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萝卜镉胁迫响应相关基因克隆及其表达分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第13-14页
引言第14-15页
第一部分 文献综述第15-25页
 1 重金属污染的危害第15-16页
 2 植物对重金属胁迫响应机制第16-19页
   ·植物对镉的螯合作用第16-18页
     ·植物络合素及结构第16-17页
     ·植物络合素合酶(phytochelatin synthase,PCS)第17页
     ·植物络合素在植物对重金属抗性中的作用第17-18页
   ·金属硫蛋白及在重金属结合中作用第18-19页
 3 植物Cd吸收转运分子机制第19-23页
   ·金属离子转运体ZIP蛋白(ZRT/IRT-like protein)家族第20-21页
     ·ZIP蛋白家族的结构特征第20-21页
     ·ZIP蛋白基因的表达特性第21页
   ·金属离子转运体CDF蛋白家族第21-22页
     ·CDF蛋自家族的结构特征第21-22页
     ·CDF蛋白基因的表达特性第22页
   ·金属离子转运体CAX蛋白家族第22-23页
     ·CAX蛋白家族的结构特征第22-23页
     ·CAX蛋白基因的表达特性第23页
 4 本研究的目的和意义第23-25页
第二部分 研究报告第25-89页
 第一章 萝卜RsPCS基因克隆与表达分析第25-41页
  1 材料和方法第26-31页
   ·植物材料和胁迫处理第26页
   ·菌株与质粒第26页
   ·所需试剂第26页
   ·萝卜基因组DNA与总RNA的提取第26-27页
   ·反转录cDNA第一条链的合成第27页
   ·引物设计与合成第27页
   ·萝卜PCS基因基因组DNA及cDNA特异扩增第27-28页
   ·PCS基因的克隆第28-30页
     ·目的片段的回收第28页
     ·大肠杆菌感受态的制备第28-29页
     ·重组质粒的构建第29页
     ·重组质粒的转化第29-30页
   ·序列测定及分析第30页
   ·萝卜镉处理植株GSH和NPT含量的测定第30-31页
   ·RsPCS基因表达研究第31页
   ·RsPCS基因实时荧光定量表达研究第31页
  2 结果与分析第31-38页
   ·萝卜PCS基因的DNA与cDNA扩增第31-32页
   ·萝卜PCS基因的DNA与cDNA克隆及序列分析第32-35页
   ·RsPCS氨基酸序列同源性及系统树分析第35-36页
   ·萝卜镉处理植株PCs含量的变化第36页
   ·萝卜RsPCS基因的表达分析第36-38页
  3 讨论第38-41页
   ·RsPCS序列特征第38页
   ·Cd胁迫对萝卜中PCs和GSH含量的影响第38页
   ·Cd胁迫下PCS基因的表达特性第38-39页
   ·Cd胁迫下PSC基因的相对表达量与PCs含量的关系第39-41页
 第二章 萝卜金属硫蛋白Ⅱ基因克隆与表达分析第41-49页
  1 材料与方法第41-43页
   ·试验材料和胁迫处理第41-42页
   ·萝卜MT2基因EST序列搜索第42页
   ·萝卜叶片基因组DNA的提取第42页
   ·萝卜叶片总RNA的提取及反转录第42页
   ·引物设计第42页
   ·MT2基因DNA全长克隆、测序第42页
   ·MT2基因生物信息学分析第42页
   ·RsMT2的表达分析研究第42-43页
  2 结果与分析第43-46页
   ·萝卜EST拼接第43页
   ·萝卜叶片总RNA的提取第43页
   ·萝卜MT2基因的扩增电泳结果第43页
   ·萝卜MT2基因的核苷酸序列分析第43-44页
   ·蛋白一级结构特征及理化性质分析第44-45页
   ·蛋白质家族预测及蛋白质亚细胞定位第45-46页
   ·萝卜金属硫蛋白的二级结构预测第46页
   ·萝卜MT2基因表达分析第46页
  3 讨论第46-49页
   ·MT基因的诱导表达特性第46-47页
   ·MT基因的组织表达特性第47-49页
 第三章 萝卜IRT1基因克隆与表达分析第49-59页
  1 材料与方法第50-51页
   ·试验材料和胁迫处理第50页
   ·总DNA和RNA提取及cDNA合成第50页
   ·引物设计与合成第50页
   ·萝卜IRT1基因全长克隆及测序第50-51页
   ·IRT1基因的表达分析第51页
  2 结果与分析第51-57页
   ·萝卜EST拼接第51页
   ·萝卜RsIRT1基因DNA克隆及分析第51-53页
   ·萝卜与其他植物铁转运蛋白序列的多重比对第53-54页
   ·萝卜与其他植物铁转运蛋白氨基酸序列的系统发生分析第54页
   ·推测的萝卜铁转运蛋白RsIRT1的蛋白特征第54-56页
     ·萝卜铁转运蛋白RsIRT1的跨膜结构分析第54-55页
     ·萝卜铁转运蛋白IRT1的二级结构预测第55页
     ·萝卜铁转运蛋白IRT1的信号肽预测第55-56页
   ·萝卜铁转运蛋白IRT1的亚细胞定位第56页
   ·萝卜RsIRT1基因的表达特性分析第56-57页
  3 讨论第57-59页
 第四章 萝卜Ca~(2+)/H~+反向转运体基因CAXl和CAX2克隆与表达特性分析第59-69页
  1 材料方法第60-61页
   ·试验材料和胁迫处理第60页
   ·研究方法第60-61页
     ·萝卜叶片基因组DNA的提取第60页
     ·萝卜叶片总RNA的提取及反转录第60页
     ·引物设计第60-61页
  2第61-66页
   ·萝卜与拟南芥和水稻CAX家族成员的蛋白序列同源性分析第62页
   ·萝卜CAX亲水性分析及跨膜区预测第62-65页
   ·萝卜CAX基因表达分析第65-66页
  3 讨论第66-69页
 第五章 萝卜金属离子转运体基因RsMTP1克隆与表达特性分析第69-77页
  1 材料方法第70-71页
   ·试验材料和胁迫处理第70页
   ·研究方法第70页
     ·萝卜叶片基因组DNA的提取第70页
     ·萝卜叶片总RNA提取与反转录第70页
     ·引物设计第70页
   ·萝卜MTP1基因全长克隆及测序第70页
   ·MTP1基因的表达分析第70-71页
  2 结果与分析第71-76页
   ·萝卜MTP1的克隆及序列分析第71-72页
   ·萝卜RsMTP1与其他植物CDF家族基因的氨基酸序列比对第72-74页
   ·萝卜MTP1蛋白序列的结构分析第74-75页
   ·RsMTP1的表达模式第75-76页
  3 讨论第76-77页
   ·CDF家族的结构特征第76页
   ·Cd胁迫对MTP1基因表达影响第76-77页
 第六章 利用DDRT技术分离萝卜镉胁迫相关基因第77-89页
  1 材料和方法第78-80页
   ·植物材料和胁迫处理第78页
   ·总RNA的提取第78页
   ·cDNA第一条链的合成和DDRT-PCR第78页
   ·PCR产物的聚丙烯酰胺电泳展示第78-79页
   ·差异cDNA的二次扩增与克隆、测序第79页
   ·差异片段的RT-PCR表达分析第79-80页
  2 结果与分析第80-86页
   ·萝卜总RNA的提取第80页
   ·萝卜镉响应mRNA差异显示分析第80页
   ·差异表达基因片段的再扩增第80-82页
   ·萝卜Cd响应基因片段的DDRT分析第82-84页
   ·响应镉胁迫的差异表达基因片段的功能分类第84-85页
   ·差异片段的RT-PCR表达分析第85-86页
  3 讨论第86-89页
   ·mRNA差异显示技术的优缺点第86页
   ·差异表达片段在Cd胁迫下的功能第86-89页
全文结论第89-91页
参考文献第91-101页
发表论文情况第101-103页
致谢第103页

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