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基于rbcL、matK基因序列探讨松科系统进化的可能性及rbcL、matK基因SSCP分析

一、 前言第1-20页
   ·rbcL基因和matK基因在植物系统进化分析中的应用第10-14页
     ·叶绿体DNA的特性第10-11页
     ·rbcL基因及在系统发育分析中的应用第11-13页
     ·matK基因及在系统发育分析中的应用第13-14页
   ·松科植物研究中rbcL和matK基因的应用第14页
   ·松科系统的研究状况第14-18页
   ·SSCP介绍及PCR-SSCP研究状况第18页
   ·太白红杉的研究现状第18-20页
二、 基于rbeL、matK基因序列探讨松科系统进化的可能性第20-39页
   ·材料与方法第20-24页
     ·材料来源第20-21页
     ·主要仪器与试剂第21-22页
       ·主要仪器第21页
       ·主要药品与试剂第21-22页
     ·基因组总DNA的提取第22页
     ·rbcL、matK基因的扩增第22-23页
       ·引物的设计与合成第22页
       ·扩增反应体系及条件第22-23页
       ·PCR产物的鉴定第23页
     ·序列测定及分析第23页
     ·数据库下载的相关基因信息及所测序列的登记号第23-24页
   ·结果与分析第24-35页
     ·种子基因组总DNA提取结果第24页
     ·基因扩增结果第24页
     ·序列分析第24-30页
       ·序列分析第24-25页
         ·rbcL基因序列分析第24-25页
         ·matK基因序列分析第25页
       ·序列编码特征分析第25-28页
         ·rbcL序列编码特征分析第25-27页
         ·matK序列编码特征分析第27-28页
       ·密码子3个位点不同个数与成员间p-distance关系第28-29页
         ·rbcL基因密码子3个位点不同个数与成员间p-distance的关系第28-29页
         ·matK基因密码子3个位点不同个数与成员间p-distance的关系第29页
       ·成员间p-distance与TS,TV之间关系第29-30页
         ·基于rbcL序列各成员间p-distance与TS,TV关系第29-30页
         ·基于matK序列各成员间p-distance与TS,TV关系第30页
       ·序列碱基不同位点与可能信息位点第30页
     ·各种间的遗传距离第30页
     ·建树分析第30-35页
       ·基于rbcL序列建树第30-32页
       ·基于matK序列建树第32-33页
       ·基于rbcL+matK序列建树第33-35页
   ·讨论第35-38页
     ·碱基成分第35-36页
     ·基于rbcL和matK序列构建系统树分析第36-37页
     ·太白红杉的系统位置以及落叶松植物的演化第37-38页
     ·建树方法分析第38页
   ·针对本实验构建松科系统发育树的解决方案第38-39页
三、 rbcL基因和matK基因的PCR-SSCP条件探讨及初步分析第39-50页
   ·材料与方法第39-44页
     ·实验材料第39页
     ·主要仪器与试剂第39-41页
       ·主要仪器第39-40页
       ·主要药品与试剂第40-41页
     ·总DNA提取第41页
     ·PCR扩增第41-42页
       ·扩增引物第41-42页
       ·扩增反应体系及条件第42页
     ·SSCP分析第42-44页
   ·结果与分析第44-47页
     ·DNA浓度及纯度测定第44页
     ·PCR-SSCP分析第44-47页
   ·讨论第47-50页
     ·总DNA的提取第47-48页
     ·PCR-SSCP影响因素的分析第48-50页
       ·交联度对SSCP的影响第48页
       ·凝胶浓度对SSCP的影响第48-49页
       ·分子大小对SSCP的影响第49页
       ·电泳液离子浓度对SSCP的影响第49页
       ·电泳温度对SSCP的影响第49-50页
四、 太白红杉种子与幼苗多糖含量测定分析第50-54页
   ·材料与方法第50-52页
     ·实验材料第50页
     ·实验仪器与试剂第50页
       ·主要仪器第50页
       ·主要药品与试剂第50页
     ·制标准曲线第50-51页
     ·可溶性多糖的提取第51-52页
     ·显色及比色第52页
   ·结果与分析第52-54页
总结第54-55页
致谢第55-56页
参考文献第56-64页
附录第64-95页
 附录Ⅰ第64-71页
 附录Ⅱ第71-78页
 附录Ⅲ第78-95页
攻读学位期间研究成果及获奖情况第95页

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