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西北干旱半干旱地区骆驼刺、黄芪及外来物种—刺槐根瘤菌多样性和系统发育研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-13页
第一章 文献综述第13-42页
   ·生物固氮简介和意义第13页
   ·根瘤菌分类及多样性研究进展第13-21页
     ·早期根瘤菌的分类系统及分类地位第14页
     ·现代根瘤菌的分类及研究进展第14-21页
   ·根瘤菌多样性研究进展与方法第21-28页
     ·生物多样性概念及意义第21-22页
     ·国内外根瘤菌多样性研究进展第22页
     ·根瘤菌的表型多样性及研究方法第22-25页
     ·根瘤菌的遗传多样性及研究方法第25-28页
   ·干旱地区和极端环境下豆科植物与根瘤菌共生体固氮第28-32页
     ·盐和渗透压力第29-30页
     ·土壤水分不足第30页
     ·高温与热胁迫第30-31页
     ·土壤酸碱第31页
     ·养分含量第31-32页
   ·野生豆科植物根瘤菌及其共生固氮第32-34页
     ·野生豆科植物根瘤菌固氮体系及共生固氮第32页
     ·野生豆科植物根瘤菌的多样性及分类第32-34页
   ·本研究的立题依据和研究意义第34-42页
     ·西北干旱及半干旱地区特点第34-35页
     ·西北地区生态环境和豆科植物生态意义第35-36页
     ·西北地区根瘤菌资源研究概况第36页
     ·西北地区骆驼刺及其根瘤菌研究概况第36-38页
     ·黄芪豆科植物及其根瘤菌研究概况第38-40页
     ·西北地区刺槐及其根瘤菌研究概况第40-42页
第二章 骆驼刺根瘤菌多样性及系统发育研究第42-67页
   ·材料与方法第42-43页
     ·菌株来源第42页
     ·DNA 样品准备与提取第42-43页
   ·16S RDNA、NODA、NODC 和NIFH 基因的PCR-RFLP 分析第43-46页
     ·PCR 与酶切第43-45页
     ·PCR-RFLP 结果与分析第45-46页
   ·16S RDNA 和持家基因(GLNA、DNAJ、RECA 和GLNA 基因)全序列分析第46-52页
     ·方法第46页
     ·序列分析及系统发育树的构建第46-47页
     ·16S rDNA 系统发育分析第47页
     ·dnaK 基因系统发育分析第47-49页
     ·dnaJ 基因系统发育分析第49-51页
     ·recA 基因系统发育分析第51-52页
     ·glnA 基因系统发育分析第52页
   ·脂肪酸组成分析(FAME)第52-57页
     ·提取方法第52-54页
     ·分析方法第54页
     ·全细胞脂肪酸组成结果与分析第54-57页
   ·共生基因(NODA、NODC、NIFH 基因)序列分析第57-60页
     ·方法第57页
     ·nodA 基因系统发育分析第57页
     ·nodC 基因系统发育分析第57-59页
     ·nifH 基因系统发育分析第59-60页
   ·G+CMOL%和TM 测定第60-62页
     ·菌体准备第60页
     ·大量DNA 提取步骤第60-61页
     ·DNA 纯度及浓度检测第61页
     ·G+Cmol%测定第61页
     ·Tm 值的测定第61页
     ·G+Cmol%和Tm 结果与分析第61-62页
   ·DNA-DNA 同源性分析第62-64页
     ·DNA-DNA 杂交方法第62页
     ·DNA-DNA 同源性结果与分析第62-64页
   ·形态测定第64-65页
   ·小结与讨论第65-67页
     ·骆驼刺根瘤菌的系统发育第65页
     ·多种持家基因在分类研究中的应用第65页
     ·基因进化与转移第65-66页
     ·骆驼刺根瘤菌共生固氮重要性第66-67页
第三章 西北地区黄芪根瘤菌多样性及其分布研究第67-80页
   ·材料与方法第67-68页
     ·试验菌株第67页
     ·16S rDNA、nodA、nodC 和nifH 基因多态性分析(PCR-RFLP)第67页
     ·16S rDNA 和nodC 基因系统分析第67-68页
     ·结瘤试验及植物实验统计第68页
   ·16S RDNA、NODA、NODC 和NIFH 基因PCR-RFLP 结果分析第68-71页
     ·试验菌株第68-71页
     ·16S rRNA、nodA、nodC 和nifH 的扩增情况第71页
     ·16S rRNA PCR-RFLP 分析第71页
     ·共生基因的PCR-RFLP 分析第71页
   ·16S RDNA 测序及序列分析第71-72页
   ·NODC 基因系统发育分析第72-75页
   ·结瘤试验及植物生长量统计结果与分析第75-77页
     ·黄芪根瘤菌的寄主范围第75-76页
     ·接种植物生长量的统计结果与分析第76-77页
   ·结果与讨论第77-80页
     ·黄芪根瘤菌的多样性第77-78页
     ·共生基因多样性与基因转移的关系第78页
     ·黄芪根瘤菌的起源及黄河水灌溉对根瘤菌的分布影响第78-80页
第四章 入侵植物刺槐根瘤菌与美洲、欧洲刺槐根瘤菌系统发育关系第80-88页
   ·材料与方法第80页
     ·菌株分离与互接第80页
     ·16S rDNA、nodA、nodC 和nifH 基因多态性分析(PCR-RFLP)第80页
     ·16S rDNA、nodA、nodC 和nifH 基因系统发育树的建立第80页
   ·PCR-RFLP 结果与分析第80页
   ·16S RDNA、NODA、NODC 和NIFH 基因系统发育分析第80-81页
     ·16S rDNA 系统发育分析第80-81页
     ·共生基因nodA、nodC 和nifH 系统发育分析第81页
   ·刺槐根瘤菌的多样性第81-86页
   ·基因转移与刺槐根瘤菌的进化第86-87页
   ·入侵植物刺槐的共生关系及其起源第87-88页
第五章 西北地区骆驼刺、黄芪和刺槐根瘤菌之间的系统发育关系第88-91页
   ·骆驼刺、黄芪和刺槐根瘤菌之间的16S RRNA 系统发育关系第88-90页
   ·骆驼刺、黄芪和刺槐根瘤菌之间的NODC 基因系统发育关系第90-91页
参考文献第91-108页
附录1第108-109页
附录2第109-112页
缩略词(ABBREVIATIONS)第112-113页
致谢第113-114页
作者简介第114页

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