| 摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-16页 |
| 论文创新之处 | 第16-18页 |
| 第一章 计算机辅助药物设计在激酶抑制剂设计中的应用 | 第18-71页 |
| ·蛋白激酶及其抑制剂概述 | 第18-26页 |
| ·蛋白激酶的分类 | 第18-19页 |
| ·蛋白激酶的结构 | 第19-22页 |
| ·蛋白激酶的主要结构元件 | 第19-20页 |
| ·蛋白激酶活性口袋结构 | 第20-22页 |
| ·蛋白激酶抑制剂研究进展 | 第22-26页 |
| ·蛋白激酶抑制剂骨架结构 | 第22-23页 |
| ·选择性ATP-竞争性蛋白激酶抑制的研究进展 | 第23-25页 |
| ·多靶点的ATP-竞争性蛋白激酶抑制研究进展 | 第25-26页 |
| ·计算机辅助药物设计方法 | 第26-50页 |
| ·计算机辅助药物设计概述 | 第26-28页 |
| ·定量构效关系方法 | 第28-42页 |
| ·二维定量构效关系方法 | 第28-30页 |
| ·三维定量构效关系方法 | 第30-34页 |
| ·高维定量构效关系方法 | 第34页 |
| ·QSAR研究中常用的分子参数 | 第34页 |
| ·定量构效关系研究过程 | 第34-42页 |
| ·分子对接方法 | 第42-46页 |
| ·分子对接的理论基础 | 第42-43页 |
| ·分子对接方法的分类 | 第43页 |
| ·常用的分子对接方法 | 第43-46页 |
| ·药效团模型方法 | 第46-50页 |
| ·药效团模型的表达 | 第46-48页 |
| ·药效团模型识别的基本步骤 | 第48-49页 |
| ·常用的药效团模型识别软件 | 第49-50页 |
| ·药效团模型的应用 | 第50页 |
| ·计算机辅助药物设计在蛋白激酶抑制剂研究中的应用 | 第50-52页 |
| ·定量构效关系方法的应用 | 第50-51页 |
| ·分子对接方法的应用 | 第51-52页 |
| ·药效团方法的应用 | 第52页 |
| ·展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-71页 |
| 第二章 氨基噻唑类Aurora-A激酶抑制剂的QSAR研究 | 第71-93页 |
| ·引言 | 第71-72页 |
| ·材料与方法 | 第72-75页 |
| ·数据集 | 第72-73页 |
| ·分子构建 | 第73页 |
| ·2D-QSAR建模 | 第73-75页 |
| ·3D-QSAR建模 | 第75页 |
| ·结果与讨论 | 第75-86页 |
| ·2D-QSAR结果 | 第75-79页 |
| ·3D-QSAR结果 | 第79-86页 |
| ·结论 | 第86页 |
| 参考文献 | 第86-93页 |
| 第三章 基于分子对接和3D-QSAR的Rho激酶抑制剂的分子模拟研究 | 第93-116页 |
| ·引言 | 第93页 |
| ·材料与方法 | 第93-96页 |
| ·数据集 | 第93-96页 |
| ·配体预备 | 第96页 |
| ·分子对接 | 第96页 |
| ·CoMFA和CoMSIA建模和验证 | 第96页 |
| ·结果与讨论 | 第96-111页 |
| ·分子对接 | 第96-102页 |
| ·对接可信度的验证 | 第96-97页 |
| ·对接结果 | 第97-102页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型 | 第102-111页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果 | 第102-106页 |
| ·CoMFA和CoMSIA等势面图 | 第106-111页 |
| ·基于CoMSIA模型的分子设计 | 第111页 |
| ·结论 | 第111页 |
| 参考文献 | 第111-116页 |
| 第四章 EphB4激酶抑制剂的分子模拟研究 | 第116-136页 |
| ·引言 | 第116页 |
| ·材料与方法 | 第116-120页 |
| ·数据集 | 第116-118页 |
| ·配体预备 | 第118-119页 |
| ·分子对接 | 第119页 |
| ·药效团模型 | 第119页 |
| ·CoMFA和CoMSIA建模和验证 | 第119-120页 |
| ·结果与讨论 | 第120-132页 |
| ·分子对接 | 第120-121页 |
| ·对接可信度的验证 | 第120页 |
| ·对接结果 | 第120-121页 |
| ·药效团模型结果 | 第121-125页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型 | 第125-132页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果 | 第125-130页 |
| ·CoMFA和CoMSIA等势面图 | 第130-132页 |
| ·结论 | 第132页 |
| 参考文献 | 第132-136页 |
| 第五章 分子模拟方法在B-RAF激酶V600E突变体抑制剂研究中的应用 | 第136-163页 |
| ·引言 | 第136-137页 |
| ·材料与方法 | 第137-143页 |
| ·数据集 | 第137-142页 |
| ·配体预备 | 第142页 |
| ·分子对接 | 第142页 |
| ·药效团模型 | 第142-143页 |
| ·CoMFA和CoMSIA建模和验证 | 第143页 |
| ·结果与讨论 | 第143-157页 |
| ·分子对接 | 第143-146页 |
| ·对接可信度的验证 | 第143-144页 |
| ·对接结果 | 第144-146页 |
| ·药效团模型结果 | 第146-149页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型 | 第149-157页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果 | 第149-154页 |
| ·CoMFA和CoMSIA等势面图 | 第154-157页 |
| ·结论 | 第157页 |
| 参考文献 | 第157-163页 |
| 第六章 基于分子对接和2D-QSAR的MK-2激酶抑制剂的研究 | 第163-178页 |
| ·引言 | 第163页 |
| ·材料与方法 | 第163-169页 |
| ·数据集 | 第163-168页 |
| ·分子构建 | 第168页 |
| ·分子对接 | 第168页 |
| ·2D-QSAR建模与检验 | 第168-169页 |
| ·结果与讨论 | 第169-175页 |
| ·分子对接结果 | 第169-170页 |
| ·2D-QSAR结果 | 第170-175页 |
| ·结论 | 第175页 |
| 参考文献 | 第175-178页 |
| 第七章 AP-1和NF-κB介导的转录活化作用抑制剂的3D-QSAR研究 | 第178-198页 |
| ·引言 | 第178页 |
| ·材料与方法 | 第178-183页 |
| ·数据集 | 第178-182页 |
| ·分子构建 | 第182页 |
| ·CoMFA和CoMSIA建模 | 第182-183页 |
| ·结果与讨论 | 第183-193页 |
| ·CoMFA和CoMSIA统计结果 | 第183-187页 |
| ·CoMFA等势面图 | 第187-189页 |
| ·CoMSIA等势面图 | 第189-193页 |
| ·结论 | 第193页 |
| 参考文献 | 第193-198页 |
| 在读期间发表论文 | 第198-201页 |
| 作者简介 | 第201-202页 |
| 致谢 | 第202-203页 |
