英文缩略词表 | 第6-10页 |
摘要 | 第10-14页 |
Abstract | 第14-18页 |
1 前言 | 第19-27页 |
1.1 研究背景 | 第19-25页 |
1.2 本研究的思路 | 第25-27页 |
2 材料与方法 | 第27-51页 |
2.1 研究对象 | 第27-28页 |
2.2 实验试剂 | 第28-30页 |
2.2.1 DNA提取试剂 | 第28页 |
2.2.2 电泳试剂 | 第28-29页 |
2.2.3 标准化DNA用试剂 | 第29页 |
2.2.4 全基因组基因分型用试剂 | 第29-30页 |
2.3 实验仪器 | 第30-32页 |
2.3.1 DNA提取器材 | 第30页 |
2.3.2 电泳的仪器 | 第30-31页 |
2.3.3 测OD值仪器 | 第31页 |
2.3.4 全基因组SNP分型仪器 | 第31-32页 |
2.4 实验方法 | 第32-45页 |
2.4.1 全血标本采集 | 第32页 |
2.4.2 基因组DNA提取 | 第32-33页 |
2.4.3 基因组DNA电泳检测 | 第33-36页 |
2.4.4 DNA浓度的检测与标准化 | 第36-37页 |
2.4.5 全基因组SNPs基因分型 | 第37-45页 |
2.5 分析软件和电子数据库查询信息 | 第45-48页 |
2.5.1 基因分型软件Plink 1.07 的应用 | 第45-46页 |
2.5.2 Haploview的应用 | 第46页 |
2.5.3 R软件的应用 | 第46页 |
2.5.4 美国国立生物技术信息中心 | 第46-47页 |
2.5.5 Hap Map计划数据库 | 第47页 |
2.5.6 其他相关数据库及网站 | 第47-48页 |
2.6 数据质控和统计分析 | 第48-51页 |
2.6.1 数据质量控制 | 第48页 |
2.6.2 初筛实验的SNP质控 | 第48-49页 |
2.6.3 数据统计分析 | 第49-51页 |
3 结果 | 第51-71页 |
3.1 中国汉族人群全基因组SNPs分型数据的统计分析结果 | 第51-69页 |
3.2 本研究的GWAS结果与其它自身免疫性疾病的结果对比分析 | 第69-71页 |
4 讨论 | 第71-76页 |
4.1 HLA与皮肌炎的相关性 | 第71-73页 |
4.2 皮肌炎在非MHC区的提示易感位点 | 第73-76页 |
5 结论 | 第76-78页 |
6 参考文献 | 第78-89页 |
附录 | 第89-92页 |
致谢 | 第92-94页 |
课题综述 特发性炎性肌病的最新研究进展 | 第94-125页 |
参考文献 | 第116-125页 |