| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 氨基酸序列的特征提取 | 第10-11页 |
| 1.2.1 基于氨基酸位置和组成的特征提取方法 | 第10页 |
| 1.2.2 基于氨基酸物理化学性质的特征提取方法 | 第10-11页 |
| 1.2.3 其他特征提取方法 | 第11页 |
| 1.3 特征选择 | 第11-14页 |
| 1.3.1 过滤法 | 第11-12页 |
| 1.3.2 封装法 | 第12-13页 |
| 1.3.3 嵌入式方法 | 第13-14页 |
| 1.4 分类算法 | 第14-17页 |
| 1.4.1 朴素贝叶斯 | 第15-16页 |
| 1.4.2 K近邻分类器 | 第16页 |
| 1.4.3 支持向量机 | 第16-17页 |
| 1.5 本文主要研究内容及创新点 | 第17-18页 |
| 1.6 本文内容编排 | 第18-19页 |
| 第二章 冗余分摊特征选择与HIV-1型蛋白酶剪切位点预测 | 第19-31页 |
| 2.1 引言 | 第19-21页 |
| 2.2 数据与方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 数据集 | 第21页 |
| 2.2.2 序列表征 | 第21页 |
| 2.2.3 最小冗余最大相关 | 第21-22页 |
| 2.2.4 距离相关 | 第22-23页 |
| 2.2.5 冗余分摊特征选择 | 第23-24页 |
| 2.2.6 分类器与评价指标 | 第24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-27页 |
| 2.3.1 不同模型的预测表现 | 第24-26页 |
| 2.3.2 共有保留特征分析 | 第26-27页 |
| 2.4 讨论 | 第27-29页 |
| 2.4.1 最小冗余最大相关的局限 | 第27-28页 |
| 2.4.2 dCor-share的优缺点 | 第28-29页 |
| 2.5 结论 | 第29-31页 |
| 第三章 冗余分摊特征选择与层次分类用于膜蛋白分类研究 | 第31-42页 |
| 3.1 引言 | 第31-33页 |
| 3.2 数据与方法 | 第33-37页 |
| 3.2.1 数据集 | 第33-34页 |
| 3.2.2 地统计学关联特征提取 | 第34-35页 |
| 3.2.3 层次分类策略 | 第35-36页 |
| 3.2.4 冗余分摊特征选择 | 第36-37页 |
| 3.2.5 分类器与评价指标 | 第37页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第37-40页 |
| 3.3.1 参比分类模型 | 第37页 |
| 3.3.2 预测精度比较 | 第37-39页 |
| 3.3.3 特征分析 | 第39-40页 |
| 3.4 结论 | 第40-42页 |
| 第四章 总结与展望 | 第42-44页 |
| 4.1 全文总结 | 第42-43页 |
| 4.2 展望 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 作者简历 | 第54页 |