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番茄(亨氏1706)富含亮氨酸重复序列类受体蛋白激酶基因家族生物信息学与表达分析

摘要第4-5页
abstract第5页
第一章 文献综述第9-18页
    1.1 PlRLK的结构、分类与功能第9-11页
        1.1.1 PlRLK的结构第9-10页
        1.1.2 PlRLK的分类第10-11页
        1.1.3 PlRLK的功能第11页
    1.2 PlLRR- RLK结构与功能第11-12页
        1.2.1 PlLRR-RLK结构第11页
        1.2.2 PlLRR-RLK功能第11-12页
    1.3 国内外关于拟南芥、水稻和杨树的LRR-RLK基因家族研究现状第12-14页
    1.4 模式植物概述第14-16页
        1.4.1 模式植物第14-15页
        1.4.2 拟南芥第15-16页
        1.4.3 番茄第16页
    1.5 本文研究的目的与意义第16-17页
    1.6 本课题研究的实验过程第17-18页
第二章 番茄LRR-RLK基因家族生物信息学分析第18-31页
    2.1 SlLRR-RLK基因家族的检索第18-20页
        2.1.1 拟南芥、杨树、水稻已知LRR-RLK基因家族的检索第18-19页
        2.1.2 SlLRR-RLK基因家族的检索第19页
        2.1.3 SlLRR-RLK基因家族的筛选第19页
        2.1.4 SlLRR-RLK基因家族的确定第19-20页
    2.2 SlLRR-RLK基因信息的检索第20-21页
        2.2.1 SlLRR-RLK基因基本信息的检索第20页
        2.2.2 SlLRR-RLK基因信号肽的检索第20-21页
        2.2.3 SlLRR-RLK基因跨膜区的检索与分析第21页
        2.2.4 SlLRR-RLK基因等电点、分子量的检索第21页
    2.3 SlLRR-RLK基因家族系统发生进化树构建第21-23页
        2.3.1 SlLRR-RLK基因蛋白序列的多重比对第21-22页
        2.3.2 SlLRR-RLK基因家族系统发生进化树的分类与构建第22-23页
    2.4 结果与讨论第23-31页
        2.4.1 SlLRR-RLK基因的分析第23-25页
        2.4.2 SlLRR-RLK基因的基本信息与进化分析第25-31页
第三章 SlLRR-RLK基因家族基因结构的预测与分析第31-46页
    3.1 SlLRR-RLK基因内含子/外显子结构分析的原理及步骤第31页
    3.2 SlLRR-RLK基因家族保守域Motif分析的原理及步骤第31-33页
    3.3 结果与讨论第33-46页
        3.3.1 SlLRR-RLK基因内含子/外显子结构分析第33-35页
        3.3.2 SlLRR-RLK基因家族LRR Motif分析第35-40页
        3.3.3 SlLRR-RLK基因家族RLK Motif分析第40-46页
第四章 SlLRR-RLK基因家族染色体定位与串联重复第46-53页
    4.1 SlLRR-RLK基因家族染色体定位原理与步骤第46页
    4.2 SlLRR-RLK基因家族串联重复的原理与步骤第46-47页
    4.3 结果与分析第47-53页
        4.3.1 SlLRR-RLK基因家族染色体定位分析第47-48页
        4.3.2 SlLRR-RLK基因家族基因簇分析第48-51页
        4.3.3 SlLRR-RLK基因家族串联重复分析第51-53页
第五章 SlLRR-RLK基因家族组织特异性表达分析第53-76页
    5.1 SlLRR-RLK基因家族高通量表达数据的获取和处理方法第53-54页
        5.1.1 基因家族高通量表达数据的获取第53-54页
        5.1.2 基因家族高通量表达数据的处理方法第54页
    5.2 基因家族组织特异性表达分析第54-55页
    5.3 基因实时定量PCR第55-63页
        5.3.1 实验材料第55页
        5.3.2 实验仪器耗材第55页
        5.3.3 实验试剂第55-56页
        5.3.4 实验方法第56-63页
    5.4 结果与讨论第63-76页
        5.4.1 基因家族组织特异性表达分析第63-66页
        5.4.2 番茄各组织总RNA提取与c DNA合成分析第66-68页
        5.4.3 番茄组织特异性基因实时荧光定量PCR分析第68-76页
第六章 结论与展望第76-80页
    6.1 结论第76-78页
    6.2 展望第78-80页
参考文献第80-87页
发表论文和参加科研情况说明第87-88页
致谢第88-89页

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