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甘草水煎剂中miRNA的提取、高通量测序及对免疫细胞的影响研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
前言第11-14页
第一部分 甘草miRNA的分离与鉴定第14-21页
    引言第14页
    1 材料第14-15页
        1.1 样本第14页
        1.2 试剂第14页
        1.3 仪器第14-15页
    2 方法第15-18页
        2.1 实验样本制备第15页
        2.2 甘草miRNA提取第15-16页
        2.3 DnaseⅠ处理甘草miRNA第16-17页
        2.4 甘草miRNA电泳鉴定第17页
            2.4.1 配制 1%琼脂糖凝胶第17页
            2.4.2 上样及电泳第17页
        2.5 甘草miRNA浓度及纯度测定第17-18页
    3 结果第18-19页
        3.1 甘草粗提物制备第18页
        3.2 甘草miRNA的提取与鉴定第18-19页
        3.3 甘草miRNA的质量分析第19页
    4 讨论第19-20页
    5 小结第20-21页
第二部分 甘草miRNA测序分析及新miRNA预测第21-32页
    引言第21页
    1 材料第21页
    2 方法第21-24页
        2.1 文库构建、测序及数据分析第21-24页
            2.1.1 甘草样品小RNA建库第21-22页
            2.1.2 甘草样品小RNA高通量测序后的生物信息学分析第22-24页
    3 结果第24-29页
        3.1 原始序列的处理与统计第24-25页
        3.2 Clean序列的比对分析第25-28页
            3.2.1 sRNA与其中的非编码RNA的比对第26-27页
            3.2.2 sRNA与已知miRNA的比对第27页
            3.2.3 miRNA碱基偏向性第27页
            3.2.4 小RNA分类注释第27-28页
        3.3 新miRNA预测第28-29页
    4 讨论第29-31页
    5 小结第31-32页
第三部分 甘草miRNA对人的靶基因预测和注释第32-36页
    引言第32页
    1 靶基因的预测和GO注释第32-33页
        1.1 靶基因与预测第32页
        1.2 GO注释和富集第32-33页
    2 数据结果分析第33-34页
        2.1 靶基因预测结果分析第33页
        2.2 GO注释和富集结果分析第33-34页
    3 讨论第34-35页
    4 小结第35-36页
第四部分 甘草miRNA对人免疫细胞的影响第36-53页
    引言第36页
    1 材料第36-38页
        1.1 试剂第36页
        1.2 仪器第36-37页
        1.3 引物第37-38页
    2 方法第38-41页
        2.1 细胞水平第38页
            2.1.1 人外周血单个核细胞(PBMC)分离第38页
            2.1.2 PBMC的体外培养与处理第38页
            2.1.3 细胞形态观察与计数第38页
            2.1.4 细胞表型的流式细胞术检测第38页
        2.2 分子水平第38-41页
            2.2.1 细胞总RNA的提取第38-39页
            2.2.2 反转录聚合酶链式反应第39-40页
            2.2.3 RT-PCR法检测细胞因子表达第40-41页
            2.2.4 RT-PCR法检测细胞因子表达第41页
    3 结果第41-49页
        3.1 甘草miRNA对免疫细胞形态学的影响第41-42页
        3.2 不同处理组PBMC的增殖情况第42-43页
        3.3 甘草miRNA作用免疫细胞后的表型变化第43-44页
        3.4 甘草miRNA对免疫细胞表达转录因子和细胞因子的影响第44-49页
            3.4.1 甘草miRNA对免疫细胞表达转录因子的影响第44-46页
            3.4.2 甘草miRNA对免疫细胞表达细胞因子的影响第46-48页
            3.4.3 甘草 miRNA 对免疫细胞表达 TLR 的影响第48-49页
    4 讨论第49-52页
    5 小结第52-53页
总结第53-55页
参考文献第55-58页
附录 A 实验相关基因引物序列第58-61页
附录 B 攻读学位期间发表的论文第61-62页
致谢第62页

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