鸟类祖先昼夜活动模式初步研究
摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 绪论 | 第8-13页 |
1.1 鸟类昼夜活动模式概述 | 第8-9页 |
1.2 祖先鸟类昼夜活动模式 | 第9页 |
1.3 光传导通路 | 第9-11页 |
1.4 基因适应性进化 | 第11-12页 |
1.5 研究问题及意义 | 第12-13页 |
第二章 材料和方法 | 第13-23页 |
2.1 实验材料 | 第13-17页 |
2.1.1 研究对象 | 第13-15页 |
2.1.2 实验仪器及设备 | 第15-16页 |
2.1.3 实验耗材 | 第16-17页 |
2.1.4 实验试剂 | 第17页 |
2.2 实验方法 | 第17-19页 |
2.2.1 转录组测序所需组织样的获取 | 第17-18页 |
2.2.1.1 配置实验试剂 | 第17页 |
2.2.1.2 实验器具准备 | 第17-18页 |
2.2.1.3 实验前活体样本的处理 | 第18页 |
2.2.1.4 视网膜组织的获取 | 第18页 |
2.2.2 转录组测序实验过程 | 第18-19页 |
2.2.3 转录组测序序列的分析流程 | 第19页 |
2.3 数据的处理分析 | 第19-23页 |
2.3.1 获取视觉基因 | 第19页 |
2.3.2 视觉基因序列比对 | 第19-20页 |
2.3.3 基因正选择压力分析 | 第20-21页 |
2.3.4 基因正选择压力分析的稳定性检验 | 第21-23页 |
第三章 结果与分析 | 第23-33页 |
3.1 鸟类祖先支正选择分析结果 | 第23-26页 |
3.1.1 GRK1基因正选择结果 | 第25页 |
3.1.2 PDE6C基因正选择结果 | 第25-26页 |
3.1.3 SLC24A1基因正选择结果 | 第26页 |
3.2 初龙祖先支基因正选择压力分析的结果 | 第26-29页 |
3.2.1 CNGA1基因正选择结果 | 第26-27页 |
3.2.2 GNAT1基因正选择结果 | 第27页 |
3.2.3 GUCY2D基因正选择结果 | 第27-28页 |
3.2.4 PDE6B基因正选择结果 | 第28页 |
3.2.5 RCVRN基因正选择结果 | 第28-29页 |
3.2.6 SLC24A1基因正选择结果 | 第29页 |
3.3 基因正选择压力分析的稳定性检验结果 | 第29-31页 |
3.4 结果总结 | 第31-33页 |
第四章 结论与讨论 | 第33-36页 |
4.1 讨论 | 第33-35页 |
4.1.1 鸟类祖先的昼夜活动模式 | 第33-35页 |
4.1.2 夜行性的进化意义 | 第35页 |
4.1.3 研究不足 | 第35页 |
4.2 结论 | 第35-36页 |
参考文献 | 第36-40页 |
附录 | 第40-68页 |
致谢 | 第68页 |