皱纹昙蛤微卫星的筛选和特性分析
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 前言 | 第10-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-31页 |
| 1 遗传标记的简介与分类 | 第15-18页 |
| 1.1 形态学标记 | 第15-16页 |
| 1.2 细胞学标记 | 第16页 |
| 1.3 生化标记 | 第16-17页 |
| 1.4 免疫学标记 | 第17-18页 |
| 1.5 分子标记 | 第18页 |
| 2 分子标记技术的发展 | 第18-23页 |
| 2.1 第一代分子标记 | 第18-19页 |
| 2.1.1 RFLP标记 | 第19页 |
| 2.1.2 小卫星DNA | 第19页 |
| 2.2 第二代分子标记 | 第19-22页 |
| 2.2.1 RAPD标记 | 第20页 |
| 2.2.2 DAF标记 | 第20-21页 |
| 2.2.3 AFLP标记 | 第21页 |
| 2.2.4 SSR(微卫星)标记 | 第21页 |
| 2.2.5 ISSR标记 | 第21-22页 |
| 2.3 第三代分子标记 | 第22-23页 |
| 2.3.1 SNP | 第22页 |
| 2.3.2 EST | 第22-23页 |
| 2.4 新型分子标记及展望 | 第23页 |
| 3 微卫星(SSR)标记技术 | 第23-30页 |
| 3.1 微卫星的发现与发展 | 第23-24页 |
| 3.2 微卫星的产生原理 | 第24页 |
| 3.3 微卫星的分类 | 第24-25页 |
| 3.4 微卫星的特点 | 第25页 |
| 3.5 微卫星的分布 | 第25-26页 |
| 3.6 微卫星的开发 | 第26-28页 |
| 3.6.1 基因组文库构建法 | 第26页 |
| 3.6.2 富集法 | 第26-27页 |
| 3.6.2.1 引物富集法 | 第27页 |
| 3.6.2.2 尼龙膜富集法 | 第27页 |
| 3.6.2.3 磁珠富集法 | 第27页 |
| 3.6.3 数据库搜寻法 | 第27-28页 |
| 3.6.4 近缘物种筛选法 | 第28页 |
| 3.7 微卫星的功能及应用 | 第28页 |
| 3.8 微卫星在贝类研究中的应用 | 第28-30页 |
| 3.8.1 遗传图谱的构建 | 第29页 |
| 3.8.2 种族遗传结构多样性分析 | 第29页 |
| 3.8.3 种质资源评估与保护 | 第29-30页 |
| 3.8.4 亲缘关系鉴定 | 第30页 |
| 4 皱纹昙蛤简介 | 第30-31页 |
| 第二章 磁珠富集法筛选皱纹昙蛤多态性微卫星 | 第31-49页 |
| 5 材料 | 第31-32页 |
| 5.1 昙蛤样品 | 第31页 |
| 5.2 仪器设备 | 第31-32页 |
| 5.3 试剂和药品 | 第32页 |
| 6 步骤及方法 | 第32-45页 |
| 6.1 昙蛤样品的DNA提取和检验 | 第32-35页 |
| 6.1.1 基因组DNA的提取 | 第32-33页 |
| 6.1.2 琼脂糖凝胶电泳检验 | 第33-35页 |
| 6.2 酶切 | 第35页 |
| 6.3 连接 | 第35-36页 |
| 6.4 PCR扩增检测连接产物 | 第36-37页 |
| 6.5 探针杂交与磁珠富集 | 第37-38页 |
| 6.5.1 生物素探针杂交 | 第37页 |
| 6.5.2 磁珠富集 | 第37-38页 |
| 6.6 PCR扩增检验富集产物 | 第38页 |
| 6.7 连接T载体 | 第38-39页 |
| 6.8 转化 | 第39页 |
| 6.9 阳性克隆筛选和鉴定 | 第39-42页 |
| 6.9.1 培养基平板制备和使用 | 第39-40页 |
| 6.9.2 阳性克隆挑选和鉴定 | 第40-42页 |
| 6.10 测序及数据分析 | 第42-43页 |
| 6.11 引物设计和筛选 | 第43-44页 |
| 6.12 Genotyping PCR和数据分析 | 第44-45页 |
| 7 结果 | 第45-47页 |
| 7.1 微卫星序列分析 | 第45-46页 |
| 7.2 微卫星引物检测结果 | 第46页 |
| 7.3 等位基因数 | 第46页 |
| 7.4 观测杂合度 | 第46-47页 |
| 7.5 期望杂合度 | 第47页 |
| 7.6 Hardy-Weinberg平衡检测 | 第47页 |
| 8 讨论 | 第47-49页 |
| 8.1 磁珠富集法分离微卫星的优缺点 | 第47-48页 |
| 8.2 微卫星分子标记在皱纹昙蛤研究中的展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 附表1 皱纹昙蛤中17个微卫星的特性分析 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-56页 |
| 个人简历和攻读学位期间取得的成果 | 第56页 |
