| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-62页 |
| 1 内生真菌的定义、分类及"生物勘探"概况 | 第16-20页 |
| ·内生真菌的定义及其与菌根真菌的区别 | 第16-17页 |
| ·内生真菌的分类 | 第17-18页 |
| ·内生真菌生物勘探研究概况 | 第18-20页 |
| 2 全球真菌多样性概况 | 第20页 |
| 3 植物内生真菌的种类组成 | 第20-21页 |
| 4 内生真菌种群结构特征、总体分布格局和多样性特点 | 第21-28页 |
| ·内生真菌分布的一般特点 | 第21-22页 |
| ·DSEs根系内生真菌的一般生物学特征 | 第22-24页 |
| ·兰科植物根系内生真菌 | 第24-25页 |
| ·叶片内生真菌种群结构和整体分布格局 | 第25-28页 |
| 5 植物与内生真菌互作的生理与分子机制 | 第28-42页 |
| ·内生真菌种群结构是否促进植物进化 | 第29页 |
| ·内生真菌侵染宿主的形态学、生理学机制及双方各自的生理反应 | 第29-31页 |
| ·内生真菌改变植物生理代谢并增强宿主抗逆性的现象和机制分析 | 第31-37页 |
| ·内生真菌—植物互作体系中的重要分子元件及调控机制 | 第37-38页 |
| ·内生真菌对宿主表型的可塑性 | 第38-39页 |
| ·菌根真菌、内生真菌和植物三者之间的关联 | 第39-41页 |
| ·真菌病毒和细菌在内生真菌—植物互作过程中的可能角色 | 第41页 |
| ·展望 | 第41-42页 |
| 6 植物内生真菌染色观察、分离培养鉴定和分子检测 | 第42-56页 |
| ·显微镜法直接观察内生真菌在宿主组织中的侵染结构和分布特征 | 第42-44页 |
| ·内生真菌分离培养技术 | 第44-50页 |
| ·内生真菌的鉴定方法 | 第50-52页 |
| ·环境PCR方法(免培方法)研究内生真菌的生物多样性 | 第52-56页 |
| 7 内生真菌与寄主植物互作研究中的一般原则和方法 | 第56-60页 |
| ·研究内生真菌与植物互作模型中植物与真菌材料的选择 | 第57页 |
| ·筛选功能性内生真菌应用于农作物的几个原则 | 第57-58页 |
| ·植物与内生真菌互作研究中的技术和方法 | 第58-60页 |
| 8 本研究的立题依据、研究目的和研究内容 | 第60-62页 |
| 第二章 疣粒野生稻内生真菌的组织学观察 | 第62-69页 |
| 1 材料和方法 | 第62-63页 |
| ·样品采集和生境特点 | 第62页 |
| ·样品前处理 | 第62页 |
| ·光学显微镜染色观察 | 第62-63页 |
| ·低温冷冻扫描电镜观察法 | 第63页 |
| 2 结果和讨论 | 第63-69页 |
| ·疣粒野生稻生境特点 | 第63-64页 |
| ·光学显微镜、扫描电镜观察植物组织内的内生真菌 | 第64-69页 |
| 第三章 疣粒野生稻内生真菌的分离培养、鉴定和多样性分析 | 第69-93页 |
| 1 材料方法 | 第69-72页 |
| ·样品采集和前处理 | 第69页 |
| ·内生真菌分离培养 | 第69-70页 |
| ·内生真菌形态学、分子生物学鉴定 | 第70-71页 |
| ·内生真菌菌株保存 | 第71页 |
| ·相关类群真菌的分子系统发育分析 | 第71-72页 |
| ·内生真菌生物多样性评价:生态学参数计算及物种累加曲线预测 | 第72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-89页 |
| ·疣粒野生稻内生真菌的种类组成、种群结构和年度变化 | 第72-83页 |
| ·疣粒野生稻内生真菌生物多样性参数计算及物种累加曲线预测 | 第83-89页 |
| 3 讨论 | 第89-93页 |
| 第四章 结合培养和环境PCR方法评价疣粒野生稻根系内生真菌的多样性特征 | 第93-107页 |
| 1 材料方法 | 第93-96页 |
| ·样品采集及分离培养内生真菌(同第二章内容) | 第93页 |
| ·根系样品制备及总基因组提取 | 第93-94页 |
| ·筛选扩增植物基因组中真菌特异性ITS片段的引物 | 第94-95页 |
| ·内生真菌ITS片段克隆库构建 | 第95页 |
| ·克隆序列和系统发育分析 | 第95-96页 |
| ·多样性参数计算及物种累加曲线预测 | 第96页 |
| 2 结果与分析 | 第96-98页 |
| ·PCR扩增根系基因组中真菌特异性ITS片段及克隆库构建 | 第96-97页 |
| ·克隆序列及系统发育分析 | 第97-98页 |
| ·比较培养方法、直接PCR方法对根系内生真菌生物多样性的评价 | 第98页 |
| 3 讨论 | 第98-107页 |
| 第五章 疣粒野生稻内生真菌两新种鉴定 | 第107-124页 |
| 第一节 疣粒野生稻根系内生真菌一新种—稻镰状瓶霉 | 第107-115页 |
| 1 研究材料和方法 | 第107页 |
| ·内生真菌纯培养物 | 第107页 |
| ·形态学观察及系统发育分析 | 第107页 |
| 2 结果与分析 | 第107-111页 |
| ·稻镰状瓶霉(Harpophora oryzae)与巨座壳科(Magnaporthaceae)相关属真菌的系统发育分析 | 第107-109页 |
| ·稻镰状瓶霉(Harpophora oryzae)的基本培养性状和形态学特征 | 第109-111页 |
| 3 讨论 | 第111-115页 |
| 第二节 疣粒野生稻茎杆内生真菌一新种—云南产气霉 | 第115-124页 |
| 1 研究材料和方法 | 第115-116页 |
| ·内生真菌纯培养物 | 第115页 |
| ·形态学特征 | 第115页 |
| ·分子系统发育分析 | 第115-116页 |
| 2 结果与分析 | 第116-119页 |
| ·云南产气霉(Muscodor yunnanense)培养性状与特征 | 第116-117页 |
| ·云南产气霉菌株的分子系统发育分析 | 第117-119页 |
| 3 讨论 | 第119-124页 |
| 第六章 稻镰状瓶霉、产气霉和无毒双核丝核菌生物学功能的初步研究 | 第124-135页 |
| 1 研究材料和方法 | 第124-126页 |
| ·内生真菌菌株 | 第124页 |
| ·稻镰状瓶霉(Harpophora oryzae)与栽培水稻(Oryza sativa L.)的共培养体系建立及其对水稻幼苗的促生效应 | 第124-125页 |
| ·产气霉(Muscodor spp.)产生的挥发性气体的抑菌活性评价 | 第125页 |
| ·用固相微萃取(SPME)与气相色谱、质谱(GC-MS)联用分析产气霉的抑菌气体成分 | 第125-126页 |
| ·无毒双核丝核菌(Rhizoctonia sp.)抗水稻纹枯病菌体外接种试验 | 第126页 |
| 2 结果分析 | 第126-128页 |
| ·稻镰状瓶霉(Harpophora oryzae)对栽培水稻的促生效应 | 第126-128页 |
| ·产气霉(Muscodor spp.)产生的挥发性气体及其抑菌活性分析 | 第128页 |
| ·无毒双核丝核菌(Rhizoctonia sp.)抗水稻纹枯病菌 | 第128页 |
| 3 讨论 | 第128-135页 |
| 第七章 全文总结、今后工作与展望 | 第135-140页 |
| 1 全文总结 | 第135-137页 |
| 2 今后拟开展的工作 | 第137-140页 |
| ·稻镰状瓶霉功能基因组学研究 | 第137页 |
| ·优化分离培养体系获得种类更丰富的野生稻内生真菌 | 第137-138页 |
| ·建立一套简易的鉴定内生真菌诱导水稻产生抗性的技术方法 | 第138页 |
| ·产气栎生青霉(Penicillium glandicola)的生态学功能研究 | 第138-140页 |
| 参考文献 | 第140-176页 |
| 附录 | 第176-177页 |
| 致谢 | 第177页 |
