摘要 | 第3-7页 |
ABSTRACT | 第7-11页 |
文中常用缩写中英文对照表 | 第15-16页 |
前言 | 第16-20页 |
第一章 中国汉族人群精神分裂症全基因组关联研究 | 第20-37页 |
1 引言 | 第20-21页 |
2 材料与方法 | 第21-26页 |
2.1 研究对象 | 第21-22页 |
2.2 血样采集及DNA提取 | 第22-23页 |
2.3 全基因组分型及质控 | 第23页 |
2.4 中国汉族人群子结构分析 | 第23-24页 |
2.5 验证位点的选择和分型 | 第24页 |
2.6 统计学分析 | 第24页 |
2.7 未直接分型SNP的填补(imputation)及分析 | 第24-25页 |
2.8 全基因组显著相关位点的e QTLs分析 | 第25-26页 |
3 结果 | 第26-35页 |
3.1 中国汉族人群精神分裂症易感位点的研究结果 | 第26-30页 |
3.2 三个全基因组阳性SNP在欧洲人群里与精神分裂症的关联情况 | 第30-32页 |
3.3 e QTL的分析结果 | 第32-33页 |
3.4 中国汉族人群中的MHC等区域与精神分裂症的关联情况 | 第33-35页 |
4 讨论 | 第35-37页 |
第二章 MIR137等基因与精神分裂症在中国汉族人群中的关联分析 | 第37-48页 |
1 引言 | 第37-39页 |
2 材料与方法 | 第39-41页 |
2.1 研究对象 | 第39页 |
2.2 SNP的选择、分型及质控 | 第39-40页 |
2.3 统计学分析 | 第40-41页 |
3 结果 | 第41-46页 |
3.1 相关区域内BIOX GWAS数据里的阳性SNP总体情况 | 第41页 |
3.2 欧洲人群里的全基因组阳性位点在BIOX GWAS数据里的关联情况 | 第41-43页 |
3.3 MIR137的靶基因在BIOX GWAS数据里的关联情况 | 第43-44页 |
3.4 验证阶段结果及其与BIOX GWAS数据meta分析结果 | 第44-46页 |
4 讨论 | 第46-48页 |
第三章 中国汉族人群精神分裂症样本结合PGC2样本的META分析 | 第48-96页 |
1 引言 | 第48-49页 |
2 材料与方法 | 第49-54页 |
2.1 研究对象 | 第49-50页 |
2.2 中国全基因组数据的分型、质控及填补 | 第50-51页 |
2.3 验证阶段基因分型及质控 | 第51页 |
2.4 统计学和生物信息学分析 | 第51-52页 |
2.5 中国汉族全基因关联数据的连锁不平衡分值回归分析(LD score regression) | 第52页 |
2.6 eQTL 分析 | 第52-53页 |
2.7 药物靶基因富集分析 | 第53页 |
2.8 多基因评分分析(Polygenic scoring analysis) | 第53-54页 |
2.9 通路分析 | 第54页 |
3 结果 | 第54-92页 |
3.1 中国汉族人群全基因组分型数据的分析结果 | 第54-59页 |
3.2 中国汉族人群全基因组数据与PGC2全基因组数据的meta分析结果 | 第59-70页 |
3.3 中国汉族人群和欧洲人群共有的精神分裂症新易感位点 | 第70-75页 |
3.4 中国汉族人群单独分析发现的精神分裂症新易感位点 | 第75-80页 |
3.5 精神分裂症新易感位点的潜在生物学机制 | 第80-86页 |
3.6 精神分裂症风险基因与抗精神分裂症药物靶标间的相关性 | 第86-89页 |
3.7 精神分裂症相关的生物学通路和基因集合 | 第89-90页 |
3.8 多基因风险评分结果 | 第90-92页 |
4 讨论 | 第92-96页 |
第四章 中国汉族人群精神分裂症与全基因组拷贝数变异关联研究 | 第96-114页 |
1 引言 | 第96-97页 |
2 材料与方法 | 第97-99页 |
2.1 研究对象 | 第97页 |
2.2 全基因组数据的分型及质控 | 第97页 |
2.3 CNV的检出及质控 | 第97-98页 |
2.4 统计学分析 | 第98-99页 |
2.5 CNV的独立实验验证 | 第99页 |
3 结果 | 第99-111页 |
3.1 全基因组CNV谱分析结果 | 第99-100页 |
3.2 新的精神分裂症关联CNV区域 | 第100-103页 |
3.3 已报道精神分裂症关联CNV区域的验证 | 第103-111页 |
4 讨论 | 第111-114页 |
总结与展望 | 第114-118页 |
参考文献 | 第118-130页 |
致谢 | 第130-131页 |
攻读博士学位期间已发表或录用的论文 | 第131-136页 |