| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 第1章 引言 | 第7-13页 |
| 1.1 概述 | 第7-8页 |
| 1.2 肝细胞癌简述 | 第8-9页 |
| 1.3 基因芯片 | 第9-10页 |
| 1.4 高通量测序 | 第10-11页 |
| 1.5 生物信息学 | 第11页 |
| 1.6 研究意义 | 第11-13页 |
| 第2章 材料与方法 | 第13-24页 |
| 2.1 数据来源 | 第13-15页 |
| 2.1.1 临床肝癌基因组数据 | 第13页 |
| 2.1.2 基因芯片数据 | 第13-14页 |
| 2.1.3 cBioportal网站 | 第14页 |
| 2.1.4 基因通路分析数据 | 第14-15页 |
| 2.2 数据分析相关方法与工具 | 第15-24页 |
| 2.2.1 R语言与Bioconductor | 第15-16页 |
| 2.2.2 基因芯片数据预处理 | 第16-19页 |
| 2.2.3 基因表达差异分析 | 第19-21页 |
| 2.2.4 GLAD4U在线数据库 | 第21页 |
| 2.2.5 WebGestalt网站 | 第21页 |
| 2.2.6 MeV软件 | 第21页 |
| 2.2.7 SPSS软件 | 第21-22页 |
| 2.2.8 基因富集分析 | 第22-24页 |
| 第3章 结果 | 第24-46页 |
| 3.1 差异表达基因的筛选 | 第24-27页 |
| 3.2 差异表达基因的功能背景的研究 | 第27-32页 |
| 3.3 细胞增殖基因的扩展及其与肝癌发生的相关性分析 | 第32-42页 |
| 3.4 增殖的差异表达基因的生存分析 | 第42-46页 |
| 第4章 结论与展望 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 附录 | 第53-56页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第56页 |