| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 红树蚬概述 | 第8页 |
| 1.2 PCBs概述 | 第8-10页 |
| 1.2.1 PCBs的毒理学特征 | 第9页 |
| 1.2.2 PCBs的生物富集作用 | 第9-10页 |
| 1.3 生物标志物概述 | 第10-11页 |
| 1.4 存在的问题及本文拟解决的问题 | 第11页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第11-13页 |
| 第二章 基于线粒体DNA序列探讨红树蚬在蚬科的分类地位 | 第13-25页 |
| 前言 | 第13页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第13-15页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第13-14页 |
| 2.1.2 实验主要药品与试剂 | 第14页 |
| 2.1.3 主要实验仪器 | 第14-15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-17页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第15-16页 |
| 2.2.2 引物的设计 | 第16页 |
| 2.2.3 目标基因片段的PCR扩增 | 第16页 |
| 2.2.4 电泳液的配制 | 第16页 |
| 2.2.5 PCR扩增产物的检测 | 第16-17页 |
| 2.2.6 数据的处理以及分析 | 第17页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第17-23页 |
| 2.3.1 PCR扩增结果与序列特征 | 第17-19页 |
| 2.3.2 种间遗传距离 | 第19页 |
| 2.3.3 分子系统分析 | 第19-23页 |
| 2.4 讨论 | 第23-25页 |
| 第三章 PCBs胁迫下红树蚬肝胰腺、鳃组织转录组测序 | 第25-37页 |
| 前言 | 第25页 |
| 3.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 3.2 建库测序流程 | 第26-28页 |
| 3.3 结果 | 第28-36页 |
| 3.4 讨论 | 第36-37页 |
| 第四章 多氯联苯胁迫下红树蚬荧光定量PCR内参基因的筛选 | 第37-48页 |
| 前言 | 第37页 |
| 4.1 实验材料与仪器 | 第37-39页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第37-38页 |
| 4.1.2 实验主要药品和试剂 | 第38页 |
| 4.1.3 主要实验仪器 | 第38-39页 |
| 4.2 实验方法 | 第39-42页 |
| 4.2.1 实验动物的胁迫处理 | 第39页 |
| 4.2.2 总RNA的提取 | 第39-40页 |
| 4.2.3 RNA质量的鉴定 | 第40页 |
| 4.2.4 cDNA第一链的合成 | 第40-41页 |
| 4.2.5 引物的设计、合成 | 第41页 |
| 4.2.6 各内参基因目的片段的普通PCR扩增 | 第41-42页 |
| 4.2.7 荧光定量PCR和标准曲线分析 | 第42页 |
| 4.2.8 数据分析 | 第42页 |
| 4.3 结果与分析 | 第42-47页 |
| 4.3.1 总RNA提取质量检测 | 第42-43页 |
| 4.3.2 各内参基因目的片段的普通PCR扩增产物分析 | 第43页 |
| 4.3.3 各候选内参基因qRT-PCR分析 | 第43-45页 |
| 4.3.4 内参基因的选择 | 第45-47页 |
| 4.4 讨论 | 第47-48页 |
| 第五章 红树蚬在多氯联苯(PCBs)胁迫下差异表达基因的Q-PCR验证 | 第48-65页 |
| 前言 | 第48-49页 |
| 5.1 实验材料与仪器 | 第49-50页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第49页 |
| 5.1.2 实验主要药品和试剂 | 第49页 |
| 5.1.3 主要实验仪器 | 第49-50页 |
| 5.2 实验方法 | 第50-53页 |
| 5.2.1 实验动物的胁迫处理 | 第50页 |
| 5.2.2 总RNA的提取 | 第50页 |
| 5.2.3 RNA质量的鉴定 | 第50页 |
| 5.2.4 cDNA第一链的合成 | 第50页 |
| 5.2.5 引物的设计、合成 | 第50-51页 |
| 5.2.6 目的基因片段的聚合酶链式反应 | 第51页 |
| 5.2.7 PCR产物的胶回收、载体连接以及转化大肠杆菌 | 第51-52页 |
| 5.2.8 标准曲线的制作以及目的基因的荧光定量PCR分析 | 第52-53页 |
| 5.2.9 数据的处理 | 第53页 |
| 5.3 结果与分析 | 第53-63页 |
| 5.3.1 各目的基因的普通PCR扩增产物电泳图 | 第53-54页 |
| 5.3.2 各上调基因片段的blastx同源比对结果 | 第54-59页 |
| 5.3.3 各目的基因Q-PCR扩增效果检测 | 第59-62页 |
| 5.3.4 PCBs胁迫下各目的基因mRNA表达差异结果 | 第62-63页 |
| 5.4 讨论 | 第63-65页 |
| 第六章 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| 研究生期间所发表的论文 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
