| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 文献综述 | 第9-17页 |
| 1.1 造礁石珊瑚概述 | 第9-10页 |
| 1.1.1 造礁石珊瑚的分布和现状 | 第9-10页 |
| 1.1.2 鹿角珊瑚的分布和现状 | 第10页 |
| 1.2 造礁石珊瑚的分类研究 | 第10-12页 |
| 1.2.1 造礁石珊瑚的形态分类及局限性 | 第10-11页 |
| 1.2.2 鹿角珊瑚属的形态及分类 | 第11-12页 |
| 1.3 DNA条形码 | 第12-14页 |
| 1.3.1 DNA条形码的分类原理及流程 | 第12-13页 |
| 1.3.2 DNA条形码的优势与选择 | 第13页 |
| 1.3.3 DNA条形码在分类中的应用 | 第13-14页 |
| 1.4 造礁石珊瑚的分子系统学研究 | 第14-16页 |
| 1.4.1 基于核DNA标记的造礁石珊瑚分子系统学研究 | 第15页 |
| 1.4.2 基于线粒体DNA标记的造礁分子系统学研究 | 第15-16页 |
| 1.4.3 鹿角珊瑚属的分子系统学研究进展 | 第16页 |
| 1.5 研究的目的及意义 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-22页 |
| 2.1 样品的采集 | 第17页 |
| 2.2 样本形态学初步鉴定 | 第17-21页 |
| 2.2.1 光镜下形态学分析 | 第17-20页 |
| 2.2.2 电镜下形态学分析 | 第20-21页 |
| 2.3 基因组DNA提取及目标序列片段的PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第21页 |
| 2.3.2 PCR引物 | 第21页 |
| 2.3.3 PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.4 序列分析和系统进化分析 | 第22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-37页 |
| 3.1 鹿角珊瑚形态学鉴定 | 第22-25页 |
| 3.2 序列分析 | 第25-30页 |
| 3.2.1 基因片段序列长度及测序结果 | 第25页 |
| 3.2.2 基于4种DNA分子标记的序列遗传多样性分析 | 第25-28页 |
| 3.2.3 基于4种DNA分子标记的遗传距离分析 | 第28-30页 |
| 3.3 系统进化分析 | 第30-37页 |
| 3.3.1 PaxC系统进化分析 | 第30-31页 |
| 3.3.2 ITS系统进化分析 | 第31-32页 |
| 3.3.3 线粒体系统进化分析 | 第32-37页 |
| 4 讨论 | 第37-41页 |
| 4.1 遗传多样性研究 | 第37页 |
| 4.2 不同分子标记适用于不同的分类阶元 | 第37-38页 |
| 4.3 鹿角珊瑚属的杂交和基因渗透研究 | 第38-40页 |
| 4.4 PAXC作为DNA条形码的适用性及测序方法分析 | 第40-41页 |
| 5 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-53页 |
| 致谢 | 第53页 |
