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猪五个基因的分离、辐射杂种板定位及其与经济性状的关联分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 文献综述第11-22页
   ·猪基因组研究现状第11-12页
   ·根据EST的基因分离第12-15页
     ·依据第12-13页
     ·EST及其应用第13页
     ·利用EST发现和克隆新基因第13-15页
   ·猪基因物理定位技术第15-19页
     ·原位杂交(In situ hybridization,ISH)第16页
     ·体细胞杂种细胞系技术第16-18页
       ·体细胞杂种板(SCHP)用于染色体区域定位第16-17页
       ·辐射杂种板(RH)用于染色体精细定位第17-18页
     ·辐射杂种板技术的优点和应用第18-19页
   ·五个拟分离基因的研究进展第19-22页
     ·醛缩酶(ALD)基因家族第19-20页
     ·硒蛋白P(SEPP1)基因第20-21页
     ·膜蛋白(CT120)基因第21-22页
2 研究的目的和意义第22-23页
3 材料与方法第23-34页
   ·材料第23-26页
     ·样品第23-24页
       ·DNA样品第23-24页
       ·组织样品第24页
     ·主要仪器设备第24页
     ·主要试剂及配制第24-25页
       ·主要试剂第24-25页
       ·主要试剂配制第25页
     ·主要分子生物学软件和统计软件第25-26页
   ·方法第26-34页
     ·猪ALDOA、ALDOB、ALDOC、SEPP1和CT120基因的分离方法第26-30页
       ·猪EST信息的获取和整理第26-27页
       ·引物设计第27页
       ·PCR扩增条件第27页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第27-28页
       ·DNA序列同源性检索鉴定第28-30页
     ·五个基因染色体精细定位-RH法第30-31页
       ·引物设计第30页
       ·PCR扩增分型方法第30页
       ·数据分析方法第30-31页
     ·PCR-RFLP方法检测猪CT120和SEPP1基因的多态性和遗传方式第31页
       ·PCR扩增引物第31页
       ·酶切条件第31页
       ·基因分型第31页
     ·CT120和SEPP1基因多态位点遗传方式的检测方法第31页
     ·多态标记与性状的关联分析方法第31页
     ·利用半定量RT-PCR进行SEPP1基因组织表达谱研究的方法第31-34页
       ·总RNA的提取、检测、DNase-Ⅰ处理及纯化第31-32页
       ·RNA的反转录(Reverse transcription RT)第32-33页
       ·PCR反应第33页
       ·数据分析第33-34页
4 结果第34-60页
   ·五个猪基因片段的分离、序列分析与鉴定结果第34-45页
     ·根据猪EST所设计的引物扩增猪基因组的结果第34-35页
       ·猪三个醛缩酶同工酶基因的分离第34页
       ·猪SEPP1基因的分离第34-35页
       ·猪CT120基因的分离第35页
     ·所分离片段的序列分析结果第35-38页
     ·在GenBank数据库中的序列同源性检索第38-44页
     ·扩增片段鉴定结果第44-45页
   ·利用IMpRH进行的染色体精细定位结果第45-48页
   ·猪SEPP1和CT120基因的遗传变异与遗传方式的检测结果第48-56页
     ·SEPP1基因的遗传变异与遗传方式第48-53页
       ·SEPP1基因第2内含子突变的发现第48-49页
       ·SEPP1基因的第2内含子的KpnI酶切位点多态性的检测结果第49-51页
       ·SEPP1基因的第2内含子的KpnI酶切多态位点的遗传方式第51页
       ·SEPP1基因的第2内含子的VspI酶切位点多态性的检测结果第51-53页
     ·CT120基因的遗传变异与遗传方式第53-56页
       ·CT120基因第4内含子突变的发现第53-54页
       ·CT120基因第4内含子的MspI酶切位点多态性的检测结果第54-56页
       ·CT120基因第4内含子的MspI酶切多态位点的遗传方式第56页
   ·猪CT120基因第4内含子MspI-RFLP位点与部分经济性状的关联分析结果第56-58页
   ·利用半定量RT-PCR研究猪SEPP1基因的组织表达结果第58-60页
     ·总RNA的提取和检测结果第58页
     ·猪SEPP1基因表达谱分析第58-60页
5 讨论第60-65页
   ·关于根据EST的基因分离第60页
   ·关于引物的设计问题第60-61页
   ·关于五个分离基因的RH定位第61-62页
   ·关于等位基因频率在猪群间的分布差异问题第62-63页
   ·关于猪CT120基因与部分经济性状的初步关联分析第63-64页
   ·关于SEPP1基因的表达谱分析第64-65页
6 小结第65-67页
   ·本研究获得的结果第65页
   ·本研究的创新点第65页
   ·由本研究提出的问题以及不足之处第65-67页
参考文献第67-72页
附录1 缩略词表第72-73页
附录2 主要性状的中英文对照和缩写第73-74页
在读期间发表的论文题录第74-75页
致谢第75-76页

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