| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 主要符号对照表 | 第8-9页 |
| 第1章 引言 | 第9-29页 |
| 1.1 表观遗传学 | 第9页 |
| 1.2 DNA甲基化的产生和维持 | 第9-11页 |
| 1.3 DNA甲基化的分布和功能 | 第11-14页 |
| 1.4 DNA甲基化的动态变化 | 第14-16页 |
| 1.5 DNA甲基化模式的调控 | 第16-24页 |
| 1.5.1 组蛋白修饰对DNA甲基化模式的调控 | 第16-22页 |
| 1.5.2 DNMT家族蛋白翻译后修饰对DNA甲基化活性的调控 | 第22-23页 |
| 1.5.3 其它的DNA甲基化调控机制 | 第23-24页 |
| 1.6 DNA甲基化异常与疾病的联系 | 第24-26页 |
| 1.7 研究目的和意义 | 第26-29页 |
| 1.7.1 研究现状 | 第26-27页 |
| 1.7.2 研究目的和意义 | 第27-29页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第29-54页 |
| 2.1 本章引论 | 第29页 |
| 2.2 实验材料和仪器 | 第29-32页 |
| 2.2.1 实验材料和试剂 | 第29-30页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第30-31页 |
| 2.2.3 常用试剂和缓冲液 | 第31-32页 |
| 2.3 实验方法和原理 | 第32-49页 |
| 2.3.1 基因的克隆 | 第33-34页 |
| 2.3.2 重组蛋白的表达和纯化 | 第34-37页 |
| 2.3.3 晶体的生长和优化 | 第37-40页 |
| 2.3.4 晶体结构解析 | 第40-45页 |
| 2.3.5 圆二色谱法检测蛋白的结构完整性 | 第45-46页 |
| 2.3.6 修饰组蛋白多肽阵列结合实验 | 第46-47页 |
| 2.3.7 多肽Pull-down实验 | 第47-48页 |
| 2.3.8 等温滴定量热法测定分子间相互作用 | 第48-49页 |
| 2.4 实验过程 | 第49-54页 |
| 2.4.1 DNMT3A识别结构域的克隆和表达 | 第49页 |
| 2.4.2 DNMT3A识别结构域的纯化 | 第49-50页 |
| 2.4.3 DNMT3A识别结构域和组蛋白修饰多肽的结合 | 第50-51页 |
| 2.4.4 DNMT3A识别结构域的结晶 | 第51页 |
| 2.4.5 组蛋白修饰对DNMT3A结合的影响 | 第51页 |
| 2.4.6 基于结构设计具有新的识别特异性的ADD结构域 | 第51-52页 |
| 2.4.7 体外验证改造后的ADD结构域的识别特异性 | 第52页 |
| 2.4.8 改造后的ADD结构域和其识别修饰多肽的复合物的晶体生长 | 第52页 |
| 2.4.9 改造后的Dnmt3a2全长基因的功能基因组学研究 | 第52-54页 |
| 第3章 DNMT3A组蛋白识别结构域的结构生物学研究 | 第54-70页 |
| 3.1 本章引论 | 第54页 |
| 3.2 实验结果和分析 | 第54-69页 |
| 3.2.1 DNMT3A识别结构域的表达和纯化 | 第54-57页 |
| 3.2.2 DNMT3A和组蛋白修饰多肽的结合 | 第57-59页 |
| 3.2.3 DNMT3A识别结构域的晶体生长和优化 | 第59-60页 |
| 3.2.4 DNMT3A识别结构域的结构解析 | 第60-66页 |
| 3.2.5 DNMT3A蛋白ADD结构域的结构分析 | 第66-69页 |
| 3.3 小结和讨论 | 第69-70页 |
| 第4章 DNMT3A-ADD结构域的改造及其生物学影响 | 第70-93页 |
| 4.1 本章引论 | 第70页 |
| 4.2 实验结果和分析 | 第70-91页 |
| 4.2.1 一些组蛋白修饰阻断DNMT3A和H3的结合 | 第70-73页 |
| 4.2.2 能识别H3K4me3和H3T3ph修饰的ADD结构域的分子改造 | 第73-74页 |
| 4.2.3 改造后的ADD结构域的识别特异性的验证 | 第74-80页 |
| 4.2.4 改造后的ADD结构域和其识别修饰多肽复合物的结构解析 | 第80-87页 |
| 4.2.5 改造后Dnmt3a2全长蛋白的功能基因组学研究 | 第87-91页 |
| 4.3 小结和讨论 | 第91-93页 |
| 第5章 讨论与展望 | 第93-100页 |
| 5.1 本文的主要研究成果总结 | 第93-94页 |
| 5.2 本研究的讨论和展望 | 第94-100页 |
| 参考文献 | 第100-109页 |
| 致谢 | 第109-111页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第111页 |
