| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-12页 |
| 1.2.1 miRNA功能相似性研究现状 | 第9-10页 |
| 1.2.2 疾病miRNA关联预测研究现状 | 第10-12页 |
| 1.3 本文主要研究内容 | 第12-14页 |
| 第2章 基于MapReduce的miRNA相似性的并行计算 | 第14-38页 |
| 2.1 引言 | 第14页 |
| 2.2 miRNA功能相似性串行算法 | 第14-22页 |
| 2.2.1 数据集 | 第14-15页 |
| 2.2.2 疾病术语间相似性计算串行算法 | 第15-19页 |
| 2.2.3 miRNA功能相似性计算的串行算法 | 第19-22页 |
| 2.3 基于MapReduce的miRNA功能相似性计算 | 第22-32页 |
| 2.3.1 MapReduce并行框架 | 第22页 |
| 2.3.2 基于MapReduce的疾病术语相似性计算 | 第22-29页 |
| 2.3.3 基于MapReduce的miRNA功能相似性计算 | 第29-32页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第32-37页 |
| 2.4.1 串行算法性能 | 第32页 |
| 2.4.2 reduce任务个数对性能的影响 | 第32-34页 |
| 2.4.3 map任务个数对性能的影响 | 第34-36页 |
| 2.4.4 节点个数对性能的影响 | 第36-37页 |
| 2.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第3章 基于分组比较的miRNA功能相似性度量 | 第38-52页 |
| 3.1 引言 | 第38-39页 |
| 3.2 疾病术语信息含量的计算 | 第39-41页 |
| 3.3 疾病术语集合信息含量的计算 | 第41-46页 |
| 3.3.1 特有信息含量 | 第41-42页 |
| 3.3.2 一组疾病术语的信息含量 | 第42-46页 |
| 3.4 基于分组比较的miRNA功能相似性度量 | 第46页 |
| 3.5 实验结果与分析 | 第46-50页 |
| 3.5.1 同家族和同分簇的t检验 | 第46-48页 |
| 3.5.2 构建miRNA功能网络 | 第48页 |
| 3.5.3 疾病miRNA功能预测分析 | 第48-50页 |
| 3.6 本章小结 | 第50-52页 |
| 第4章 基于有重启随机游走的疾病miRNA关联预测 | 第52-64页 |
| 4.1 引言 | 第52页 |
| 4.2 基于有重启随机游走的疾病miRNA关联预测 | 第52-61页 |
| 4.2.1 有重启的随机游走模型 | 第52-55页 |
| 4.2.2 基于有重启随机游走的关联预测 | 第55-61页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第61-62页 |
| 4.4 本章小结 | 第62-64页 |
| 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
