| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 英文缩略词表 | 第17-18页 |
| 引言 | 第18-21页 |
| 第一部分 建立CRISPRs的大肠埃希菌分型方法 | 第21-64页 |
| 1 前言 | 第21-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-33页 |
| 3 结果 | 第33-55页 |
| 3.1 建立大肠埃希菌CRISPR/Cas位置的新描述方法 | 第33页 |
| 3.2 大肠埃希菌CRISPR/Cas的结构特征 | 第33-35页 |
| 3.3 大肠埃希菌CRISPR/Cas的分布及与种系关系 | 第35-36页 |
| 3.4 大肠埃希菌CRISPRs的侧翼序列比对 | 第36-38页 |
| 3.5 基于CRISPR1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定 | 第38-42页 |
| 3.6 大肠埃希菌CRISPRs的分析 | 第42-44页 |
| 3.7 建立CRISPRs的大肠埃希菌分型方法 | 第44-50页 |
| 3.8 评价CRISPRs对大肠埃希菌的分型效果 | 第50-52页 |
| 3.9 实验验证CRISPRs的大肠埃希菌分型效果 | 第52-55页 |
| 4 讨论 | 第55-63页 |
| 4.1 大肠埃希菌CRISPR/Cas分布情况 | 第55-57页 |
| 4.2 基于CRISPRs侧翼序列的分析 | 第57-58页 |
| 4.3 基于CRISPRs的大肠埃希菌分型 | 第58-63页 |
| 5 小结 | 第63-64页 |
| 第二部分 CRISPRs分型方法在产志贺毒素大肠埃希菌中应用 | 第64-82页 |
| 1 前言 | 第64-65页 |
| 2 材料与方法 | 第65-67页 |
| 2.1 实验材料 | 第65页 |
| 2.2 实验方法 | 第65-67页 |
| 3 结果 | 第67-77页 |
| 3.1 STEC菌株的分布 | 第67-71页 |
| 3.2 基于CRISPRs的STEC分型 | 第71-77页 |
| 4 讨论 | 第77-81页 |
| 4.1 STEC菌株的流行分布 | 第77页 |
| 4.2 基于CRISPRs的STEC型别与流行分布的关系 | 第77-81页 |
| 5 小结 | 第81-82页 |
| 第三部分 大肠埃希菌CRISPR/Cas与可移动元件介导毒力和耐药的关系 | 第82-104页 |
| 1 前言 | 第82-83页 |
| 2 材料和方法 | 第83-86页 |
| 2.1 实验材料 | 第83页 |
| 2.2 实验方法 | 第83-84页 |
| 2.3 统计学方法 | 第84-86页 |
| 3 结果 | 第86-96页 |
| 3.1 CRISPR/Cas的分布与噬菌体的关系 | 第86-87页 |
| 3.2 CRISPR/Cas的分布与质粒的关系 | 第87-91页 |
| 3.3 CRISPR /Cas与染色体上可获得的毒力和耐药基因的关系 | 第91-96页 |
| 4 讨论 | 第96-103页 |
| 4.1 CRISPR/Cas系统与噬菌体的关系 | 第96-97页 |
| 4.2 CRISPR/Cas系统与质粒的关系 | 第97-99页 |
| 4.3 CRISPR/Cas系统与染色体上可获得毒力和耐药基因的关系 | 第99-103页 |
| 5 小结 | 第103-104页 |
| 结论 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-115页 |
| 综述 大肠埃希菌CRISPR/Cas系统的结构特征及功能研究进展 | 第115-135页 |
| 参考文献 | 第126-135页 |
| 个人简历 | 第135-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 附录 | 第138-167页 |
