基于RNA二级结构的玉米IncRNA识别算法研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第9-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第9-10页 |
| 1.2 研究意义 | 第10页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第10-13页 |
| 1.4 论文整体结构 | 第13-14页 |
| 第2章 lncRNA相关研究 | 第14-21页 |
| 2.1 lncRNA形成方式 | 第14-16页 |
| 2.2 lncRNA分类与作用机制 | 第16-18页 |
| 2.3 lncRNA结构分类与比较算法研究 | 第18-20页 |
| 2.4 本章小结 | 第20-21页 |
| 第3章 玉米lncRNA二级结构特征识别 | 第21-35页 |
| 3.1 RNA二级结构及表示方法 | 第21-26页 |
| 3.2 RNA二级结构预测算法 | 第26-29页 |
| 3.3 lncRNA二级结构预测算法 | 第29-31页 |
| 3.4 玉米lncRNA结构特征识别 | 第31-34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第4章 玉米lncRNA识别建模 | 第35-52页 |
| 4.1 lncRNA识别模型总体设计 | 第35-36页 |
| 4.2 lncRNA序列特征和结构特征 | 第36-37页 |
| 4.3 长链非编码RNA识别算法 | 第37-49页 |
| 4.3.1 环境搭建与数据收集 | 第37-38页 |
| 4.3.2 基于序列长度和CPC的筛选 | 第38页 |
| 4.3.3 基于开放阅读框的序列筛选 | 第38-41页 |
| 4.3.4 基于与已知蛋白同源性的筛选 | 第41-42页 |
| 4.3.5 基于和小RNA序列比对的筛选 | 第42-48页 |
| 4.3.6 基于二级结构特征的筛选 | 第48-49页 |
| 4.4 结果验证及分析 | 第49-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 第5章 总结与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
