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碳源和盐度对乌梁素海水体好氧不产氧光合细菌群落结构影响

摘要第1-4页
Abstract第4-9页
1 引言第9-13页
   ·好氧不产氧光合细菌(AAPB)简介第9-10页
   ·变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)第10-12页
     ·变性梯度凝胶电泳原理第10-11页
     ·DGGE 相比其它技术的优势第11页
     ·DGGE 在技术在水体微生物多样性研究中的应用第11页
     ·DGGE 技术的不足第11-12页
   ·乌梁素海的概况第12页
   ·研究目的与意义第12-13页
2 材料与方法第13-21页
   ·材料第13-16页
     ·样品采集和处理第13页
     ·实验试剂第13-14页
     ·主要仪器第14页
     ·序列分析软件第14页
     ·实验试剂和溶液第14-15页
     ·LB 固体培养基配方第15-16页
   ·环境样品总 DNA 提取及 PCR 反应条件第16-18页
     ·环境样品总 DNA 提取第16-17页
     ·细菌 16S rDNA V3-V5 高变区 PCR 扩增第17-18页
     ·细菌 pufM 基因 PCR 扩增第18页
   ·DGGE 电泳及图谱分析第18-20页
     ·DGGE 电泳第18-19页
     ·切胶,再扩增第19页
     ·胶回收和连接转化第19-20页
   ·实时荧光定量 PCR 估算细菌丰度第20-21页
     ·16S rDNA 定量 PCR第20页
     ·pufM 基因定量 PCR第20-21页
3 结果与分析第21-45页
   ·优化体系的建立第21-26页
     ·PCR 优化结果比较第21-22页
     ·DGGE 优化结果比较第22-24页
     ·切胶回收测序第24-25页
     ·回收条带的比对第25-26页
   ·碳源诱导后菌群变化第26-31页
     ·碳源诱导后细菌 16S rDNA-DGGE 图谱多样性分析第26-27页
     ·碳源诱导后细菌 pufM-DGGE 图谱多样性分析第27-29页
     ·条带测序及系统发育分析第29-31页
   ·盐度处理后菌群变化第31-45页
     ·盐度处理后各样品水质参数指标动态变化第31-33页
     ·盐度处理样品总细菌群落分析第33-38页
     ·加盐处理样品 AAPB 群落分析第38-41页
     ·乌梁素海水体 AAPB 各类群所占比例第41-42页
     ·pufM-DGGE 指纹图谱 CCA 分析第42-43页
     ·荧光定量 PCR 结果第43-45页
4 讨论第45-51页
   ·碳源源诱导对乌梁素海细菌群落的影响第45-46页
     ·碳源诱导后总细菌群落结构变化第45页
     ·碳源诱导后总细菌群落结构变化第45-46页
   ·盐度处理后水体环境参数变化第46-47页
   ·盐度处理后总细菌群落及丰度变化第47-48页
     ·盐度处理后总细菌群落变化第47页
     ·盐度处理后总细菌丰度变化第47-48页
   ·盐度处理后 AAPB 群落及丰度变化第48-49页
     ·盐度处理后 AAPB 群落变化第48页
     ·盐度处理后 AAPB 丰度变化第48-49页
   ·两种处理对菌群结构的影响第49-51页
     ·两种处理对总细菌群落结构的影响第49页
     ·两种处理对 AAPB 群落结构的影响第49-50页
     ·两种处理后总细菌类群组成变化第50页
     ·两种处理后 AAPB 类群组成变化第50-51页
5 总结第51-52页
致谢第52-53页
参考文献第53-60页
作者简介第60页

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