基于概率图模型HMM的蛋白质二级结构预测
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9页 |
| 1.3 本文主要研究内容 | 第9-12页 |
| 第2章 蛋白质二级结构预测 | 第12-18页 |
| 2.1 蛋白质结构 | 第12-14页 |
| 2.1.1 蛋白质一级结构 | 第12页 |
| 2.1.2 蛋白质二级结构 | 第12-14页 |
| 2.1.3 蛋白质三级结构 | 第14页 |
| 2.1.4 蛋白质四级结构 | 第14页 |
| 2.2 蛋白质二级结构预测 | 第14-15页 |
| 2.3 蛋白质二级结构预测方法 | 第15页 |
| 2.4 蛋白质二级结构的预测准确率 | 第15-16页 |
| 2.5 本章小结 | 第16-18页 |
| 第3章 隐马尔可夫模型 | 第18-30页 |
| 3.1 马尔可夫模型 | 第18-19页 |
| 3.2 隐马尔可夫模型 | 第19-28页 |
| 3.2.1 隐马尔可夫模型的参数 | 第20-21页 |
| 3.2.2 隐马尔可夫模型的性质 | 第21-22页 |
| 3.2.3 隐马尔可夫模型的过程 | 第22页 |
| 3.2.4 隐马尔可夫模型的基本问题 | 第22-23页 |
| 3.2.5 隐马尔可夫模型的基本算法 | 第23-28页 |
| 3.3 隐马尔可夫模型的应用 | 第28-29页 |
| 3.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第4章 基于HMM的蛋白质二级结构预测 | 第30-40页 |
| 4.1 数据集 | 第30页 |
| 4.2 预测蛋白质二级结构的HMM | 第30-32页 |
| 4.2.1 3-状态HMM | 第31-32页 |
| 4.2.2 7-状态HMM | 第32页 |
| 4.3 HMM技术路线 | 第32-33页 |
| 4.4 参数训练 | 第33-35页 |
| 4.4.1 初始参数的选取 | 第33页 |
| 4.4.2 参数训练的下溢 | 第33-35页 |
| 4.5 算法实现 | 第35-37页 |
| 4.6 测试结果 | 第37页 |
| 4.7 算法改进 | 第37-38页 |
| 4.7.1 结构状态的改进 | 第37-38页 |
| 4.7.2 参数训练的改进 | 第38页 |
| 4.8 本章小结 | 第38-40页 |
| 结论 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的论文 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
