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草菇低温表达谱的数据分析及冷诱导相关代谢途径中关键基因表达量变化分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第11-23页
 1 草菇的概述第11-13页
   ·分类地位第11页
   ·食药用价值第11页
   ·生物学特性第11页
   ·草菇采后生理生化变化第11-12页
   ·草菇菌种的选育第12-13页
 2 植物的低温胁迫生理应答及抗性研究进展第13-16页
   ·植物的低温胁迫应答第13-16页
     ·低温对植物细胞膜的影响第13-14页
     ·植物抗寒基因研究进展第14-16页
 3 草菇的低温胁迫应答研究进展第16-17页
   ·低温胁迫对草菇细胞膜的影响第16页
   ·草菇冷诱导基因的研究第16-17页
 4 差异基因表达研究进展第17-20页
   ·基因芯片技术第18页
   ·差异显示技术第18-19页
   ·抑制消减杂交技术(SSH)第19页
   ·基因表达系列分析(SAGE)第19-20页
 5 mRNA检测技术第20-21页
   ·Northern杂交第20页
   ·实时定量PCR技术第20-21页
 6 本研究的目的和内容第21-23页
第二章 草菇低温表达谱的制备及数据分析第23-53页
 1 材料与方法第23-24页
   ·供试菌株第23页
   ·化学试剂第23页
   ·仪器与设备第23-24页
 2 试验方法第24-27页
   ·培养基的配置第24页
   ·草菇菌丝的处理及收集第24页
   ·草菇菌丝总RNA的提取第24-25页
   ·草菇低温表达谱文库构建方法第25-27页
     ·mRNA抽提第25-26页
     ·cDNA第一条链的合成第26页
     ·cDNA第二链的合成第26-27页
     ·补平cDNA中缺口第27页
     ·按照454测序的protocal建库第27页
   ·草菇低温表达谱的数据分析第27页
 3 结果与分析第27-47页
   ·RNA的质量与浓度第27页
   ·草菇V23菌株高表达基因第27-33页
   ·草菇VH3菌株高表达基因第33-38页
   ·草菇V23菌株差异表达基因第38-44页
   ·草菇VH3菌株差异表达基因第44-47页
 4 讨论第47-52页
   ·在草菇低温表达谱中的低温胁迫应答基因第47-48页
   ·冷诱导后差异表达基因涉及的生化过程第48-52页
     ·能量代谢途径第48-49页
     ·磷脂代谢途径第49-50页
     ·信号转导途径第50页
     ·渗透压调节第50-51页
     ·蛋白质的合成及降解第51页
     ·内标基因的筛选第51-52页
 5 小结第52-53页
第三章 草菇低温表达谱中的冷诱导相关基因表达量变化分析第53-75页
 1 材料与方法第53-54页
   ·材料、仪器、试剂第53-54页
     ·材料第53页
     ·仪器第53页
     ·试剂第53-54页
 2 试验方法第54-59页
   ·草菇菌丝总RNA的提取第55页
   ·草菇总RNA中基因组DNA的酶解第55页
   ·草菇菌丝RNA的反转录第55页
   ·目的基因序列的生物信息学分析及编码区的获得第55-56页
   ·试验中PCR的引物序列第56页
   ·目的片段的扩增第56-57页
   ·制备标准品质粒第57-58页
   ·目的基因表达量的定量测定第58-59页
 3 结果与分析第59-71页
   ·RNA质量的检验第59页
   ·a-微观蛋白编码区的获得第59-60页
   ·3-磷酸甘油酰基转移酶编码区的获得第60页
   ·海藻糖磷酸化酶编码区的获得第60页
   ·糖原磷酸化酶编码区的获得第60页
   ·目的基因表达量的测定第60-71页
     ·目的条带的扩增第60-61页
     ·目的条带的回收第61-62页
     ·克隆测序第62页
     ·目的基因及内标基因的扩增曲线第62-64页
     ·目的基因及内标基因的标准曲线第64-65页
     ·目的基因及内标基因的溶解曲线分析第65-67页
     ·定量结果第67-71页
 4 讨论第71-73页
   ·细胞膜上磷脂合成与草菇菌株耐寒性分析第71-72页
   ·小分子糖类合成与草菇菌株耐寒性分析第72-73页
 5 小结第73-75页
第四章 草菇低温刺激后不饱和脂肪酸代谢途径中关键基因表达量变化分析第75-87页
 1 材料与方法第75页
   ·材料、仪器、试剂第75页
     ·材料第75页
     ·仪器及试剂第75页
 2 试验方法第75-76页
   ·草菇菌丝总RNA的提取第75页
   ·草菇总RNA中基因组DNA的酶解第75页
   ·草菇菌丝RNA的反转录第75页
   ·目的基因序列的生物信息学的分析及编码区的获得第75页
   ·试验中PCR的引物序列第75-76页
   ·目的片段的扩增第76页
   ·制备标准品质粒第76页
   ·目的基因表达量的定量测定第76页
 3 结果与分析第76-84页
   ·△-9不饱和脂肪酸脱氢酶编码区的获得第76-77页
   ·△-12不饱和脂肪酸脱氢酶编码区的获得第77页
   ·目的基因表达量的测定第77-84页
     ·目的条带的扩增第77页
     ·目的条带的回收第77-78页
     ·克隆测序第78页
     ·目的基因及内标基因的扩增曲线第78-79页
     ·目的基因及内标基因的标准曲线第79-80页
     ·目的基因及内标基因的溶解曲线分析第80-81页
     ·定量结果第81-84页
 4 讨论第84-85页
 5 小结第85-87页
第五章 全文讨论与总结第87-89页
附录第89-97页
参考文献第97-103页
致谢第103页

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