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小分子与DNA凸起结构的作用和高效DNA酶的筛选

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
目录第9-13页
符号说明第13-14页
第一部分 小分子化合物与DNA凸起结构的作用第14-117页
 第一章 引言第15-54页
   ·DNA结构第15-20页
     ·DNA的二级结构第16-20页
   ·核酸凸起结构第20-26页
   ·小分子与DNA的相互作用第26-33页
     ·小分子与DNA的作用方式第26-28页
     ·小分子与DNA相互作用的研究方式第28-33页
   ·Triplet repeat序列体外复制第33-54页
     ·以质粒DNA为模板研究DNA聚合酶的暂停(pause)现象第33-37页
     ·Triplet repeat寡合苷酸的体外复制第37-49页
     ·小分子化合物对Triplet repeat寡合苷酸体外复制的影响第49-54页
 第二章 小分子与DNA凸起结构的结合作用第54-71页
   ·实验试剂及仪器第54-55页
     ·溶液及其配制第54-55页
     ·分析仪器第55页
   ·实验方法第55-57页
     ·含有凸起结构的寡核苷酸的设计、合成、纯化、定量第55-56页
     ·熔炼温度的测定第56页
     ·圆二色谱的测定第56页
     ·荧光光谱的测定第56-57页
     ·SPR测定第57页
   ·实验结果及讨论第57-69页
     ·联萘酚氨基糖化合物与核酸凸起结构的选择性结合测定第57-60页
     ·吩噻嗪氨基糖化合物与核酸凸起结构的选择性结合测定第60-68页
     ·讨论第68-69页
   ·结论第69-71页
 第三章 小分子对triplet repeat体外复制的调控第71-109页
   ·实验试剂及仪器第71-73页
     ·溶液及其配制第71-72页
     ·仪器第72-73页
     ·生物酶类第73页
     ·其他第73页
   ·实验方法第73-76页
     ·寡合苷酸的标记第73页
     ·寡合苷酸的退火第73页
     ·体外复制反应第73-74页
     ·反应的终止第74页
     ·电泳第74页
     ·结果检测第74页
     ·普通转化(CaCl_2)第74-75页
     ·克隆测序第75-76页
   ·实验结果及讨论第76-107页
     ·联萘酚氨基糖化合物对triplet repeat体外复制的促进作用第76-79页
     ·吩噻嗪氨基糖化合物对triplet repeat体外复制的促进作用第79-80页
     ·偶氮苯氨基糖化合物对triplet repeat体外复制的调控作用第80-82页
     ·Triplet repeat体外复制的性质研究第82-98页
     ·不同的小分子化合物对Triplet repeat体外复制的促进作用第98-103页
     ·讨论第103-107页
   ·结论第107-109页
 第四章 总结第109-111页
 参考文献第111-117页
第二部分 高效DNA酶的筛选第117-174页
 第一章 引言第118-150页
   ·Deoxyribozyme简介第118-121页
   ·Deoxyribozyme的分类第121-140页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶第121-130页
     ·具有DNA切割活性的DNA酶第130-134页
     ·具有金属化和氧化活性的DNA酶第134-136页
     ·具有自身修饰活性的DNA酶第136-140页
   ·Deoxyribozyme的应用第140-150页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶在体外作为RNA限制性酶第140-141页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶在体内切割mRNA第141-143页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶作为传感器的应用第143-144页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶的其它应用第144-145页
     ·具有RNA切割活性的DNA酶的药物应用第145-147页
     ·具有非天然碱基的RNA切割DNA酶第147页
     ·存在的问题与展望第147-150页
 第二章 高效DNAzyme的筛选第150-165页
   ·实验试剂及仪器第150-152页
     ·溶液及其配置第150-151页
     ·仪器第151-152页
     ·生物酶类第152页
     ·DNA序列第152页
     ·其他第152页
   ·实验方法第152-156页
     ·寡合苷酸库的磷酸化第152-153页
     ·寡合苷酸库与底物和模板退火连接第153页
     ·单链寡合苷酸库和底物的分离第153页
     ·DNA酶的筛选反应第153-154页
     ·DNA酶与未反应的DNA的分离第154页
     ·PCR1,PCR2第154页
     ·寡核苷酸库的获得第154-155页
     ·TBAF的处理2'-OH保护基第155页
     ·Neutravidin固相载体进行酶筛选反应第155-156页
   ·实验结果与讨论第156-165页
     ·筛选过程第156-160页
     ·DNA酶的结构和酶学性质第160-163页
     ·讨论第163-165页
 第三章 结论第165-166页
 参考文献第166-174页
总结论第174-176页
致谢第176-177页
附录第177-181页
 附录1:联萘酚氨基糖的原始荧光数据第177-179页
 附录2:质粒pUC19的多克隆位点第179页
 附录3:ATT重复的重复单克隆的测序结果第179页
 附录4:测序得到的DNA酶的阳性克隆第179-181页
个人简历及在学期间发表的学术论文与研究成果第181-182页
 个人简历第181页
 在学期间发表的学术论文与研究成果第181-182页

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