| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-16页 |
| 1.1 花椒概述 | 第12页 |
| 1.2 皮刺分化分子机理研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3 转录组学研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 RNA-SEQ 技术概述 | 第14-15页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第15-16页 |
| 第二章 转录组测序结果及初步分析 | 第16-32页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 实验及信息分析流程概要 | 第16-17页 |
| 2.2.1 试验流程 | 第16-17页 |
| 2.2.2 信息分析流程 | 第17页 |
| 2.3 材料与方法 | 第17-26页 |
| 2.3.1 材料 | 第17-18页 |
| 2.3.2 RNA 提取与分离 | 第18页 |
| 2.3.3 文库构建 | 第18-20页 |
| 2.3.4 文库质检与上机测序 | 第20页 |
| 2.3.5 数据分析 | 第20-26页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第26-32页 |
| 2.4.1 产量统计 | 第26页 |
| 2.4.2 数据质量评估 | 第26-27页 |
| 2.4.3 组装及注释结果分析 | 第27-30页 |
| 2.4.4 预测蛋白编码框 CDS | 第30页 |
| 2.4.5 Unigene SSR 分析 | 第30-31页 |
| 2.4.6 Unigene SNP 分析 | 第31-32页 |
| 第三章 茎节点与节间差异基因分析 | 第32-38页 |
| 3.1 引言 | 第32页 |
| 3.2 方法 | 第32-34页 |
| 3.2.1 Unigene 表达差异分析 | 第32-33页 |
| 3.2.2 差异 Unigene 的 GO 和 Pathway 分析 | 第33-34页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第34-38页 |
| 3.3.1 基因表达丰度统计 | 第34-35页 |
| 3.3.2 差异表达转录本分析 | 第35-36页 |
| 3.3.3 差异基因的 GO 和 KEGG 富集性分析 | 第36-38页 |
| 第四章 候选基因的实时定量 PCR 验证 | 第38-41页 |
| 4.1 引言 | 第38页 |
| 4.2 材料与方法 | 第38-40页 |
| 4.2.1 材料 | 第38-40页 |
| 4.3 结果 | 第40-41页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第41-43页 |
| 5.1 结论 | 第41页 |
| 5.2 讨论 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-46页 |
| 缩略词 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 作者简介 | 第48页 |