| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-27页 |
| 1.1 miRNA的发现和筛选鉴定 | 第14-19页 |
| 1.1.1 miRNA的发现及鉴定分析 | 第14-17页 |
| 1.1.2 miRNA的生物信息学预测及分析 | 第17-19页 |
| 1.2 miRNA的调控作用及研究方法 | 第19-23页 |
| 1.2.1 miRNA的加工及靶基因调控 | 第19-20页 |
| 1.2.2 miRNA调控正常生理过程 | 第20页 |
| 1.2.3 miRNA调控病理过程 | 第20-21页 |
| 1.2.4 miRNA的研究方法 | 第21-23页 |
| 1.3 抗病毒免疫及调控 | 第23-26页 |
| 1.3.1 RIG-I信号通路 | 第24-25页 |
| 1.3.2 RIG-I样病毒识别受体 | 第25页 |
| 1.3.3 miRNA的抗病毒免疫调控 | 第25-26页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第26-27页 |
| 第二章 鮸鱼小RNA文库及转录组分析 | 第27-36页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-29页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第27页 |
| 2.1.2 鮸鱼感染处理及样本采集 | 第27页 |
| 2.1.3 鮸鱼小RNA文库构建及测序 | 第27-28页 |
| 2.1.4 生物信息学分析 | 第28-29页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第29-34页 |
| 2.2.1 Illumina测序结果概述 | 第29-32页 |
| 2.2.2 小RNA分类注释 | 第32-33页 |
| 2.2.3 保守miRNA鉴定及novel miRNA预测 | 第33-34页 |
| 2.3 小结 | 第34-36页 |
| 第三章 差异表达miRNA筛选与功能分析 | 第36-48页 |
| 3.1 材料和方法 | 第36-39页 |
| 3.1.1 基于Illumina文库测序的miRNA差异表达分析 | 第36页 |
| 3.1.2 miRNA的实时荧光定量PCR | 第36-39页 |
| 3.1.3 miRNA的靶基因预测与功能分析 | 第39页 |
| 3.2 结果 | 第39-45页 |
| 3.2.1 Poly(I:C)感染后差异表达的miRNA筛选 | 第39-40页 |
| 3.2.2 实时荧光光定量PCR验证miRNA的表达量 | 第40-41页 |
| 3.2.3 靶基因预测 | 第41-43页 |
| 3.2.4 靶基因与miRNA的表达量分析 | 第43-44页 |
| 3.2.5 miRNA调控RIG-I信号通路 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-47页 |
| 3.4 小结 | 第47-48页 |
| 第四章 差异表达miR-145 靶基因验证与功能分析 | 第48-65页 |
| 4.1 材料和方法 | 第48-55页 |
| 4.1.1 鮸鱼感染实验 | 第48页 |
| 4.1.2 miR-145 特征序列比对及进化树 | 第48页 |
| 4.1.3 miR-145 的发卡结构及启动子预测 | 第48-49页 |
| 4.1.4 miR-145 靶基因预测 | 第49页 |
| 4.1.5 质粒构建与转染 | 第49-54页 |
| 4.1.6 双荧光素酶报告基因分析 | 第54页 |
| 4.1.7 实时荧光定量PCR分析 | 第54-55页 |
| 4.2 结果 | 第55-63页 |
| 4.2.1 miR-145 的特征分析 | 第55-56页 |
| 4.2.2 miR-145 靶基因预测 | 第56-57页 |
| 4.2.3 miR-145 与鮸鱼MDA53'UTR双荧光素酶报告基因分析 | 第57-60页 |
| 4.2.4 miR1455p与鮸鱼MDA5表达量分析 | 第60-61页 |
| 4.2.5 miR1455p调控RIG-I信号通路 | 第61-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-64页 |
| 4.4 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第72页 |
