| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第10-19页 |
| 1.1 LNCRNA 简介及研究意义 | 第10-12页 |
| 1.2 前列腺癌 | 第12-13页 |
| 1.3 转录组测序技术（RNA-SEQ）简介 | 第13-14页 |
| 1.4 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 第14-15页 |
| 1.5 富集分析（GENEGO，TF&MIRNA 靶基因预测） | 第15-16页 |
| 1.6 论文框架 | 第16-19页 |
| 第二章 前列腺癌症 RNA-SEQ 数据分析 | 第19-25页 |
| 2.1 数据来源及相关材料 | 第19页 |
| 2.2 建立人类 MRNA.LINCRNA 的注释文件 | 第19-20页 |
| 2.3 RNA-SEQ 数据的 MAPPING 和组装 | 第20-21页 |
| 2.4 构建所有样本表达矩阵文件 | 第21-22页 |
| 2.5 样本差异表达分析 | 第22-23页 |
| 2.6 获得差异表达谱矩阵 | 第23-25页 |
| 第三章 前列腺癌共表达模块分析 | 第25-40页 |
| 3.1 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 第25-27页 |
| 3.2 前列腺癌风险关联度分析 | 第27-31页 |
| 3.3 模块中的 TF&MIRNA 靶基因预测分析 | 第31-37页 |
| 3.4 共表达模块分析 | 第37-40页 |
| 第四章 前列腺癌症风险模块富集分析 | 第40-47页 |
| 4.1 LINCRNA 相关前列癌症风险模块判别分析 | 第40-44页 |
| 4.2 GENEGO 富集分析 | 第44-45页 |
| 4.3 LINCRNA 相关的前列腺癌风险模块（M3）网络可视化 | 第45-47页 |
| 第五章 结论与展望 | 第47-50页 |
| 5.1 讨论和总结 | 第47-48页 |
| 5.2 已有的相关 LNCRNA 的资源信息整理 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 攻读学位期间本人已公开（待）发表的论文 | 第54-55页 |
| 附录一 | 第55-58页 |
| 附录二 | 第58-61页 |
| 附录三 | 第61-66页 |
| 附录四 | 第66-84页 |
| 致谢 | 第84-85页 |
