| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-45页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 碳代谢物阻遏机制 | 第13-34页 |
| 1.2.1 碳代谢物阻遏的发现及作用 | 第13-14页 |
| 1.2.2 微生物的PTS系统 | 第14-16页 |
| 1.2.3 革兰氏阴性菌的CCR系统 | 第16-19页 |
| 1.2.4 革兰氏阳性菌的CCR系统 | 第19-27页 |
| 1.2.5 其它CCR机制 | 第27-31页 |
| 1.2.6 CCR对生理活动的影响 | 第31-33页 |
| 1.2.7 CCR在工业生产中的应用 | 第33-34页 |
| 1.3 嗜热菌 | 第34-39页 |
| 1.3.1 嗜热菌的耐热机理 | 第35-36页 |
| 1.3.2 嗜热菌的工业应用价值 | 第36-37页 |
| 1.3.3 嗜热菌厌氧杆菌 | 第37-38页 |
| 1.3.4 嗜热菌的研究难点 | 第38-39页 |
| 1.4 菌株驯化及研究 | 第39-42页 |
| 1.4.1 高浓度底物发酵 | 第39-40页 |
| 1.4.2 菌株的耐高糖驯化 | 第40-41页 |
| 1.4.3 转录组技术运用于微生物研究 | 第41-42页 |
| 1.5 本课题的目的意义和主要研究内容 | 第42-45页 |
| 1.5.1 目的意义 | 第42-43页 |
| 1.5.2 主要研究内容 | 第43-45页 |
| 第二章 嗜热厌氧杆菌T. aotearoense LA1002的碳代谢物阻遏机制初探 | 第45-86页 |
| 2.1 引言 | 第45-46页 |
| 2.2 材料和方法 | 第46-52页 |
| 2.2.1. 菌种、质粒和引物 | 第46-48页 |
| 2.2.2. 仪器和试剂 | 第48-51页 |
| 2.2.3. 培养基 | 第51-52页 |
| 2.3 实验方法 | 第52-65页 |
| 2.3.1 实验培养及菌种保藏 | 第52页 |
| 2.3.2 菌种的复苏和保存 | 第52-53页 |
| 2.3.3 2-脱氧葡萄糖对嗜热菌代谢其它碳源的影响 | 第53页 |
| 2.3.4 考察嗜热菌内葡萄糖对其它碳源利用的抑制 | 第53页 |
| 2.3.5 CCR相关基因的克隆 | 第53-59页 |
| 2.3.6 ptsH、hprK进化树的构建 | 第59-60页 |
| 2.3.7 qRT-PCR验证ccpA基因的功能 | 第60-61页 |
| 2.3.8 CcpA、HPr和HPrK蛋白的制备 | 第61-63页 |
| 2.3.9 In vitro HPr磷酸化研究 | 第63-64页 |
| 2.3.10 In vitro HPr-Ser46-P与CcpA结合纯化实验 | 第64-65页 |
| 2.3.11 表面等离子体共振实验（SPR） | 第65页 |
| 2.4 分析方法 | 第65-66页 |
| 2.4.1 菌体密度测量方法 | 第65-66页 |
| 2.4.2 残糖和产物检测方法 | 第66页 |
| 2.5 结果与讨论 | 第66-84页 |
| 2.5.1 2-脱氧葡萄糖添加对嗜热厌氧杆菌碳利用影响的研究 | 第66-69页 |
| 2.5.2 嗜热厌氧杆菌在混合碳源培养基中碳源利用研究 | 第69-71页 |
| 2.5.3 碳代谢抑制相关基因的克隆 | 第71-77页 |
| 2.5.4 碳代谢抑制相关基因的表征与功能鉴定研究 | 第77-84页 |
| 2.6 本章小结 | 第84-86页 |
| 第三章 嗜热厌氧杆菌高浓度碳底物利用突变株的获得及其应用研究 | 第86-97页 |
| 3.1 引言 | 第86页 |
| 3.2 材料和方法 | 第86-88页 |
| 3.2.1 培养基 | 第86-88页 |
| 3.3 实验方法 | 第88-89页 |
| 3.3.1 LA1002高浓度糖底物的驯化研究 | 第88页 |
| 3.3.2 LA1002-G40的传代稳定性证明 | 第88页 |
| 3.3.3 LA1002驯化前后菌株在摇瓶中生长差异比较研究 | 第88-89页 |
| 3.3.4 高糖驯化菌株LA1002-G40的批次发酵研究 | 第89页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第89-96页 |
| 3.4.1 利用高浓度糖底物对LA1002的驯化研究 | 第89-91页 |
| 3.4.2 LA1002-G40的传代稳定性实验 | 第91页 |
| 3.4.3 驯化前后LA1002菌株发酵特性差异研究 | 第91-92页 |
| 3.4.4 利用驯化后的LA1002-G40菌株批次发酵生产乳酸 | 第92-96页 |
| 3.5 本章小结 | 第96-97页 |
| 第四章 高渗环境嗜热厌氧杆菌细胞动态响应机制研究 | 第97-121页 |
| 4.1 引言 | 第97页 |
| 4.2 材料和方法 | 第97-99页 |
| 4.3 实验方法 | 第99-101页 |
| 4.3.1 出发菌株LA1002与驯化后菌株LA1002-G40的转录组差异分析 | 第99页 |
| 4.3.2 LA1002和LA1002-G40转录组差异表达的qRT-PCR确认 | 第99-101页 |
| 4.4 分析方法 | 第101-104页 |
| 4.4.1 T. aotearoense LA1002总RNA的提取 | 第101页 |
| 4.4.2 转录组测序及生物信息分析方法 | 第101-102页 |
| 4.4.3 测序数据质量分析 | 第102-103页 |
| 4.4.4 基因表达分析和显著性分析 | 第103页 |
| 4.4.5 差异表达基因PATHWAY富集分析 | 第103-104页 |
| 4.4.6 嗜热厌氧杆菌胞内氨基酸和UDP-Glucose浓度分析方法 | 第104页 |
| 4.5 结果与分析 | 第104-120页 |
| 4.5.1 LA1002和LA1002-G40的RNA提取结果 | 第104-106页 |
| 4.5.2 LA1002转录组测序数据质量分析 | 第106-108页 |
| 4.5.3 LA1002转录组基因差异表达研究 | 第108-113页 |
| 4.5.4 LA1002在应对外界高渗透压下可能产生的自身调控机制解析 | 第113-120页 |
| 4.6 本章小结 | 第120-121页 |
| 结论和展望 | 第121-124页 |
| 参考文献 | 第124-140页 |
| 附录 | 第140-147页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第147-148页 |
| 致谢 | 第148-150页 |
| 附件 | 第150页 |
