基于判别分析的植物poly(A)位点识别研究
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-8页 |
第一章 绪论 | 第8-22页 |
·前言 | 第8-9页 |
·一些相关的生物学方面的基础知识 | 第9-16页 |
·遗传物质 | 第9-13页 |
·遗传密码 | 第13-14页 |
·基因的结构及表达 | 第14-16页 |
·Poly(A)位点识别研究的意义 | 第16-17页 |
·植物Poly(A)位点识别的现状 | 第17-19页 |
·本文的研究内容和采用的方法 | 第19-20页 |
·本文的结构 | 第20-22页 |
第二章 植物Poly(A)位点特征空间的产生 | 第22-33页 |
·训练和测试用的数据 | 第22-23页 |
·植物Poly(A)位点周围序列的碱基分布特征 | 第23-25页 |
·特征的提取及相应算法 | 第25-30页 |
·K-gram 核苷酸模式 | 第26页 |
·Z 曲线分量及偏差量 | 第26-27页 |
·基于PSSM 的CIS 分值 | 第27页 |
·基于一阶异构马尔可夫子模型的概率 | 第27-28页 |
·NUE 六联子权重 | 第28-29页 |
·各信号区域的阶乘矩值 | 第29-30页 |
·特征空间的产生 | 第30-31页 |
·特征的初步选择 | 第31-33页 |
第三章 基于判别分析的位点识别模型 | 第33-44页 |
·判别分析算法 | 第33-37页 |
·模型的训练和测试过程 | 第37-44页 |
·判别分析全模型 | 第37-38页 |
·逐步判别模型 | 第38-40页 |
·逐步回归与判别分析结合建立模型 | 第40-44页 |
第四章 结果分析 | 第44-52页 |
·各测试集识别结果 | 第44-49页 |
·性能指标 | 第44-45页 |
·识别结果 | 第45-47页 |
·结果分析 | 第47-49页 |
·各特征对位点识别的影响 | 第49-50页 |
·与其他分类方法的比较 | 第50-52页 |
第五章 总结与展望 | 第52-54页 |
·全文总结 | 第52-53页 |
·不足与改进建议 | 第53-54页 |
参考文献 | 第54-57页 |
致谢 | 第57页 |