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水稻光敏核不育基因pms1的精细定位以及候选基因区段序列分析

中文摘要第1-9页
Abstract第9-12页
1 前言第12-37页
   ·植物基因组研究概况第12-14页
   ·禾本科比较基因组的研究进展第14-20页
     ·禾本科共线性研究第15-17页
     ·禾本科基因组结构与进化研究第17-19页
     ·新基因的产生、快速丢失和鉴定第19-20页
   ·基因克隆与表达分析第20-22页
   ·生物信息学的发展与应用第22-23页
   ·植物雄性不育研究进展第23-36页
     ·植物雄性不育现象的普遍性、分类及其应用第23-25页
     ·不同植物中CMS机理的研究进展第25-30页
       ·与CMS相关的胞质基因的分离及其结构特征第25-27页
       ·与CMS相关的核育性恢复基因的分离及其结构特征第27-30页
       ·CMS/Rf系统雄性不育与育性恢复机理的研究第30页
     ·不同植物中GMS机理的研究进展第30-31页
     ·光温敏核不育水稻研究进展第31-36页
       ·光、温敏雄性不育材料的发现及早期研究第31-32页
       ·PSGMS的育性转换和生理生化特性第32-33页
       ·PSGMS的遗传分析和分子生物学研究第33-36页
   ·本研究的目的与意义第36-37页
2 材料和方法第37-43页
   ·转化材料和BAC克隆21O9的微物理图谱第37页
   ·定位群体第37页
   ·文库和分子标记第37-38页
   ·遗传转化系统第38页
   ·相关水稻品种第38页
   ·花药育性检测和结实率考察第38-39页
   ·水稻DNA抽提、浓度测定、酶切转膜、探针制备及Southern杂交第39-40页
   ·基因pmsl的精细定位第40页
   ·BAC克隆的shotgun测序及其分析第40-42页
     ·BAC克隆shotgun文库的构建第40-41页
     ·随机亚克隆片段的两端测序及其拼接第41页
     ·BAC克隆的序列分析和基因预测第41-42页
     ·转座成分的注释与插入时间估计第42页
   ·PCR产物直接测序第42-43页
3 结果与分析第43-68页
   ·农垦58基因组BAC文库的筛选与BAC克隆18P4的测序第43-56页
     ·农垦58基因组BAC文库的构建和筛选第43页
     ·农垦58 BAC克隆18P4的序列测定第43-44页
     ·选基因区段的序列比较分析第44-56页
       ·明恢63 BAC克隆21O9序列的完善第44-45页
       ·BAC克隆21O9序列的注释第45-49页
       ·定位区段候选基因的比较分析第49-50页
       ·候选基因区段的共线性分析第50-55页
       ·完整LTR-retrotransposons插入时间的估计第55-56页
   ·转化材料的田间鉴定第56-58页
     ·转化材料第56-57页
     ·转化材料的分子标记检测和育性考查第57-58页
       ·4B的分子标记检测和育性考查第57页
       ·其它片段转基因植株的分子标记检测和育性考查第57-58页
   ·一个光形态建成相关基因的转化第58-59页
   ·利用农垦58S与明恢63回交群体对pmsl重新进行精细定位第59-61页
     ·极端不育重组单株的获得第59-60页
     ·新标记的添加以及对极端不育重组单株进行标记分析第60-61页
     ·对农垦58S/明恢63 BC_2F_3家系的后代进一步分析第61页
   ·明恢63 BAC克隆57N1和24L2的序列测定及其分析第61-64页
     ·明恢63 BAC克隆57N1和24L2的序列测定第61-62页
     ·明恢63与日本晴序列的比较分析第62-64页
   ·候选基因区段的生物信息学分析、功能互补以及比较测序第64-68页
     ·21 kb DNA片段的生物信息学分析第64-65页
     ·候选基因的遗传转化及对转基因植株的相关分析第65页
     ·21 kb DNA片段的比较测序第65-68页
4 讨论第68-75页
   ·本研究的创新之处及其意义第68-71页
   ·本研究的碰到的问题与困难第71-73页
   ·进一步研究和基因pms1、pms3相互作用模式的一些思考第73-75页
参考文献第75-96页
致谢第96-97页
附录1:常用试剂配方和部分实验的详细操作程序第97-105页
附录2:本研究所用的部分引物第105-106页
附录3:本研究所用极端不育重组单株全部信息第106-107页
附录4:作者简介和在读期间发表论文第107页

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