| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1.1 动物驯化研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1.1 动物驯化的意义 | 第12页 |
| 1.1.2 研究动物驯化面临的问题 | 第12页 |
| 1.1.3 动物驯化过程研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2 高通量测序技术研究进展 | 第15-21页 |
| 1.2.1 Roche/454测序技术 | 第16-17页 |
| 1.2.2 Solexa/Illumina测序技术 | 第17-18页 |
| 1.2.3 SOLiD测序技术 | 第18-19页 |
| 1.2.4 Ion Torrent测序技术 | 第19页 |
| 1.2.5 PacBio测序技术 | 第19-20页 |
| 1.2.6 高通量测序技术的应用 | 第20-21页 |
| 1.3 鸭驯化研究进展 | 第21-22页 |
| 1.3.1 家鸭的起源 | 第21页 |
| 1.3.2 家鸭的驯化历史 | 第21-22页 |
| 1.4 鸭驯化研究的目的及意义 | 第22-24页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第24-35页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-27页 |
| 2.1.1 试验动物伦理及道德声明 | 第24页 |
| 2.1.2 试验样本 | 第24-26页 |
| 2.1.3 试验样品采集 | 第26页 |
| 2.1.4 主要试剂和溶液配制 | 第26页 |
| 2.1.5 主要试剂仪器 | 第26-27页 |
| 2.3 试验方法 | 第27-35页 |
| 2.3.1 基因组DNA提取与检测 | 第27页 |
| 2.3.2 DNA文库构建与测序 | 第27-28页 |
| 2.3.3 基因组内变异检测 | 第28-30页 |
| 2.3.4 群体遗传学分析 | 第30-32页 |
| 2.3.5 选择信号分析 | 第32页 |
| 2.3.6 核苷酸多样性分析 | 第32-33页 |
| 2.3.7 GO功能注释 | 第33页 |
| 2.3.8 RNA-seq | 第33-35页 |
| 第三章 结果 | 第35-53页 |
| 3.1 全基因组重测序和比对结果概述 | 第35-36页 |
| 3.2 全基因组遗传变异结果 | 第36-39页 |
| 3.3 群体结构与驯化 | 第39-53页 |
| 3.3.1 PCA主成分分析 | 第39-40页 |
| 3.3.2 系统发育关系分析 | 第40-41页 |
| 3.3.3 群体结构分析 | 第41-42页 |
| 3.3.4 群体统计历史重建分析 | 第42-46页 |
| 3.3.5 鸭白羽性状分析 | 第46-47页 |
| 3.3.6 其他驯化性状分析 | 第47-53页 |
| 第四章 讨论 | 第53-56页 |
| 4.1 群体结构和驯化 | 第53-54页 |
| 4.2 白羽性状的选择 | 第54页 |
| 4.3 其它驯化性状的选择 | 第54-56页 |
| 第五章 结论及创新点 | 第56-57页 |
| 结论 | 第56页 |
| 创新点 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 附录 | 第64-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 个人简历 | 第94-95页 |