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GWAS筛选的肝细胞癌预后相关SNP位点的功能研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词第12-13页
1 引言第13-15页
    1.1 肝细胞癌与乙型病毒性肝炎第13页
    1.2 全基因组关联研究与HCC第13-14页
    1.3 本课题前期研究概括第14-15页
2 HLA基因多态性与乙肝相关肝癌患者全身性炎症及预后的相关性分析第15-31页
    2.1 前言第15-16页
    2.2 资料与方法第16-18页
        2.2.1 研究对象第16页
        2.2.2 临床病理资料数据收集第16-17页
        2.2.3 随访第17页
        2.2.4 候选单核苷酸多态性(SNPs)位点第17页
        2.2.5 全身炎症指标第17-18页
        2.2.6 统计分析第18页
    2.3 结果第18-28页
        2.3.1 患者一般特征第18-20页
        2.3.2 候选SNP基因型与NLR水平的相关性第20-22页
        2.3.3 NLR的最佳界值第22-23页
        2.3.4 临床或遗传变量与NLR亚组的关联第23-25页
        2.3.5 患者临床特征与rs7453920基因型的相关性分析第25页
        2.3.6 患者总生存期相关因素分析第25-28页
    2.4 讨论第28-30页
    2.5 小结第30-31页
3 术后中性粒淋巴细胞比值与肝细胞癌切除术后复发及生存的相关性分析第31-43页
    3.1 前言第31页
    3.2 资料与方法第31-32页
        3.2.1 研究对象第31页
        3.2.2 临床病理资料及分组标准第31-32页
        3.2.3 术后随访第32页
        3.2.4 统计学分析第32页
    3.3 结果第32-40页
        3.3.1 临床病理特征第32页
        3.3.2 术后NLR预测生存最佳界值及与生存相关性分析第32-33页
        3.3.3 术后OS及RFS的影响因素分析第33-36页
        3.3.4 术后NLR预测早期复发、晚期复发最佳界值第36-37页
        3.3.5 术后早期复发及晚期复发的影响因素分析第37-40页
    3.4 讨论第40-42页
    3.5 小结第42-43页
4 SNP功能相关的潜在基因的筛选第43-60页
    4.1 前言第43-44页
    4.2 材料与方法第44-45页
        4.2.1 检索预后相关SNP附近已定义基因序列第44页
        4.2.2 文献检索与基因筛选标准第44页
        4.2.3 蛋白相互作用网络构建第44-45页
        4.2.4 候选基因mRNA表达水平分析第45页
    4.3 结果第45-58页
        4.3.1 所有6个预后相关SNP附近候选基因列表第45-49页
        4.3.2 基于文献检索的候选基因筛选第49页
        4.3.3 筛选获得基因的蛋白相互作用网络图第49-52页
        4.3.4 所有11个筛选获得基因在多种肿瘤中mRNA表达情况第52-56页
        4.3.5 11个筛选所得基因在肝细胞癌组织与癌旁组织mRNA水平差异比较第56-58页
    4.4 讨论第58-59页
    4.5 小结第59-60页
5 待测基因在肝癌组织中表达与SNP分型及临床病理特征的相关性分析第60-74页
    5.1 前言第60页
    5.2 材料与方法第60-64页
        5.2.1 患者入组与组织标本第60页
        5.2.2 免疫组织化学检测试剂耗材及仪器第60-62页
        5.2.3 实验方法第62-63页
        5.2.4 统计分析第63-64页
    5.3 结果第64-72页
        5.3.1 患者一般临床病理特征第64-65页
        5.3.2 MDC1在肝癌组织和癌旁组织的表达及与患者生存的关系第65-66页
        5.3.3 BRF2在肝癌组织和癌旁组织的表达及与患者生存的关系第66-67页
        5.3.4 BTNL2在肝癌组织和癌旁组织的表达及与患者生存的关系第67-68页
        5.3.5 TUBB在肝癌组织和癌旁组织的表达及与患者生存的关系第68-69页
        5.3.6 VARS2在肝癌组织和癌旁组织的表达及与患者生存的关系第69-70页
        5.3.7 其他蛋白的免疫组织化学检测结果第70页
        5.3.8 MDC1在肝癌组织表达与患者临床病理特征及SNP分型的关系第70-72页
    5.4 讨论第72-73页
    5.5 小结第73-74页
6 MDC1对肝细胞癌细胞生物学行为的影响第74-84页
    6.1 前言第74页
    6.2 材料与方法第74-82页
        6.2.1 材料第74-75页
        6.2.2 方法第75-82页
    6.3 结果第82-83页
        6.3.1 siRNA转染干扰MDC1表达效果的分析第82-83页
        6.3.2 CCK-8检测细胞增殖第83页
    6.4 讨论第83-84页
7 结论第84-85页
参考文献第85-88页
文献综述第88-95页
    参考文献第92-95页
致谢第95-96页
简历第96-97页

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