G蛋白偶联受体功能位点与功能性SNPs的预测
摘要 | 第1-8页 |
ABSTRACT | 第8-14页 |
第一章 绪论 | 第14-29页 |
·研究背景 | 第14-15页 |
·GPCRs概述 | 第15-27页 |
·GPCRs的结构 | 第15-17页 |
·GPCR超家族的分类和GPCR数据库 | 第17-20页 |
·GPCRs配基结合域 | 第20-21页 |
·GPCRs活化的分子机制和模式 | 第21-22页 |
·GPCRs的二聚化 | 第22-23页 |
·GPCRs失敏和内吞 | 第23-24页 |
·GPCRs的信号传导机制 | 第24-27页 |
·研究内容和目的 | 第27-28页 |
·研究内容 | 第27-28页 |
·研究目的 | 第28页 |
·论文的组织结构 | 第28-29页 |
第二章 G蛋白偶联受体功能位点的预测 | 第29-51页 |
·前言 | 第29-33页 |
·材料和方法 | 第33-35页 |
·材料 | 第33页 |
·方法 | 第33-35页 |
·结果 | 第35-43页 |
·一致序列的跨膜区 | 第35-36页 |
·生物胺受体各家族的保守性 | 第36-39页 |
·特异性阈值和序列数目之间的关系 | 第39-41页 |
·全局功能位点 | 第41页 |
·子家族特有的功能位点 | 第41-43页 |
·讨论 | 第43-50页 |
·全局功能位点分析 | 第43-45页 |
·子家族特有功能位点分析 | 第45-49页 |
·预测方法和性能分析 | 第49-50页 |
·GPCRs其它家族功能位点 | 第50页 |
·本章总结 | 第50-51页 |
第三章 G蛋白偶联受体功能性SNPs的预测 | 第51-94页 |
·前言 | 第51-54页 |
·材料和方法 | 第54-68页 |
·数据集 | 第54-55页 |
·预测属性 | 第55-58页 |
·预测方法 | 第58-65页 |
·单个属性预测能力 | 第65页 |
·最优属性子集的选择 | 第65-67页 |
·搜索策略 | 第67页 |
·算法性能评价 | 第67-68页 |
·结果 | 第68-91页 |
·功能性突变和非功能性突变在属性上的分布 | 第68-72页 |
·单个属性的预测能力分析 | 第72-73页 |
·最优属性子集 | 第73-75页 |
·最优属性子集的验证 | 第75-76页 |
·决策树算法与wrapper属性子集的泛化性能 | 第76-77页 |
·功能性SNPs的规则库 | 第77-82页 |
·GPCRs中的功能性SNPs | 第82-88页 |
·不同家族功能性SNPs的分布 | 第88-91页 |
·讨论 | 第91-93页 |
·本章总结 | 第93-94页 |
第四章 结论与展望 | 第94-97页 |
·结论 | 第94-95页 |
·展望 | 第95-97页 |
参考文献 | 第97-107页 |
附录:GPCRs其它家族的功能位点 | 第107-115页 |
1.肽类受体家族功能位点 | 第107-112页 |
2.激素受体家族功能位点 | 第112-113页 |
3.前列腺素受体家族功能位点 | 第113-114页 |
4.核苷类受体家族功能位点 | 第114-115页 |
攻读博士学位期间发表的论文 | 第115-116页 |
致谢 | 第116-117页 |