基于Petri网的生物代谢网络建模
| 摘 要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 1 绪 论 | 第9-15页 |
| ·生物代谢研究概述 | 第9-10页 |
| ·系统生物学的发展 | 第10-13页 |
| ·问题的提出 | 第13页 |
| ·本文主要研究内容 | 第13-15页 |
| 2 PETRI网代谢模型的描述 | 第15-24页 |
| ·方法的引入 | 第15-16页 |
| ·Petri网定义 | 第16-18页 |
| ·代谢模型的Petri网表示 | 第18-20页 |
| ·Petri网代谢模型的简化 | 第20-21页 |
| ·PNML描述模型 | 第21-23页 |
| ·小结 | 第23-24页 |
| 3 PETRI网代谢模型的分析 | 第24-32页 |
| ·有界性分析 | 第24-27页 |
| ·S、T不变量分析 | 第27-29页 |
| ·最优化分析 | 第29-31页 |
| ·小结 | 第31-32页 |
| 4 建模环境的设计与实现 | 第32-45页 |
| ·模型编辑界面 | 第32-39页 |
| ·模型计算模块 | 第39-41页 |
| ·扩展模块 | 第41-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 5 仿真与分析 | 第45-60页 |
| ·无氧代谢 | 第45-50页 |
| ·有氧代谢 | 第50-54页 |
| ·无氧-有氧代谢 | 第54-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 6 结论与展望 | 第60-61页 |
| 致 谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-65页 |
| 附录 攻读学位期间发表的论文 | 第65页 |