| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 综述 | 第14-25页 |
| 1 海洋疏浚物污染现状 | 第14-15页 |
| 2 海洋疏浚物管理监测 | 第15页 |
| 3 海洋疏浚物污染检测技术 | 第15-24页 |
| 3.1 基于发光细菌法生物毒性快速检测技术研究 | 第18-23页 |
| 3.1.1 发光细菌原理 | 第18-19页 |
| 3.1.2 发光细菌检测方法的产生 | 第19页 |
| 3.1.3 发光细菌在毒性检测方面的研究进展 | 第19-21页 |
| 3.1.4 发光细菌毒性测定方法 | 第21-22页 |
| 3.1.5 发光细菌法毒性等级的划分 | 第22-23页 |
| 3.2 基于数字基因表达谱测序的生物毒性快速检测技术研究 | 第23-24页 |
| 3.2.1 高通量数字基因表达谱的原理和方法 | 第23页 |
| 3.2.2 数字基因表达谱的应用 | 第23-24页 |
| 4 研究目的和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 基于发光细菌的海洋疏浚物生物毒性检测技术研究 | 第25-53页 |
| 第一节 发光细菌微孔板检测方法的建立 | 第25-34页 |
| 1 引言 | 第25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.2 实验所用试剂 | 第25页 |
| 2.3 实验所需仪器 | 第25-26页 |
| 2.4 发光细菌冻干粉的制备 | 第26-27页 |
| 2.4.1 液体培养基的制备 | 第26页 |
| 2.4.2 固体培养基的制备 | 第26页 |
| 2.4.3 菌种的扩大培养 | 第26页 |
| 2.4.4 菌种保护剂的配制 | 第26页 |
| 2.4.5 菌种冻干粉的制备 | 第26-27页 |
| 2.5 实验方法 | 第27页 |
| 2.6 数据处理与分析 | 第27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-33页 |
| 3.1 pH、测量时间、助溶剂（DMSO）对发光细菌光强度的影响 | 第27-31页 |
| 3.2 水体中总磷、总碳、总氮含量对发光细菌发光强度的影响 | 第31-33页 |
| 4 小结 | 第33-34页 |
| 第二节 基于发光细菌的海洋疏浚物特征污染物检测技术的研究 | 第34-43页 |
| 1 引言 | 第34-35页 |
| 2 实验材料与方法 | 第35页 |
| 2.1 实验材料 | 第35页 |
| 2.2 实验试剂 | 第35页 |
| 2.3 实验所需仪器 | 第35页 |
| 2.4 测定方法 | 第35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-42页 |
| 3.1 7 种重金属对明亮发光杆菌的剂量-效应关系 | 第35-40页 |
| 3.2 DDT、BHC、PCBs 对明亮发光杆菌、费氏弧菌发光强度的影响 | 第40-42页 |
| 4 小结 | 第42-43页 |
| 第三节 海洋疏浚物发光细菌毒性检测方法的应用研究 | 第43-53页 |
| 1 引言 | 第43页 |
| 2 材料与方法 | 第43-44页 |
| 2.1 实验材料、试剂及测试方法 | 第43页 |
| 2.2 疏浚物样品处理 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-52页 |
| 3.1 发光细菌与其他海洋生物的重金属毒性敏感度比较 | 第44-49页 |
| 3.2 海洋疏浚物对发光细菌的急性毒性效应 | 第49-52页 |
| 3.2.1 疏浚物样品前处理条件的选择 | 第49-50页 |
| 3.2.2 疏浚物样品生物毒性检测 | 第50-52页 |
| 4 小结 | 第52-53页 |
| 第三章 基于菲律宾蛤仔的海洋疏浚物生物毒性检测技术的研究 | 第53-77页 |
| 第一节 疏浚物对菲律宾蛤仔、斑马鱼的急性毒性效应研究 | 第53-57页 |
| 1 引言 | 第53页 |
| 2 材料与方法 | 第53-55页 |
| 2.1 实验材料 | 第53-54页 |
| 2.3 实验仪器 | 第54页 |
| 2.4 实验方法 | 第54-55页 |
| 2.4.1 水相疏浚物对斑马鱼急性毒性检验实验 | 第54页 |
| 2.4.2 水相疏浚物对菲律宾蛤仔急性毒性检验实验 | 第54-55页 |
| 2.5 数据处理与分析 | 第55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-57页 |
| 第二节 菲律宾蛤仔在海洋疏浚物胁迫下鳃丝基因表达谱的构建与分析 | 第57-69页 |
| 1 引言 | 第57页 |
| 2 材料与方法 | 第57-60页 |
| 2.1 实验材料 | 第57页 |
| 2.2 主要试剂 | 第57页 |
| 2.3 主要仪器与设备 | 第57-58页 |
| 2.4 实验方法 | 第58-60页 |
| 2.4.1 菲律宾蛤仔数字基因表达谱 RNA 样品的制备 | 第58页 |
| 2.4.2 总 RNA 质量鉴定 | 第58页 |
| 2.4.3 菲律宾蛤仔 cDNA 文库构建 | 第58-59页 |
| 2.4.4 菲律宾蛤仔 cDNA 文库检测 | 第59页 |
| 2.4.5 毒性疏浚物胁迫下的菲律宾蛤仔数字基因表达谱信息分析 | 第59-60页 |
| 3 结果与分析 | 第60-68页 |
| 3.1 总 RNA 质量鉴定 | 第60页 |
| 3.2 测序数据质量评估 | 第60-62页 |
| 3.2.1 高通量测序错误率分布检测 | 第60-61页 |
| 3.2.2 高通量测序序列 GC 含量分布 | 第61-62页 |
| 3.2.3 高通量测序数据的过滤 | 第62页 |
| 3.3 基因表达水平分析 | 第62-63页 |
| 3.4 高通量测序整体质量评估 | 第63页 |
| 3.5 基因差异表达表达分析 | 第63-68页 |
| 3.5.1 高通量差异表达基因筛选 | 第63-64页 |
| 3.5.2 差异基因维恩图 | 第64页 |
| 3.5.3 高通量差异基因 GO（Gene Ontology）富集分析 | 第64-66页 |
| 3.5.4 高通量差异基因 KEGG 富集分析 | 第66-68页 |
| 4 小结 | 第68-69页 |
| 第三节 菲律宾蛤仔在海洋疏浚物胁迫下鳃丝关键基因表达分析 | 第69-77页 |
| 1 引言 | 第69页 |
| 2 材料方法 | 第69-71页 |
| 2.1 总 RNA 的提取 | 第69页 |
| 2.2 总 RNA 质量验证 | 第69-70页 |
| 2.2.1 紫外吸收法检测 | 第69页 |
| 2.2.2 琼脂糖变性凝胶电泳检测 | 第69-70页 |
| 2.3 去除基因组 DNA 反应 | 第70页 |
| 2.4 反转录反应 | 第70页 |
| 2.5 Real Time PCR 扩增反应 | 第70-71页 |
| 2.5.1 扩增效率和标准曲线 | 第70-71页 |
| 2.5.2 基因表达量的分析 | 第71页 |
| 3 数据处理 | 第71-72页 |
| 4 结果与分析 | 第72-76页 |
| 4.1 菲律宾蛤仔总 RNA 提取 | 第72页 |
| 4.2 扩增曲线和熔解曲线分析 | 第72-75页 |
| 4.3 目的基因荧光定量分析 | 第75-76页 |
| 5 小结 | 第76-77页 |
| 论文总结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 学术成果 | 第86-87页 |
