黄瓜EST-SSR特征分析及标记开发
| 中文摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-17页 |
| 1 遗传标记概述 | 第7-15页 |
| 1.1 形态标记 | 第7页 |
| 1.2 细胞学标记 | 第7-8页 |
| 1.3 生物化学标记 | 第8页 |
| 1.4 分子标记 | 第8-15页 |
| 1.4.1 RFLP标记 | 第9页 |
| 1.4.2 RAPD标记 | 第9-10页 |
| 1.4.3 AFLP标记 | 第10页 |
| 1.4.4 SNP标记 | 第10页 |
| 1.4.5 SSR标记 | 第10-15页 |
| 2 黄瓜遗传标记应用的研究概况 | 第15-16页 |
| 2.1 遗传图谱 | 第15页 |
| 2.2 种质资源及遗传多样性 | 第15-16页 |
| 2.3 相关基因的定位 | 第16页 |
| 3 本实验的研究目的和意义 | 第16页 |
| 4 研究技术路线图 | 第16-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-21页 |
| 1 材料 | 第17页 |
| 2 实验方法 | 第17-21页 |
| 2.1 EST-SSR的查找 | 第17页 |
| 2.2 EST-SSR引物的设计 | 第17页 |
| 2.3 DNA提取 | 第17-18页 |
| 2.4 PCR扩增 | 第18页 |
| 2.4.1 SSR反应体系 | 第18页 |
| 2.4.2 PCR扩增程序 | 第18页 |
| 2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第18-19页 |
| 2.5.1 制备电泳所用的胶 | 第18-19页 |
| 2.5.2 上样及电泳 | 第19页 |
| 2.5.3 银染 | 第19页 |
| 2.6 聚类分析 | 第19-20页 |
| 2.7 染色体定位 | 第20页 |
| 2.8 基因功能分析 | 第20-21页 |
| 第三章 结果与分析 | 第21-30页 |
| 1 EST序列的获得、组装及SSR位点的查找 | 第21页 |
| 2 EST-SSR的频率和密度 | 第21-22页 |
| 3 EST-SSR重复基序长度的分布 | 第22页 |
| 4 EST-SSR不同重复基序类型的分布 | 第22-23页 |
| 5 EST-SSR位点序列长度的分布 | 第23-24页 |
| 6 EST-SSR基序重复次数的分布 | 第24-25页 |
| 7 引物设计 | 第25-26页 |
| 8 银染及聚类分析 | 第26-28页 |
| 8.1 银染 | 第26-27页 |
| 8.2 聚类分析 | 第27-28页 |
| 9 染色体定位 | 第28页 |
| 10 功能分析 | 第28-30页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第30-33页 |
| 1 SSR的分布特征及进化机制 | 第30-31页 |
| 1.1 SSR的分布特征 | 第30页 |
| 1.2 移码突变的选择压力 | 第30-31页 |
| 1.3 SSR位点的长度与突变方向 | 第31页 |
| 2 EST-SSR的引物设计 | 第31-32页 |
| 3 黄瓜EST-SSR的多态性 | 第32-33页 |
| 参考文献 | 第33-37页 |
| 附录 | 第37-43页 |
| 附录1 实验相关试剂的配置 | 第37-38页 |
| 附录2 常用仪器设备 | 第38-39页 |
| 附录3 EST-SSR序列 | 第39-41页 |
| 附录4 28对多态性引物表 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43页 |
