乳酸菌（Lactobacillus shenzhenensis LY-73~T）全基因组测序与应用分析
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第一章. 引言 | 第8-15页 |
| 1.1. 乳酸菌的生物学特征 | 第8页 |
| 1.2. 高通量测序技术的发展 | 第8-10页 |
| 1.3. 基因组学在乳酸菌研究应用中的作用 | 第10-11页 |
| 1.4. 乳酸菌基因组的国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.5. 研究内容及研究意义 | 第13-15页 |
| 第二章. 材料与方法 | 第15-31页 |
| 2.1. 样品来源 | 第15-16页 |
| 2.2. 进化与分类学分析方法 | 第16-17页 |
| 2.3. 生理生化特征分析 | 第17-18页 |
| 2.4. 基因组测序 | 第18-31页 |
| 2.4.1. 测序平台及测序策略 | 第18-20页 |
| 2.4.2. 构建测序文库 | 第20-25页 |
| 2.4.3. 数据处理方法 | 第25-31页 |
| 第三章. 分析与讨论 | 第31-53页 |
| 3.1. 进化与分类学分析 | 第31-32页 |
| 3.2. 生理生化特征分析 | 第32-34页 |
| 3.3. LY-73T全基因组测序分析 | 第34-46页 |
| 3.3.1. 数据产出以及数据质控 | 第34-35页 |
| 3.3.2. 基因组组装 | 第35-38页 |
| 3.3.3. 基因预测 | 第38-39页 |
| 3.3.4. 基因功能注释 | 第39-45页 |
| 3.3.5. 基因组序列提交 | 第45-46页 |
| 3.4. 应用分析 | 第46-53页 |
| 第四章. 结论与展望 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 答辩委员会对论文的评定意见 | 第62页 |
