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HDAC1调控肠道干细胞标志基因表达及MicroRNA-31在结肠肿瘤中作用的研究

中文摘要 1第4-5页
Abstract 1第5-7页
中文摘要 2第7-8页
Abstract 2第8-12页
缩略词中英文对照第12-14页
第一章 HDAC1 调节肠道上皮细胞中干细胞标志基因的表达第14-58页
    1.1 引言第14-23页
        1.1.1 消化道生理第14-15页
        1.1.2 肠道干细胞(ISC)第15-19页
        1.1.3 肠道上皮中的信号通路第19-20页
        1.1.4 HDAC在肠道上皮中的作用第20-21页
        1.1.5 超级增强子第21-22页
        1.1.6 本课题的研究目的和意义第22-23页
    1.2 实验材料第23-26页
        1.2.1 实验动物第23页
        1.2.2 试剂第23-26页
        1.2.3 设备第26页
    1.3 实验方法第26-40页
        1.3.1 小鼠结肠上皮细胞培养第26-27页
        1.3.2 小鼠原代角质形成细胞分离第27-28页
        1.3.3 细胞药物处理第28页
        1.3.4 RNA的提取与定量:第28-30页
        1.3.5 Wnt-3a条件培养基第30-31页
        1.3.6 Wnt/β-catenin信号通路活性检测第31-32页
        1.3.7 染色质免疫共沉淀(ChIP)第32-34页
        1.3.8 免疫荧光染色(IF)第34-35页
        1.3.9 Western Blot第35-38页
        1.3.10 组织化学染色第38-39页
        1.3.11 数据分析第39-40页
    1.4 结果第40-50页
        1.4.1 结肠上皮细胞的原代培养和鉴定第40-41页
        1.4.2 TSA处理影响干细胞标志基因的表达第41页
        1.4.3 TSA处理增加Lgr5、Ascl2、Tnfrsf19 启动子区域H3K27 乙酰化水平第41-43页
        1.4.4 HDAC1 调节干细胞标志基因的表达第43-44页
        1.4.5 抑制HDAC1 增加Lgr5、Ascl2、Tnfrsf19 启动子区域H3K27 乙酰化水平第44-45页
        1.4.6 HDAC1/2 对干细胞标志基因的调节作用不依赖于Wnt信号通路第45-47页
        1.4.7 干细胞标志基因的表达需要HDAC1和CBP的协调第47-48页
        1.4.8 抑制HDAC1 影响原代角质形成细胞中Lgr5 等的表达第48-50页
    1.5 讨论第50-54页
    1.6 参考文献第54-58页
第二章 MicroRNA-31 在结肠肿瘤发生发展中的作用研究第58-114页
    2.1 引言第58-65页
        2.1.1 结直肠癌概述第58-60页
        2.1.2 MicroRNA概述第60-62页
        2.1.3 miR-31 概述第62-64页
        2.1.4 本课题的研究目的和意义第64-65页
    2.2 实验材料第65-71页
        2.2.1 实验动物第65-68页
        2.2.2 试剂第68-71页
        2.2.3 仪器第71页
    2.3 实验方法第71-93页
        2.3.1 细胞培养第71-72页
        2.3.2 小鼠基因型鉴定第72-73页
        2.3.3 结肠炎和肠炎相关肠癌的诱导第73页
        2.3.4 RNA的提取与定量:第73-77页
        2.3.5 小鼠肠道上皮细胞富集第77页
        2.3.6 miRNA原位杂交[143]第77-81页
        2.3.7 快速cDNA末端扩增第81-83页
        2.3.8 pcDNA3.1 过表达载体的构建第83-85页
        2.3.9 启动子甲基化分析第85-87页
        2.3.10 他莫西芬诱导CreER小鼠基因组重组第87-88页
        2.3.11 TALEN构建MIR31 敲除细胞株第88-91页
        2.3.12 Transwell检测肿瘤细胞迁移第91-92页
        2.3.13 统计学分析第92-93页
    2.4 结果第93-107页
        2.4.1 miR-31 在小鼠各器官中的表达第93-94页
        2.4.2 miR-31在DSS诱导的结肠炎中表达升高第94-95页
        2.4.3 miR-31 在小鼠结肠肿瘤中表达显著上升第95-97页
        2.4.4 原位杂交显示mi R-31 由肿瘤细胞表达第97-98页
        2.4.5 miR-31 在人结肠癌中表达升高第98-99页
        2.4.6 RACE阐明小鼠Mir31hg结构第99-101页
        2.4.7 肿瘤发生过程中Mir31hg启动子Cp G岛甲基化状态保持不变第101-102页
        2.4.8 敲除Mir31 对肠炎和肠道肿瘤发生的影响第102-105页
        2.4.9 敲除Mir31 促进肿瘤细胞迁移第105-107页
    2.5 讨论第107-110页
        2.5.1 miR-31 作为上皮组织特异性的mi RNA在结肠癌中表达上升第107-108页
        2.5.2 Mir31hg基因第108页
        2.5.3 miR-31 抑制结肠肿瘤的发生第108-110页
    2.6 参考文献第110-114页
附录第114-125页
    附1 本论文中用到的常用试剂和缓冲液第114-121页
    附2 本论文中所用到的寡核苷酸序列第121-123页
    附3 Mir31hg成熟转录本序列第123-125页
致谢第125-127页
博士期间发表论文第127页

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