摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-9页 |
1 引言 | 第9-13页 |
·好氧不产氧光合细菌(AAPB)简介 | 第9-10页 |
·变性梯度凝胶电泳技术(DGGE) | 第10-12页 |
·变性梯度凝胶电泳原理 | 第10-11页 |
·DGGE 相比其它技术的优势 | 第11页 |
·DGGE 在技术在水体微生物多样性研究中的应用 | 第11页 |
·DGGE 技术的不足 | 第11-12页 |
·乌梁素海的概况 | 第12页 |
·研究目的与意义 | 第12-13页 |
2 材料与方法 | 第13-21页 |
·材料 | 第13-16页 |
·样品采集和处理 | 第13页 |
·实验试剂 | 第13-14页 |
·主要仪器 | 第14页 |
·序列分析软件 | 第14页 |
·实验试剂和溶液 | 第14-15页 |
·LB 固体培养基配方 | 第15-16页 |
·环境样品总 DNA 提取及 PCR 反应条件 | 第16-18页 |
·环境样品总 DNA 提取 | 第16-17页 |
·细菌 16S rDNA V3-V5 高变区 PCR 扩增 | 第17-18页 |
·细菌 pufM 基因 PCR 扩增 | 第18页 |
·DGGE 电泳及图谱分析 | 第18-20页 |
·DGGE 电泳 | 第18-19页 |
·切胶,再扩增 | 第19页 |
·胶回收和连接转化 | 第19-20页 |
·实时荧光定量 PCR 估算细菌丰度 | 第20-21页 |
·16S rDNA 定量 PCR | 第20页 |
·pufM 基因定量 PCR | 第20-21页 |
3 结果与分析 | 第21-45页 |
·优化体系的建立 | 第21-26页 |
·PCR 优化结果比较 | 第21-22页 |
·DGGE 优化结果比较 | 第22-24页 |
·切胶回收测序 | 第24-25页 |
·回收条带的比对 | 第25-26页 |
·碳源诱导后菌群变化 | 第26-31页 |
·碳源诱导后细菌 16S rDNA-DGGE 图谱多样性分析 | 第26-27页 |
·碳源诱导后细菌 pufM-DGGE 图谱多样性分析 | 第27-29页 |
·条带测序及系统发育分析 | 第29-31页 |
·盐度处理后菌群变化 | 第31-45页 |
·盐度处理后各样品水质参数指标动态变化 | 第31-33页 |
·盐度处理样品总细菌群落分析 | 第33-38页 |
·加盐处理样品 AAPB 群落分析 | 第38-41页 |
·乌梁素海水体 AAPB 各类群所占比例 | 第41-42页 |
·pufM-DGGE 指纹图谱 CCA 分析 | 第42-43页 |
·荧光定量 PCR 结果 | 第43-45页 |
4 讨论 | 第45-51页 |
·碳源源诱导对乌梁素海细菌群落的影响 | 第45-46页 |
·碳源诱导后总细菌群落结构变化 | 第45页 |
·碳源诱导后总细菌群落结构变化 | 第45-46页 |
·盐度处理后水体环境参数变化 | 第46-47页 |
·盐度处理后总细菌群落及丰度变化 | 第47-48页 |
·盐度处理后总细菌群落变化 | 第47页 |
·盐度处理后总细菌丰度变化 | 第47-48页 |
·盐度处理后 AAPB 群落及丰度变化 | 第48-49页 |
·盐度处理后 AAPB 群落变化 | 第48页 |
·盐度处理后 AAPB 丰度变化 | 第48-49页 |
·两种处理对菌群结构的影响 | 第49-51页 |
·两种处理对总细菌群落结构的影响 | 第49页 |
·两种处理对 AAPB 群落结构的影响 | 第49-50页 |
·两种处理后总细菌类群组成变化 | 第50页 |
·两种处理后 AAPB 类群组成变化 | 第50-51页 |
5 总结 | 第51-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-60页 |
作者简介 | 第60页 |