基于模式匹配的DNA多序列比对及相似性分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| ·研究背景与意义 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状及发展趋势 | 第12-14页 |
| ·多序列比对 | 第12-13页 |
| ·序列相似性分析 | 第13-14页 |
| ·进化树构建 | 第14页 |
| ·本文所做的工作 | 第14-15页 |
| ·论文结构 | 第15-16页 |
| 第2章 生物信息学相关知识 | 第16-32页 |
| ·生物信息学基本概念 | 第16-20页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第16-17页 |
| ·核酸和蛋白质 | 第17-18页 |
| ·遗传信息传递与表达 | 第18-19页 |
| ·变异 | 第19页 |
| ·生物信息学的中心法则 | 第19-20页 |
| ·序列比对 | 第20-28页 |
| ·序列比对概述 | 第20-24页 |
| ·序列比对算法 | 第24-28页 |
| ·分子进化 | 第28-31页 |
| ·分子进化简介 | 第28-29页 |
| ·系统进化树 | 第29-30页 |
| ·构建系统进化树 | 第30-31页 |
| ·小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于模式匹配的DNA多序列比对算法 | 第32-44页 |
| ·模式匹配原理及应用 | 第32-35页 |
| ·模式匹配概述 | 第32页 |
| ·模式匹配分类 | 第32-33页 |
| ·模式匹配常用算法 | 第33-35页 |
| ·模式匹配技术在计算生物学中的应用 | 第35页 |
| ·基于模式匹配的多序列比对算法引入 | 第35-36页 |
| ·算法描述 | 第36页 |
| ·算法复杂性描述 | 第36-37页 |
| ·实验结果对比分析 | 第37-43页 |
| ·实验结果 | 第37-42页 |
| ·实验结果分析 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第4章 基于模式匹配的DNA序列相似性分析 | 第44-54页 |
| ·常用的序列相似性分析方法 | 第44-46页 |
| ·信息理论方法 | 第44页 |
| ·序列比对方法 | 第44-45页 |
| ·统计特征方法 | 第45页 |
| ·基于图形表示的方法 | 第45页 |
| ·聚类分析方法 | 第45-46页 |
| ·利用模式匹配的序列相似性分析方法 | 第46-49页 |
| ·构建进化树 | 第46页 |
| ·Kimura模型 | 第46-48页 |
| ·Neighbor-joining方法 | 第48-49页 |
| ·利用模式匹配的序列相似性分析方法的基本步骤 | 第49页 |
| ·实验结果分析 | 第49-53页 |
| ·小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 附录A (攻读硕士期间参加的项目) | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
