| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩写名词表 | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 高油玉米的研究进展 | 第11-15页 |
| 1.1.1 高油玉米的种质创新 | 第11-13页 |
| 1.1.2 高油玉米的遗传基础 | 第13-15页 |
| 1.2 人工选择是玉米数量性状遗传改良的有效途径 | 第15-19页 |
| 1.2.1 选择及选择信号的概念 | 第15页 |
| 1.2.2 选择信号的检测方法 | 第15-17页 |
| 1.2.3 玉米驯化和改良过程中选择信号的检测 | 第17-19页 |
| 1.3 不同群体在植物数量性状遗传基础解析中的应用 | 第19-21页 |
| 1.4 本研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-23页 |
| 2.2 田间试验 | 第23-24页 |
| 2.3 玉米籽粒脂肪酸的提取及测定 | 第24-25页 |
| 2.4 表型数据统计分析 | 第25页 |
| 2.5 基因型鉴定与分析 | 第25-28页 |
| 2.5.1 玉米基因组DNA提取方法(改良的CTAB) | 第26页 |
| 2.5.2 玉米基因组重测序 | 第26-27页 |
| 2.5.3 SNP的挖掘及分析 | 第27-28页 |
| 2.6 各性状表型遗传方差的解析 | 第28页 |
| 2.7 连锁不平衡(LD)分析 | 第28-29页 |
| 2.8 群体结构分析 | 第29-30页 |
| 2.9 全基因选择信号的检测 | 第30页 |
| 2.10 全基因组关联分析(GWAS) | 第30-32页 |
| 2.11 基因注释以及候选基因提名 | 第32页 |
| 2.12 选择信号的验证 | 第32-33页 |
| 2.13 候选基因的功能验证 | 第33-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-64页 |
| 3.1 LDHGHO群体的表型变异 | 第34-39页 |
| 3.2 基于群体的重测序以及SNP的挖掘、验证 | 第39-41页 |
| 3.3 SNP的基本统计分析 | 第41-43页 |
| 3.4 LDHGHO群体的连锁不平衡(LD)分析 | 第43-44页 |
| 3.5 LDHGHO群体结构分析 | 第44-45页 |
| 3.6 全基因组选择响应分析 | 第45-50页 |
| 3.7 LDHGHO群体中的选择模式 | 第50-51页 |
| 3.8 LDHGHO群体仍然有较大的油份提升空间 | 第51-52页 |
| 3.9 LDHGHO群体中受选择的基因 | 第52-54页 |
| 3.10 油份及各农艺性状的全基因组关联分析 | 第54-58页 |
| 3.11 选择信号与GWAS显著位点的共定位分析 | 第58-64页 |
| 第四章 讨论 | 第64-74页 |
| 4.1 LDHGHO群体与自然群体的比较 | 第64-65页 |
| 4.2 LDHGHO高油群体籽粒油份的选择响应 | 第65页 |
| 4.3 低覆盖度测序适用于杂合个体的基因型鉴定 | 第65-66页 |
| 4.4 选择响应分析结合全基因组关联分析解析复杂数量性状遗传结构 | 第66页 |
| 4.5 基于区段的LD分析发现新的油份候选基因 | 第66-69页 |
| 4.6 玉米籽粒油份累积的遗传机理 | 第69-71页 |
| 4.7 农艺性状在高油群体中对油份选择的响应 | 第71-72页 |
| 4.8 高油玉米的应用 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-83页 |
| 附录 | 第83-113页 |
| 作者简历 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114页 |
