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水稻基因组和EST序列的测定和分析以及水淹条件下乙醛酸循环相关基因功能的研究

摘要第1-10页
第一章 水稻四号染色体基因组序列分析和编码类似α-淀粉酶抑制剂蛋白的基因序列的比较分析第10-38页
 一、植物基因组测序综述第10-13页
 二、水稻第四号染色体精确序列的分析第13-26页
  1 高等植物基因的基本结构第13-16页
  2 基因预测工作的内容和工具第16-17页
  3 EST 序列测定在基因预测中的重要作用第17-19页
  4 水稻第四号染色体基因组序列的注释第19-23页
  5 水稻第四号染色体基因组序列的整体统计结果第23-26页
 三、对预测的编码类似α-淀粉酶抑制剂蛋白基因的鉴定及其在籼稻和粳稻之间的差异第26-38页
  1 材料与方法第27-28页
  2 实验的结果第28-35页
  3 OsAI1 基因研究结果的讨论第35-38页
第二章 水稻基因poly(A)加尾信号及其下游调控序列的研究第38-62页
 一、引言第38-42页
 二、材料与方法第42-49页
  1 poly(A)位点的确定及其上、下游序列数据库的建立第42-46页
  2 数据分析和统计第46-49页
 三、结果与讨论第49-62页
  1 水稻的poly(A)位点第49-50页
  2 poly(A)位点上游存在的AAUAAA 和P1PAS 信号的分析第50-54页
  3 水稻m RNA 中P2PAS 和P3PAS 的预测和分析第54-56页
  4 poly(A)位点附近的富含U 或GU 的调控序列的分析第56-58页
  5 PAS 和DUE 对poly(A)位点位置的限制作用第58-59页
  6 poly(A)位点两侧-40 至+40 nt 序列碱基组成的特点第59-62页
第三章 在水淹条件下,水稻乙醛酸循环关键基因功能的功能研究第62-93页
 一、引言第62-66页
 二、材料与方法第66-77页
  1. 样品处理第66页
  2. 水稻样品总RNA 的提取第66-67页
  3. 水稻ICL 基因和MS 基因的克隆和序列测定第67-72页
  4. Northern 杂交第72-74页
  5. PDC 活性的测定第74-76页
  6. ICL 活性的测定第76-77页
 三、实验结果第77-90页
  1. 水稻MS 和ICL 基因的确定第77-83页
  2. 在水淹条件下,ICL 和MS 基因的转录水平的上升第83-84页
  3. PDC 和ICL 活性分析第84-87页
  4. 水稻幼苗细胞的乙醛酸循环体在缺氧条件下的形态变化第87-89页
  5. 在乙醛胁迫条件下,ICL 和MS 基因的转录水平的上升第89-90页
 四、讨论第90-93页
第四章 在水淹条件下,水稻乙酰辅酶A 合成酶(ACS)的表达及活性研究第93-109页
 一、引言第93-95页
 二、材料与方法第95-98页
  1. 水稻材料的水淹处理与乙醛胁迫第95页
  2. 水稻ACS 基因全部编码序列的确定第95-96页
  3. 利用RT-PCR 的方法确定水稻Aldh 基因在经过胁迫的水稻组织中的表达第96-97页
  4. Northern 杂交第97页
  5. ACS 活性的测定第97-98页
 三、实验结果第98-107页
  1. 水稻ACS 基因的序列分析第98-102页
  2. OsACS1和OsACS2 基因在水淹处理后的水稻中的不同表达第102页
  3. ACS 的活性测定与分析第102-104页
  4. OsACS1和OsACS2 基因在乙醛诱导后的水稻中的不同表达第104-105页
  5. 各个水稻Aldh 基因在水淹处理和乙醛胁迫的组织的表达情况第105-107页
 四、讨论第107-109页
参考文献第109-121页
主要试剂和仪器第121-122页
结束语第122-124页
发表文章第124-125页
致谢第125页

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