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极小单胞菌Pusillimonas sp.T2分解代谢烟酸的关键基因功能研究

致谢第5-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
符号与缩略语说明第13-14页
第一章 绪论第14-26页
    1.1 烟碱类杀虫剂第14-18页
        1.1.1 烟碱类杀虫剂的发展第14-16页
        1.1.2 烟碱类杀虫剂中间体的研究第16-18页
    1.2 烟酸和6-羟基烟酸的简介第18-20页
        1.2.1 烟酸和6-羟基烟酸的基本性质第18-19页
        1.2.2 烟酸和6-羟基烟酸的用途第19-20页
    1.3 烟酸的微生物降解的研究进展第20-23页
        1.3.1 降解烟酸的微生物种类第20-21页
        1.3.2 烟酸的微生物代谢途径及酶学研究第21-23页
    1.4 本论文研究目的、意义和主要内容第23-26页
        1.4.1 研究目的和意义第23-24页
        1.4.2 研究的主要内容第24-26页
第二章 烟酸降解菌的生长及降解特性研究第26-36页
    2.1 实验材料第26-27页
        2.1.1 菌株、试剂及仪器第26页
        2.1.2 培养基第26-27页
        2.1.3 缓冲液第27页
    2.2 实验方法第27-29页
        2.2.1 菌株T2对烟酸降解能力的初步验证第27页
        2.2.2 菌株T2种子液的制备第27页
        2.2.3 菌株T2的生物量及烟酸残留量和中间代谢产物的检测方法第27-28页
        2.2.4 外界条件对菌株T2降解特性的影响第28-29页
        2.2.5 菌株T2生长与烟酸降解关系的探究第29页
    2.3 实验结果与分析第29-34页
        2.3.1 菌株T2对烟酸的降解能力第29页
        2.3.2 pH值对菌株T2降解烟酸的影响第29-30页
        2.3.3 温度对菌株T2降解烟酸的影响第30页
        2.3.4 接种量对菌株T2降解烟酸的影响第30-31页
        2.3.5 烟酸初始浓度对菌株T2降解烟酸的影响第31-32页
        2.3.6 菌株T2对烟酸的利用第32页
        2.3.7 菌株T2降解代谢产物的鉴定第32-34页
    2.4 本章小结第34-36页
第三章 Pusillimonas sp. T2基因组测序、功能注释分析及基因比较第36-52页
    3.1 实验材料与方法第37-41页
        3.1.1 菌株,试剂与培养基第37页
        3.1.2 基因组DNA提取第37页
        3.1.3 全基因组序列上机文库的构建第37-41页
        3.1.4 生物学信息分析第41页
        3.1.5 烟酸降解关键基因的查找和生物信息学分析第41页
    3.2 结果与分析第41-51页
        3.2.1 菌株T2基因组DNA提取第41-42页
        3.2.2 测序数据统计第42页
        3.2.3 基因组序列的组装第42-43页
        3.2.4 预测基因结果第43-44页
        3.2.5 rRNA/tRNA预测结果第44-45页
        3.2.6 基因功能注释结果第45-48页
        3.2.7 烟酸代谢相关基因分析第48-51页
    3.3 本章小结第51-52页
第四章 烟酸降解关键基因nahAB_1B_2的克隆与功能鉴定第52-68页
    4.1 实验材料第52-55页
        4.1.1 菌株及实验仪器第52-53页
        4.1.2 培养基及培养条件第53页
        4.1.3 主要试剂及缓冲液第53-54页
        4.1.4 引物设计第54-55页
    4.2 实验方法第55-62页
        4.2.1 菌株T2基因组DNA提取第55页
        4.2.2 菌株T2基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测第55页
        4.2.3 质粒DNA的小量提取第55-56页
        4.2.4 Over-lap PCR构建同源重组片段第56-59页
        4.2.5 大肠杆菌感受态细胞的制备第59页
        4.2.6 表达载体的构建第59-62页
    4.3 实验结果与分析第62-66页
        4.3.1 菌株T2基因组DNA提取第62页
        4.3.2 nahA、nahAB_1和nahB_2的特异性扩增第62-63页
        4.3.3 载体pBBR-MCS2酶切第63-64页
        4.3.4 重组菌株的烟酸降解功能验证第64-66页
    4.4 本章小结第66-68页
第五章 酶学特性研究第68-78页
    5.1 实验材料第68-69页
        5.1.1 菌株、质粒及实验仪器第68-69页
        5.1.2 培养基及培养条件第69页
        5.1.3 主要试剂及缓冲液第69页
    5.2 实验方法第69-71页
        5.2.1 表达菌株的诱导与表达第69-70页
        5.2.2 蛋白的功能鉴定第70-71页
    5.3 菌株HZN7-pBBR-nahAB_1B_2粗酶液特性研究第71-72页
        5.3.1 粗酶液中蛋白含量测定第71页
        5.3.2 NahAB_1B_2的动力学参数第71-72页
        5.3.3 金属离子对酶活力的影响第72页
        5.3.4 O_2消耗检测第72页
        5.3.5 NahAB_1B_2底物特异性检测第72页
    5.4 实验结果与分析第72-77页
        5.4.1 NahAB_1B_2的活性第72-73页
        5.4.2 酶含量和酶动力学参数第73-74页
        5.4.3 金属离子对NahAB_1B_2酶活的影响第74-75页
        5.4.4 NahAB_1B_2催化反应中O_2的来源第75-76页
        5.4.5 NahAB_1B_2的底物特异性第76-77页
    5.5 本章小结第77-78页
第六章 总结与展望第78-82页
    6.1 研究内容及结论第78-79页
    6.2 创新点第79页
    6.3 不足与展望第79-82页
参考文献第82-90页
附录1: 仪器设备第90-92页
附录2: 文中所用培养基及试剂配方第92-94页
附录3: 缓冲液第94-95页
附录4: 相关DNA序列第95-100页
作者简介第100-101页
    1 作者简历第100页
    2 攻读硕士学位期间发表的学术论文第100页
    3 参与的科研项目第100-101页
学位论文数据集第101页

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