第14页 |
| ·钙离子结合蛋白质数据集的建立 | 第14-16页 |
| 第三章 三种算法识别蛋白质中钙离子结合残基 | 第16-24页 |
| ·滑动窗.长度的确定 | 第16页 |
| ·特征参数的选取 | 第16-19页 |
| ·氨基酸组分(aa) | 第16-17页 |
| ·位点氨基酸保守性(p) | 第17-18页 |
| ·氨基酸物理化学特性及自交叉协方差(AC) | 第18-19页 |
| ·识别方法和检验指标 | 第19-21页 |
| ·离散增量算法(ID) | 第19页 |
| ·位置矩阵打分算法(S) | 第19-20页 |
| ·支持向量机(SVM) | 第20-21页 |
| ·检验方法 | 第21页 |
| ·评价指标 | 第21页 |
| ·结果和讨论 | 第21-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第四章 基于融合参数的SVM算法识别蛋白质中钙离子结合残基 | 第24-31页 |
| ·数据集概述 | 第24-25页 |
| ·特征参数选取 | 第25页 |
| ·计算结果与讨论 | 第25-28页 |
| ·不同数据集下不同参数组合的识别结果对比 | 第25-27页 |
| ·与此前研究结果的比较 | 第27-28页 |
| ·钙离子结合残基识别在线服务器 | 第28-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第五章 总结与展望 | 第31-33页 |
| ·工作总结 | 第31页 |
| ·课题展望 | 第31-33页 |
| 参考文献 | 第33-37页 |
| 附录 | 第37-46页 |
| 附表一 数据集set 1 中蛋白质链PDB id | 第37-38页 |
| 附表二 数据集set 2 中蛋白质链PDB id | 第38-42页 |
| 附表三 数据集set 3 中蛋白质链PDB id | 第42-44页 |
| 附表四 数据集set 4 中蛋白质链PDB id | 第44-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第47页 |