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香菇分子遗传图谱构建和数量性状座位(QTL)分析

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-17页
缩略词表第17-19页
第一章 文献综述第19-63页
 1 大型真菌分子遗传图谱构建和QTL定位研究进展第19-43页
   ·真菌分子遗传图谱构建原理和方法第19-32页
     ·遗传图谱构建的理论基础第19-20页
     ·图谱构建的基本步骤第20-21页
     ·分子遗传图谱常用标记第21-30页
     ·真菌遗传作图群体的选择第30-32页
   ·大型真菌遗传图谱构建概况第32-36页
     ·灰盖鬼伞(Coprinus cinereus)第32-33页
     ·双孢蘑菇(Agaricus bisporus)第33-34页
     ·糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus var.Florida)第34-35页
     ·香菇(Lentinula edodes)第35-36页
   ·大型真菌QTL定位方法第36-41页
     ·单标记分析法第37-38页
     ·区间作图法第38页
     ·复合区间作图法第38-39页
     ·混合线性模型的复合区间作图法第39页
     ·Bayesian-MCMC(Bayesian-Markov chain Monte Carlo)作图方法第39-40页
     ·其他QTL定位方法第40-41页
     ·QTL精细定位第41页
   ·大型真菌OTL定位研究进展第41-43页
     ·双孢蘑菇QTL定位研究第42页
     ·糙皮侧耳QTL定位研究第42-43页
 2 香菇遗传与育种研究进展第43-60页
   ·香菇概述第43-44页
   ·香菇遗传研究进展第44-60页
     ·香菇的生活史第44-45页
     ·香菇交配型研究进展第45-52页
     ·香菇子实体发育相关基因的研究第52-55页
     ·香菇数量性状的研究第55-58页
     ·香菇遗传多样性的研究第58-60页
 3 本研究目的和意义第60-63页
第二章 作图群体的构建第63-75页
 1 引言第63页
 2 材料与方法第63-68页
   ·供试香菇材料第63页
   ·供试培养基第63-64页
   ·试验所用仪器、设备第64页
   ·试验方法第64-68页
     ·作图群体构建第64-68页
     ·测交双核体菌株的制备第68页
 3 结果与分析第68-70页
   ·作图群体单核体亲本与测交单核体之间交配型的分析第68页
   ·作图群体单核体交配型分析及作图群体数量的确定第68-70页
   ·测交双核体的获得第70页
 4 讨论第70-73页
   ·香菇孢子单核体交配型鉴定第70-71页
   ·作图群体单核体与测交单核体之间交配型的鉴定第71-72页
   ·香菇次级重组交配型第72-73页
 5 小结第73-75页
第三章 香菇重要数量性状及其相互关系的遗传分析第75-91页
 1 引言第75-76页
 2 材料与方法第76-78页
   ·试验材料第76页
   ·试验方法第76-78页
     ·双核体栽培及农艺性状第76页
     ·单核体菌丝密度、整齐度及长势测定第76页
     ·菌丝长速测定第76-77页
     ·抗木霉活性测定第77页
     ·胞外酶活性测定第77-78页
   ·数据处理第78页
 3 结果与分析第78-86页
   ·测交双核体部分性状的相关分析和主成分分析第78-84页
     ·性状间的相关分析第79-82页
     ·主成分分析第82-84页
   ·单核体数量性状的分析第84-86页
     ·单核体几种数量性状的相关性分析第84-85页
     ·单核体菌丝密度、整齐度、长势与其他性状的相关性分析第85-86页
 4 讨论第86-88页
   ·双核体部分性状的相关分析和主成分分析第86-88页
   ·单核体数量性状的分析第88页
 5 小结第88-91页
第四章 分子连锁遗传图的构建第91-127页
 1 引言第91页
 2 材料与方法第91-97页
   ·试验材料第91页
   ·主要试剂的来源、规格及用途第91-92页
   ·试验所用仪器、设备第92页
   ·试验方法第92-97页
     ·基因组DNA提取第92-93页
     ·RAPD引物扩增分析第93-94页
     ·ISSR引物扩增分析第94-95页
     ·SRAP引物扩增分析第95页
     ·SSR引物扩增分析第95-96页
     ·扩增产物检测第96页
     ·遗传图谱构建第96-97页
 3 结果与分析第97-112页
   ·作图群体分子标记扩增情况第97-107页
     ·RAPD引物扩增分析第97-98页
     ·ISSR引物扩增分析第98-99页
     ·SRAP引物扩增分析第99-100页
     ·SSR引物扩增分析第100-107页
   ·香菇连锁图谱构建第107-112页
     ·连锁图分析第107-108页
     ·构建的连锁图与已有的香菇分子连锁图的比较第108-112页
 4 讨论第112-124页
   ·香菇EST-SSR中SSR的组成分布及SSR引物筛选第112-113页
     ·香菇EST数据库中的SSR第112-113页
     ·香菇EST-SSR引物筛选第113页
   ·香菇分子遗传图谱的构建第113-124页
     ·构图所用分子标记的选择第113-116页
     ·分子标记引物的扩增结果第116-119页
     ·分子标记的偏分离第119-122页
     ·香菇分子遗传图谱第122-124页
 5 小结第124-127页
   ·香菇基因组中EST-SSR分析第124-125页
   ·香菇EST-SSR引物设计及扩增情况第125页
   ·RAPD引物扩增情况第125页
   ·ISSR引物扩增情况第125页
   ·SRAP引物扩增情况第125-126页
   ·香菇分子遗传连锁图构建第126-127页
第五章 香菇部分数量性状的QTL定位第127-164页
 1 引言第127页
 2 材料与方法第127页
   ·构图群体第127页
   ·遗传连锁图谱构建第127页
   ·数量性状测定第127页
   ·QTL定位方法第127页
 3 结果与分析第127-151页
   ·性状数据的整理与频数分布第127-131页
   ·有关发育期的QTL定位第131-132页
   ·有关单菇性状的QTL定位第132-136页
   ·有关产量性状的QTL定位第136-138页
   ·有关双核体菌丝长速和抗木霉活性的QTL定位第138-139页
   ·有关双核体胞外酶活性的QTL定位第139-140页
   ·有关单核体菌丝长速和抗木霉活性的QTL定位第140-142页
   ·有关单核体胞外酶活性的QTL定位第142-143页
   ·有关单核体菌丝形态的QTL定位第143-144页
   ·用MCMC作图方法验证通过CIM作图方法发现的QTL第144-147页
   ·MCMC作图方法检测的某些QTL的上位性互作第147-151页
 4 讨论第151-160页
   ·香菇双核体性状QTL定位的特殊性第151-152页
   ·QTL定位的显著性阀值的确定及QTL的可靠性第152-153页
   ·香菇30个性状的QTL定位的总体情况第153-157页
   ·QTL成簇分布现象第157-158页
   ·QTL长度与QTL精细定位第158页
   ·单核体菌丝形态性状的QTL定位第158-160页
 5 小结第160-164页
   ·香菇QTL定位总体情况第160-161页
   ·香菇主要性状QTL的定位第161-163页
     ·双核体主要性状QTL定位第161-162页
     ·单核体主要性状QTL定位第162-163页
   ·MCMC方法定位结果第163页
   ·部分QTL的上位性互作第163-164页
本研究创新点第164-165页
参考文献第165-184页
致谢第184-185页
附录1:在读期间发表的与课题有关的论文第185-186页
附录2:聚丙烯酰胺凝胶电泳第186-190页

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