| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-26页 |
| 1 课题的提出 | 第12-14页 |
| 2 植物缺硼研究进展 | 第14-21页 |
| 2.1 硼在植物中的生物学功能 | 第14-15页 |
| 2.2 植物对硼元素的吸收、转运、再分配和利用 | 第15-18页 |
| 2.2.1 硼元素的吸收 | 第16-17页 |
| 2.2.2 硼元素的转运及再分配 | 第17-18页 |
| 2.2.3 硼元素的利用 | 第18页 |
| 2.3 植物的缺硼响应 | 第18-21页 |
| 2.3.1 细胞壁、细胞膜及细胞骨架的亚细胞变化 | 第18-19页 |
| 2.3.2 降低植物的水循环过程 | 第19-20页 |
| 2.3.3 影响酚类和木质素代谢 | 第20-21页 |
| 2.3.4 植物的缺硼信号转导假说 | 第21页 |
| 3 组学技术及其在柑橘类植物中的应用 | 第21-24页 |
| 3.1 离子组学 | 第21-22页 |
| 3.2 转录组学 | 第22-23页 |
| 3.3 蛋白质组学 | 第23-24页 |
| 4 本研究的目的、内容和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 缺硼纽荷尔脐橙叶脉木栓化发生机制研究 | 第26-77页 |
| 1 前言 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-34页 |
| 2.1 植物材料与培养方法 | 第27页 |
| 2.2 试验设计和采样 | 第27-28页 |
| 2.3 试验测定方法 | 第28-34页 |
| 2.3.1 扫描电镜观察及指标统计分析 | 第28页 |
| 2.3.2 离子组测定 | 第28页 |
| 2.3.3 纤维素和木质素含量测定 | 第28-29页 |
| 2.3.4 质构仪检测 | 第29页 |
| 2.3.5 RNA抽提 | 第29页 |
| 2.3.6 基因数字表达谱 | 第29-31页 |
| 2.3.7 小RNA测序 | 第31-33页 |
| 2.3.8 差异表达的基因和miRNA关联分析 | 第33页 |
| 2.3.9 实时定量PCR分析 | 第33-34页 |
| 2.4 统计分析 | 第34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-70页 |
| 3.1 缺硼胁迫下的纽荷尔脐橙表型 | 第34-37页 |
| 3.2 叶脉木栓化发育动态和电镜观察 | 第37-38页 |
| 3.3 主脉横切面各组织宽度、细胞层数和细胞密度统计 | 第38-40页 |
| 3.4 叶片离子组分析 | 第40-41页 |
| 3.5 叶脉纤维素和木质素检测 | 第41页 |
| 3.6 叶片拉伸力和穿刺力检测 | 第41-42页 |
| 3.7 叶脉基因数字表达谱 | 第42-52页 |
| 3.7.1 测序质量评估 | 第42-45页 |
| 3.7.2 差异表达基因筛选 | 第45-46页 |
| 3.7.3 差异表达基因的聚类分析及功能注释 | 第46-50页 |
| 3.7.4 差异表达基因的实时定量PCR验证 | 第50-52页 |
| 3.8 叶脉小RNA测序 | 第52-66页 |
| 3.8.1 小RNA类别鉴定及长度分布 | 第52-54页 |
| 3.8.2 Known miRNA鉴定 | 第54-59页 |
| 3.8.3 Novel miRNA鉴定 | 第59-61页 |
| 3.8.4 差异表达miRNA鉴定 | 第61-64页 |
| 3.8.5 差异表达miRNA的实时定量PCR验证 | 第64-66页 |
| 3.9 差异表达的基因和miRNA关联分析 | 第66-70页 |
| 3.9.1 差异表达miRNA靶基因预测及其与差异表达基因的数据关联 | 第66-68页 |
| 3.9.2 csi-miRNA156b和csi-miR164 及其靶基因的实时定量PCR检测 | 第68-70页 |
| 4 讨论 | 第70-77页 |
| 4.1 叶脉木栓化发育涉及的生物学过程 | 第70-71页 |
| 4.2 叶面木栓化不对称发生的原因 | 第71-72页 |
| 4.3 可能参与木栓化症状发生的miRNA及其靶基因 | 第72-74页 |
| 4.4 可能参与维管细胞增生与组织发育的基因 | 第74-76页 |
| 4.5 木质素增加的证据及其与木栓化症状的关系 | 第76-77页 |
| 第三章 枳根系缺硼的快速应答初探 | 第77-99页 |
| 1 前言 | 第77-78页 |
| 2 材料与方法 | 第78-81页 |
| 2.1 植物材料与培养方法 | 第78页 |
| 2.2 试验设计和采样 | 第78-79页 |
| 2.3 试验测定方法 | 第79-81页 |
| 2.3.1 无损伤微测Ca~(2+)检测 | 第79页 |
| 2.3.2 蛋白质抽提 | 第79-80页 |
| 2.3.3 蛋白质组及磷酸化蛋白质组分析 | 第80-81页 |
| 2.4 统计分析 | 第81页 |
| 3 结果与分析 | 第81-96页 |
| 3.1 根尖Ca~(2+)流的无损伤检测 | 第81-83页 |
| 3.2 蛋白质浓度检测与SDS-PAGE电泳 | 第83-84页 |
| 3.3 定量蛋白质组学 | 第84-89页 |
| 3.3.1 蛋白质鉴定及差异表达蛋白质筛选 | 第84-85页 |
| 3.3.2 差异表达蛋白聚类分析 | 第85-86页 |
| 3.3.3 差异表达蛋白功能注释 | 第86-89页 |
| 3.4 磷酸化蛋白质组学 | 第89-96页 |
| 3.4.1 磷酸化肽段鉴定及磷酸化位点统计 | 第89-90页 |
| 3.4.2 枳根系磷酸化肽段的模体分析 | 第90-92页 |
| 3.4.3 差异表达磷酸化肽段筛选 | 第92-94页 |
| 3.4.4 差异表达磷酸化蛋白的聚类分析和功能注释 | 第94-96页 |
| 4 讨论 | 第96-99页 |
| 4.1 枳根系缺硼早期Ca~(2+)信号变化及可能的下游蛋白变化 | 第96-97页 |
| 4.2 枳根系缺硼早期可能影响细胞增殖过程 | 第97-98页 |
| 4.3 枳根系缺硼早期可能影响蛋白胞内转运与降解 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-124页 |
| 附录 | 第124-127页 |
| 附录I 课题资助项目 | 第124-125页 |
| 附录II 攻读博士学位期间发表的论文 | 第125-127页 |
| 致谢 | 第127-129页 |
