| 论文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章:文献综述:后基因组时代可变剪接外显子进化研究概述 | 第12-48页 |
| 第一节:可变剪接概述 | 第12-19页 |
| ·、可变剪接的定义 | 第12页 |
| ·可变剪接的分类 | 第12-14页 |
| ·可变剪接的过程 | 第14-15页 |
| ·可变剪接的调控 | 第15-16页 |
| ·可变剪接与肿瘤等人类疾病的关系 | 第16-19页 |
| 第二节:可变剪接外显子的进化及其研究 | 第19-28页 |
| ·可变剪接外显子是在不断进化中的 | 第19页 |
| ·可变剪接外显子进化对真核生物基因组的意义 | 第19-21页 |
| ·比较基因组学是研究可变剪接外显子进化的重要手段 | 第21-22页 |
| ·利用比较基因组学进行可变剪接外显子进化研究的方法 | 第22-26页 |
| ·丰富的网络数据库资源为比较基因组学研究提供了有力支持 | 第26-28页 |
| 第三节:高通量测序及其可变剪接研究中的应用 | 第28-34页 |
| ·高通量测序的类型及原理 | 第28-30页 |
| ·高通量的特点和优势 | 第30-31页 |
| ·基于mRNA高通量测序数据进行的可变剪接表达分析 | 第31-34页 |
| 第四节:综述小结及本文的研究意义 | 第34-36页 |
| ·综述小结 | 第34-35页 |
| ·本文研究工作的意义 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-48页 |
| 第二章:可变剪接外显子进化分析系统的构建及进化规律研究 | 第48-101页 |
| 第一节:前言 | 第48-51页 |
| 第二节:材料与方法 | 第51-74页 |
| ·实验材料 | 第51-53页 |
| ·实验方法(ASEEA系统的构建) | 第53-74页 |
| 第三节:实验结果 | 第74-90页 |
| ·可变剪接外显子进化分析系统(ASEEA)的建立 | 第74-75页 |
| ·外显子年龄与剪接类型关联分析 | 第75-77页 |
| ·外显子年龄与蛋白结构域的关联分析 | 第77-78页 |
| ·外显子进化选择压分析 | 第78-81页 |
| ·重复序列分析 | 第81-83页 |
| ·基于Solexa高通量测序的外显子表达量分析 | 第83-90页 |
| 第四节:讨论 | 第90-96页 |
| ·可变剪接外显子进化的一般性规律 | 第91-93页 |
| ·可变剪接外显子对于哺乳动物进化的影响 | 第93-94页 |
| ·Solexa高通量测序在可变剪接外显子进化研究中的应用 | 第94-95页 |
| ·非盒式外显子的部分进化规律 | 第95-96页 |
| 本章小结 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-101页 |
| 第三章:肿瘤相关基因中可变剪接外显子进化研究及数据库构建 | 第101-126页 |
| 第一节:前言 | 第101-103页 |
| 第二节:材料与方法 | 第103-105页 |
| ·实验材料 | 第103页 |
| ·实验方法 | 第103-105页 |
| 第三节:实验结果 | 第105-120页 |
| ·肿瘤相关基因外显子年龄及剪接类型分布 | 第105-106页 |
| ·肿瘤相关基因外显子进化选择压分析 | 第106-108页 |
| ·肿瘤相关基因外显子重复序列分析 | 第108-110页 |
| ·肿瘤相关基因外显子剪接调控元件分析 | 第110-111页 |
| ·基于Solexa高通量测序的肿瘤相关基因外显子表达量分析 | 第111-114页 |
| ·肿瘤相关基因外显子剪接进化数据库(OncoAS)构建 | 第114-120页 |
| 第四节:讨论 | 第120-123页 |
| ·肿瘤相关基因可变剪接外显子进化的一般性规律 | 第120页 |
| ·肿瘤相关基因中外显子进化的保守性倾向 | 第120-122页 |
| ·基于OncoAS的研究对象筛选举例 | 第122-123页 |
| 本章小结 | 第123页 |
| 参考文献 | 第123-126页 |
| 第四章:VEGFA、PPAR-gamma中可变剪接外显子进化分析 | 第126-155页 |
| 第一节:VEGFA中可变剪接外显子进化分析 | 第126-144页 |
| ·VEGFA的研究背景 | 第126-128页 |
| ·材料和方法 | 第128-132页 |
| ·实验结果 | 第132-138页 |
| ·讨论 | 第138-143页 |
| ·结论 | 第143-144页 |
| 第二节:PPAR-gamma中可变剪接外显子进化分析 | 第144-154页 |
| ·PPAR-gamma的研究背景 | 第144-146页 |
| ·材料与方法 | 第146-147页 |
| ·实验结果 | 第147-151页 |
| ·讨论 | 第151-153页 |
| ·结论 | 第153-154页 |
| 本章小结 | 第154-155页 |
| 总结与展望 | 第155-165页 |
| 研究工作及创新点总结 | 第155-157页 |
| 展望 | 第157-158页 |
| 参考文献 | 第158-165页 |
| 发表论文情况 | 第165-166页 |
| 致谢 | 第166-167页 |
