| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-23页 |
| ·引言 | 第10-11页 |
| ·选题背景与意义 | 第11-17页 |
| ·选题背景 | 第11-14页 |
| ·选题意义 | 第14-17页 |
| ·转录调控分析相关研究的现状 | 第17-21页 |
| ·转录因子结合位点预测的现状 | 第17-19页 |
| ·DNA 甲基化参与转录的研究现状 | 第19-21页 |
| ·本文的主要工作和章节安排 | 第21-23页 |
| 第2章 生物信息学相关基础知识 | 第23-39页 |
| ·基因的表达调控 | 第23-27页 |
| ·分子生物学的中心法则 | 第23-25页 |
| ·基因的转录调控 | 第25-26页 |
| ·基因的翻译调控 | 第26-27页 |
| ·模体 | 第27-28页 |
| ·序列模体和结构模体 | 第27-28页 |
| ·模体预测问题描述 | 第28页 |
| ·DNA 甲基化 | 第28-38页 |
| ·DNA 甲基化的概念 | 第28-31页 |
| ·影响 DNA 甲基化的机制 | 第31-32页 |
| ·DNA 甲基化对基因转录的抑制 | 第32-34页 |
| ·DNA 甲基化的检测方法 | 第34-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第3章 DNA 甲基化影响转录因子调控功能的分析方法 | 第39-51页 |
| ·模体的识别 | 第39-45页 |
| ·引言 | 第39页 |
| ·识别的理论基础 | 第39-42页 |
| ·识别的具体步骤 | 第42-43页 |
| ·识别的输出值 | 第43-44页 |
| ·寻找更好的起始点 | 第44-45页 |
| ·启动子甲基化对转录因子结合的影响分析 | 第45-50页 |
| ·引言 | 第45-46页 |
| ·转录因子的匹配值 | 第46-48页 |
| ·转录因子匹配阈值分析 | 第48页 |
| ·DNA 甲基化对转录因子结合影响的通用模型 | 第48-50页 |
| ·启动子上转录因子的结合值 | 第50页 |
| ·甲基化对转录因子结合作用分析 | 第50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第4章 DNA 甲基化对转录因子调控功能影响的分析方法验证 | 第51-59页 |
| ·实验数据来源 | 第51页 |
| ·基因启动子甲基化数据 | 第51页 |
| ·基因表达数据 | 第51页 |
| ·实验结果与讨论 | 第51-58页 |
| ·引言 | 第51-52页 |
| ·实验结果分析 | 第52-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |